转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 115 / 139 下载 TSV

上一页 115 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001408 Chr01 NC_080387.1:27679424-27679435promoter 内 877-888 bp + 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 27673850-27676311(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr05G000081 Chr05 NC_080391.1:443725-443736promoter 内 841-852 bp - 3149 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 439459-440576(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G001662 Chr01 NC_080387.1:30720869-30720880promoter 内 802-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 30713131-30717681(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr02G000619 Chr02 NC_080388.1:9065125-9065136promoter 内 796-807 bp - 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9068330-9069128(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCACGTCAACC
SmilChr01G002777 Chr01 NC_080387.1:46212914-46212925promoter 内 740-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 46205267-46209664(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGAG
SmilChr03G002001 Chr03 NC_080389.1:29775372-29775383promoter 内 730-741 bp + 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 29770411-29772112(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr04G004007 Chr04 NC_080390.1:55404813-55404824promoter 内 675-686 bp - 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55408139-55409734(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCAACC
SmilChr02G000942 Chr02 NC_080388.1:16440924-16440935promoter 内 576-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16444349-16445508(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G004421 Chr01 NC_080387.1:62332148-62332159promoter 内 548-559 bp + 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62326690-62328706(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCACTG
SmilChr02G001795 Chr02 NC_080388.1:32718445-32718456promoter 内 454-465 bp - 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 32721992-32722846(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr02G001836 Chr02 NC_080388.1:33442566-33442577promoter 内 361-372 bp + 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 33437364-33438937(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCACTC
SmilChr02G004544 Chr02 NC_080388.1:68005547-68005558promoter 内 329-340 bp + 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 67993430-68001886(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr01G000686 Chr01 NC_080387.1:15338581-15338592promoter 内 186-197 bp + 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 15332719-15334777(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr01G005922 Chr01 NC_080387.1:75042760-75042771promoter 内 134-145 bp + 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 75037416-75038904(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCACGT
SmilChr03G002042 Chr03 NC_080389.1:30902284-30902295promoter 内 2657-2668 bp + 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 3 30897992-30900951(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAACC
SmilChr03G002045 Chr03 NC_080389.1:30965522-30965533promoter 内 2387-2398 bp + 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 3 30960883-30963919(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAACC
SmilChr01G002448 Chr01 NC_080387.1:42070383-42070394promoter 内 3501-3512 bp + 489 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 42070883-42073649(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGCA
SmilChr02G001509 Chr02 NC_080388.1:28108015-28108026promoter 内 3217-3228 bp - 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 28108799-28112251(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAACG
SmilChr04G001205 Chr04 NC_080390.1:18636636-18636647promoter 内 1939-1950 bp + 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 18638698-18649252(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGCT
SmilChr02G005107 Chr02 NC_080388.1:72586341-72586352promoter 内 1815-1826 bp + 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 72588527-72590966(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGAGGA
SmilChr05G000025 Chr05 NC_080391.1:126000-126011promoter 内 600-611 bp + 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 129401-132645(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGAGGT
SmilChr04G002829 Chr04 NC_080390.1:44401222-44401233promoter 内 14-25 bp + 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 44388518-44397246(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCATCT
SmilChr04G000436 Chr04 NC_080390.1:4622658-4622669promoter 内 3903-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4619364-4622571(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCATCG
SmilChr03G003989 Chr03 NC_080389.1:58917239-58917250promoter 内 3893-3904 bp + 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 58911799-58917142(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGCCGC
SmilChr04G002135 Chr04 NC_080390.1:34337311-34337322promoter 内 3879-3890 bp + 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 34337433-34340075(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGCA
SmilChr04G000652 Chr04 NC_080390.1:7365420-7365431promoter 内 3866-3877 bp + 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 7363294-7365296(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCATCT
SmilChr03G001687 Chr03 NC_080389.1:22283098-22283109promoter 内 3863-3874 bp + 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 22282306-22282971(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTCGTCAGCG
SmilChr01G002181 Chr01 NC_080387.1:37947226-37947237promoter 内 3826-3837 bp + 164 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 37944382-37947062(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGCCGG
SmilChr02G005597 Chr02 NC_080388.1:75706171-75706182promoter 内 3683-3694 bp + 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 75706489-75708908(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGCA
SmilChr04G003576 Chr04 NC_080390.1:52170227-52170238promoter 内 3566-3577 bp - 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 52165337-52169803(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGCA
SmilChr02G005283 Chr02 NC_080388.1:73868736-73868747promoter 内 3347-3358 bp - 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 73866389-73868093(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGAGGG
SmilChr02G000166 Chr02 NC_080388.1:2136047-2136058promoter 内 3257-3268 bp + 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 2136791-2137216(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTTGACGTGCT
SmilChr01G005207 Chr01 NC_080387.1:69725297-69725308promoter 内 3218-3229 bp - 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69723859-69724525(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGCG
SmilChr02G002628 Chr02 NC_080388.1:45638824-45638835promoter 内 3185-3196 bp - 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 45635359-45638019(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGCT
SmilChr02G004177 Chr02 NC_080388.1:64062790-64062801promoter 内 3116-3127 bp + 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 64059365-64061916(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCT
SmilChr02G001507 Chr02 NC_080388.1:28094208-28094219promoter 内 3037-3048 bp - 953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 28091874-28093255(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGGGGT
SmilChr05G000100 Chr05 NC_080391.1:614723-614734promoter 内 3016-3027 bp + 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 612495-613749(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCATCT
SmilChr01G000350 Chr01 NC_080387.1:7298913-7298924promoter 内 2883-2894 bp + 1107 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 7300031-7302750(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGGCACGTGGC
SmilChr02G004520 Chr02 NC_080388.1:67717193-67717204promoter 内 2873-2884 bp - 1117 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 67712220-67716076(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGCT
SmilChr03G003501 Chr03 NC_080389.1:53635558-53635569promoter 内 2788-2799 bp - 1202 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 53636771-53643349(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCT
SmilChr04G002926 Chr04 NC_080390.1:45541901-45541912promoter 内 2750-2761 bp - 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 45536303-45540661(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGAGGT
SmilChr02G003994 Chr02 NC_080388.1:62278923-62278934promoter 内 2749-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 62259906-62277682(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGCGGT
SmilChr02G005108 Chr02 NC_080388.1:72596460-72596471promoter 内 2494-2505 bp + 1496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 72591050-72594964(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTCGTCAGCG
SmilChr01G005751 Chr01 NC_080387.1:73591340-73591351promoter 内 2487-2498 bp - 1503 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 73588147-73589837(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGCG
SmilChr01G004828 Chr01 NC_080387.1:66435004-66435015promoter 内 2464-2475 bp - 1526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 66432362-66433478(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGCT
SmilChr01G003376 Chr01 NC_080387.1:52452705-52452716promoter 内 2350-2361 bp - 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 52450397-52451065(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGAGGG
SmilChr03G002646 Chr03 NC_080389.1:42101413-42101424promoter 内 2336-2347 bp + 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 42095707-42099759(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTCGTCAGCC
SmilChr01G003837 Chr01 NC_080387.1:56722343-56722354promoter 内 2238-2249 bp - 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 56719044-56720591(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGCA
SmilChr01G005280 Chr01 NC_080387.1:70198826-70198837promoter 内 2179-2190 bp - 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 70200648-70203983(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCATCT
SmilChr02G004039 Chr02 NC_080388.1:62710600-62710611promoter 内 1828-1839 bp + 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 62706465-62708438(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCATCT