转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 110 / 136 下载 TSV

上一页 110 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000452 Chr06 NC_080392.1:3666716-3666726promoter 内 545-555 bp - 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 3670172-3671726(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr05G003544 Chr05 NC_080391.1:47309550-47309560promoter 内 543-553 bp - 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 47304473-47306102(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr02G005455 Chr02 NC_080388.1:74875644-74875654promoter 内 523-533 bp - 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 74879122-74883586(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAACT
SmilChr03G002489 Chr03 NC_080389.1:39577261-39577271promoter 内 517-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 39571282-39573787(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr04G001924 Chr04 NC_080390.1:31347445-31347455promoter 内 397-407 bp - 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 31343198-31343851(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTA
SmilChr05G001698 Chr05 NC_080391.1:16190440-16190450promoter 内 381-391 bp + 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 16194060-16196659(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGCCAGCGCG
SmilChr01G001173 Chr01 NC_080387.1:23784845-23784855promoter 内 367-377 bp + 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 23788479-23792190(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAC
SmilChr02G000806 Chr02 NC_080388.1:13445747-13445757promoter 内 335-345 bp + 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 13449413-13452449(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAC
SmilChr08G002807 Chr08 NC_080394.1:27918634-27918644promoter 内 307-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 27909518-27914950(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTT
SmilChr08G001461 Chr08 NC_080394.1:11764894-11764904promoter 内 298-308 bp + 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 11768597-11771797(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr08G000544 Chr08 NC_080394.1:3961746-3961756promoter 内 245-255 bp + 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 3965502-3967070(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr04G002445 Chr04 NC_080390.1:39167576-39167586promoter 内 216-226 bp - 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 39160593-39163801(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr04G001936 Chr04 NC_080390.1:31485691-31485701promoter 内 209-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 31479525-31481909(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr08G001784 Chr08 NC_080394.1:15035123-15035133promoter 内 204-214 bp + 3787 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 15038920-15041782(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTA
SmilChr08G001663 Chr08 NC_080394.1:13853680-13853690promoter 内 192-202 bp + 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 13857489-13864115(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTA
SmilChr02G003468 Chr02 NC_080388.1:55979279-55979289promoter 内 184-194 bp - 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 55983096-55985779(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAACT
SmilChr01G003158 Chr01 NC_080387.1:50420951-50420961promoter 内 139-149 bp + 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 50414386-50417099(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTT
SmilChr02G000784 Chr02 NC_080388.1:12889517-12889527promoter 内 112-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 12884119-12885638(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr03G003760 Chr03 NC_080389.1:56723633-56723643promoter 内 35-45 bp + 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 56727599-56729690(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr01G001489 Chr01 NC_080387.1:28666928-28666938promoter 内 8-18 bp - 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 28670921-28673589(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTT
SmilChr02G002096 Chr02 NC_080388.1:37613553-37613563promoter 内 3974-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 37613580-37615449(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGGC
SmilChr08G000944 Chr08 NC_080394.1:7028398-7028408promoter 内 3824-3834 bp + 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 7027430-7028231(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGGC
SmilChr03G004360 Chr03 NC_080389.1:61840755-61840765promoter 内 3741-3751 bp + 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 61841015-61841767(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GATTCAGCGCC
SmilChr07G002615 Chr07 NC_080393.1:25246364-25246374promoter 内 3987-3997 bp + 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 25246378-25254004(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGA
SmilChr05G001583 Chr05 NC_080391.1:14535642-14535652promoter 内 3769-3779 bp - 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 14535874-14536335(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAATC
SmilChr01G000036 Chr01 NC_080387.1:584031-584041promoter 内 3703-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 582624-583743(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GATTCAGCGCC
SmilChr07G000239 Chr07 NC_080393.1:1542097-1542107promoter 内 3383-3393 bp - 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1538299-1541489(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAA
SmilChr07G000195 Chr07 NC_080393.1:1230591-1230601promoter 内 3168-3178 bp - 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1228404-1229768(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAA
SmilChr07G000638 Chr07 NC_080393.1:4299863-4299873promoter 内 3071-3081 bp + 920 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 4300793-4302837(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAA
SmilChr03G004315 Chr03 NC_080389.1:61518568-61518578promoter 内 2998-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 61508826-61517575(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GATTCAGCGCC
SmilChr02G002414 Chr02 NC_080388.1:42119095-42119105promoter 内 2934-2944 bp - 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 42113950-42118038(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGA
SmilChr01G005652 Chr01 NC_080387.1:72893912-72893922promoter 内 2916-2926 bp - 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 72892765-72892837(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GATTCAGCGCC
SmilChr03G003165 Chr03 NC_080389.1:49020033-49020043promoter 内 2889-2899 bp + 1102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 49021145-49022470(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GATTCAGCGCC
SmilChr07G004553 Chr07 NC_080393.1:58260677-58260687promoter 内 2861-2871 bp - 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 58261817-58266994(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAATC
SmilChr06G003224 Chr06 NC_080392.1:44996179-44996189promoter 内 2806-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 44997374-44998927(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAA
SmilChr04G003091 Chr04 NC_080390.1:47545838-47545848promoter 内 2747-2757 bp - 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 47547092-47548584(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGAC
SmilChr03G003164 Chr03 NC_080389.1:49020033-49020043promoter 内 2513-2523 bp + 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 49015364-49018555(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAATC
SmilChr05G003002 Chr05 NC_080391.1:37161332-37161342promoter 内 2439-2449 bp + 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 37162894-37166439(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GATTCAGCGCC
SmilChr06G002956 Chr06 NC_080392.1:42366954-42366964promoter 内 2414-2424 bp - 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 42364787-42365377(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAA
SmilChr07G003871 Chr07 NC_080393.1:48189643-48189653promoter 内 2376-2386 bp + 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 48191268-48192629(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGTCAGCGCA
SmilChr03G001711 Chr03 NC_080389.1:22895577-22895587promoter 内 2199-2209 bp + 1792 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 22897379-22900731(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGTCAGCGCA
SmilChr03G002208 Chr03 NC_080389.1:34779907-34779917promoter 内 2186-2196 bp + 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 34776289-34778102(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGGC
SmilChr03G003567 Chr03 NC_080389.1:54324678-54324688promoter 内 2184-2194 bp + 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54326495-54328615(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGTCAGCGCA
SmilChr06G001534 Chr06 NC_080392.1:16566671-16566681promoter 内 2134-2144 bp + 1857 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 16561197-16564814(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGACGT
SmilChr03G000319 Chr03 NC_080389.1:3645336-3645346promoter 内 1885-1895 bp + 2106 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 3647452-3647530(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GATTCAGCGCC
SmilChr01G001530 Chr01 NC_080387.1:29294656-29294666promoter 内 1708-1718 bp + 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 29290857-29292373(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGACGT
SmilChr07G000490 Chr07 NC_080393.1:3424941-3424951promoter 内 1595-1605 bp + 2396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 3419519-3422545(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGGC
SmilChr07G000267 Chr07 NC_080393.1:1723030-1723040promoter 内 1591-1601 bp + 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1725440-1728517(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAA
SmilChr06G000964 Chr06 NC_080392.1:9336985-9336995promoter 内 1584-1594 bp + 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 9331789-9334578(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAATC
SmilChr08G001882 Chr08 NC_080394.1:16340546-16340556promoter 内 1576-1586 bp - 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 16342971-16343671(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGGC