转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 11 / 135 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003790 Chr01 NC_080387.1:56284797-56284811promoter 内 345-359 bp - 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 56288453-56290831(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATTGAC
SmilChr01G004133 Chr01 NC_080387.1:59846963-59846977promoter 内 24-38 bp - 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 59842130-59843000(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGTTCCTTATCCTA
SmilChr01G003718 Chr01 NC_080387.1:55516624-55516638promoter 内 3095-3109 bp + 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 4 55517530-55519386(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAGCACCTTATCCAT
SmilChr02G001226 Chr02 NC_080388.1:22544016-22544030promoter 内 3231-3245 bp + 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 22542391-22543260(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCGGATAAGGTGGGT
SmilChr01G002664 Chr01 NC_080387.1:44877719-44877733promoter 内 2334-2348 bp + 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44872611-44876066(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGATTGGT
SmilChr01G003092 Chr01 NC_080387.1:49732974-49732988promoter 内 1888-1902 bp + 2099 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 49735087-49740054(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTTACCTTATCCTT
SmilChr03G002163 Chr03 NC_080389.1:33668746-33668760promoter 内 1251-1265 bp - 2736 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 33663530-33666010(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTTTCCTTATCCAA
SmilChr03G002331 Chr03 NC_080389.1:36774947-36774961promoter 内 844-858 bp - 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 36770655-36771804(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTTTCCTTATCCAA
SmilChr02G001357 Chr02 NC_080388.1:25349932-25349946promoter 内 730-744 bp + 3257 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 25353203-25354734(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTTTCCTTATCCAA
SmilChr01G005157 Chr01 NC_080387.1:69340477-69340491promoter 内 3961-3975 bp + 26 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 69340517-69346912(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CGCGACCTTATCCAA
SmilChr02G004028 Chr02 NC_080388.1:62558408-62558422promoter 内 3663-3677 bp - 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 62558746-62562572(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGGTATAA
SmilChr02G000973 Chr02 NC_080388.1:17017024-17017038promoter 内 3587-3601 bp + 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 17017438-17018094(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CACCTTCTTATCCTC
SmilChr02G002577 Chr02 NC_080388.1:44818333-44818347promoter 内 3430-3444 bp - 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 44818904-44820917(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGGATAAGGTCGAT
SmilChr02G002222 Chr02 NC_080388.1:39490422-39490436promoter 内 2652-2666 bp - 1335 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 39491771-39498915(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGGAGGCT
SmilChr03G000153 Chr03 NC_080389.1:1652614-1652628promoter 内 2520-2534 bp + 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 1654095-1654571(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTTACCTTATCCTT
SmilChr03G001662 Chr03 NC_080389.1:21554039-21554053promoter 内 2191-2205 bp + 1796 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 21549798-21552243(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAAGATAAGGATAAC
SmilChr01G004588 Chr01 NC_080387.1:63898073-63898087promoter 内 1922-1936 bp + 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 63894616-63896008(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGGATAAGATTAGA
SmilChr02G001053 Chr02 NC_080388.1:18778278-18778292promoter 内 1607-1621 bp - 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 18780672-18786763(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGTTAGC
SmilChr03G000900 Chr03 NC_080389.1:10293973-10293987promoter 内 1519-1533 bp - 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 10290789-10291505(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTTACCTTATCCTT
SmilChr02G003414 Chr02 NC_080388.1:55334650-55334664promoter 内 1504-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 55337147-55338223(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACTATCCTTATCTTA
SmilChr03G000844 Chr03 NC_080389.1:9635427-9635441promoter 内 1178-1192 bp - 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 9631854-9632618(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTTCCTTATCCAT
SmilChr03G001613 Chr03 NC_080389.1:20522027-20522041promoter 内 1011-1025 bp - 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 20525017-20526193(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGGTATTT
SmilChr02G002438 Chr02 NC_080388.1:42580920-42580934promoter 内 667-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 42584254-42587485(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTTACCTTATCCTT
SmilChr02G001052 Chr02 NC_080388.1:18778278-18778292promoter 内 370-384 bp - 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 18772030-18774661(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCTAACCTTATCATC
SmilChr01G005769 Chr01 NC_080387.1:73765179-73765193promoter 内 199-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 73768981-73771115(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGAAGAT
SmilChr02G003007 Chr02 NC_080388.1:50703939-50703953promoter 内 3756-3770 bp - 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 50704184-50705021(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGATTGGT
SmilChr01G002881 Chr01 NC_080387.1:47434808-47434822promoter 内 3691-3705 bp - 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 47431042-47434512(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTAACCTTATCATC
SmilChr02G004150 Chr02 NC_080388.1:63823462-63823476promoter 内 3470-3484 bp + 517 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 63816830-63822945(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGGAAATT
SmilChr01G001539 Chr01 NC_080387.1:29401730-29401744promoter 内 3275-3289 bp - 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 29399128-29401018(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTTCCTTATCCTT
SmilChr01G004739 Chr01 NC_080387.1:65582151-65582165promoter 内 2628-2642 bp - 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 65583524-65588628(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGATGTG
SmilChr03G001895 Chr03 NC_080389.1:26457979-26457993promoter 内 2617-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 26459363-26460371(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATAGCCTTATCCAA
SmilChr02G001294 Chr02 NC_080388.1:23883889-23883903promoter 内 2512-2526 bp + 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 23881556-23882414(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGGAGGCT
SmilChr02G001681 Chr02 NC_080388.1:31049255-31049269promoter 内 2494-2508 bp - 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 31050762-31051106(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGATGTTG
SmilChr01G003778 Chr01 NC_080387.1:56179794-56179808promoter 内 2306-2320 bp + 1681 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56177508-56178113(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGGCAATG
SmilChr01G001570 Chr01 NC_080387.1:29718002-29718016promoter 内 2101-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 29715007-29716116(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTTCCTTATCCTT
SmilChr01G003719 Chr01 NC_080387.1:55516624-55516638promoter 内 1097-1111 bp + 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 55519528-55523997(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAGCACCTTATCCAT
SmilChr03G001611 Chr03 NC_080389.1:20522027-20522041promoter 内 1005-1019 bp - 2982 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 20517963-20519045(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAATACCTTATCCTA
SmilChr02G002194 Chr02 NC_080388.1:39162140-39162154promoter 内 873-887 bp + 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 39158517-39159026(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGGCAATG
SmilChr02G004152 Chr02 NC_080388.1:63823462-63823476promoter 内 541-555 bp + 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 63826922-63832961(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTTCCTTATCCTT
SmilChr02G003227 Chr02 NC_080388.1:53530408-53530422promoter 内 225-239 bp + 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 53534184-53541115(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TACCACCTTATCCAT
SmilChr01G005770 Chr01 NC_080387.1:73770916-73770930promoter 内 45-59 bp - 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 73774872-73777998(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGAAGAT
SmilChr02G001786 Chr02 NC_080388.1:32631925-32631939promoter 内 18-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 32635908-32639947(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGGAGAAT
SmilChr01G003282 Chr01 NC_080387.1:51514007-51514021promoter 内 3053-3067 bp + 934 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 6 51514955-51522867(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATAAATCTTATCCTA
SmilChr01G004451 Chr01 NC_080387.1:62634852-62634866promoter 内 2871-2885 bp + 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 5 62629453-62633736(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGATTTAT
SmilChr03G000029 Chr03 NC_080389.1:375047-375061promoter 内 3773-3787 bp - 214 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 375275-377717(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGTCATC
SmilChr02G001460 Chr02 NC_080388.1:27301558-27301572promoter 内 3711-3725 bp - 276 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 27299186-27301282(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCATTCCTTATCCCC
SmilChr01G005201 Chr01 NC_080387.1:69689195-69689209promoter 内 1454-1468 bp + 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 69691742-69692321(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATACACCTTATCCTT
SmilChr01G004807 Chr01 NC_080387.1:66263951-66263965promoter 内 1355-1369 bp - 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 66266597-66270367(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGTCATC
SmilChr03G002272 Chr03 NC_080389.1:35865740-35865754promoter 内 3305-3319 bp - 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 35866436-35868613(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGGTGTAT
SmilChr01G001580 Chr01 NC_080387.1:29816033-29816047promoter 内 3282-3296 bp + 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 29813831-29815328(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGATTTAT