Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002075; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008328-RA_Salv SmilChr07G002075 C2H2 XP_057773918.1 MP00485 TTTTTTTTTGTCGTTTTCTG

可能结合的靶基因

8059 个结合位点 7130 个候选靶基因 第 129 / 143 下载 TSV

上一页 129 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000459 Chr04 NC_080390.1:4887596-4887615promoter 内 301-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 4891296-4896697(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGATAAACGACAAATGGATT
SmilChr08G000193 Chr08 NC_080394.1:1305183-1305202promoter 内 292-311 bp + 3690 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 1294368-1301493(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GATAATAAGACAAAAGTGAA
SmilChr03G003468 Chr03 NC_080389.1:53123156-53123175promoter 内 288-307 bp - 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 53126869-53130043(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTTAACAAGACAAAAGAAAG
SmilChr04G001444 Chr04 NC_080390.1:23738755-23738774promoter 内 251-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 23731533-23735024(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTTCTTTTTTT
SmilChr07G001234 Chr07 NC_080393.1:9448973-9448992promoter 内 248-267 bp + 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 9452726-9452799(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTGTTTGTCGTTTATAC
SmilChr02G000261 Chr02 NC_080388.1:3362297-3362316promoter 内 241-260 bp + 3741 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 3366057-3369031(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAATTTGTTGTCGTCTTTTC
SmilChr02G004975 Chr02 NC_080388.1:71642071-71642090promoter 内 240-259 bp + 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 71632567-71638329(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CCGCAAAGGACAAAAACGTG
SmilChr07G004032 Chr07 NC_080393.1:51493820-51493839promoter 内 236-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 51497585-51499127(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CAAAAGGGGACAAAAACCAT
SmilChr01G001256 Chr01 NC_080387.1:25206433-25206452promoter 内 211-230 bp - 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 25198578-25202662(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TGTTTTTTTGTAGTGTTGTT
SmilChr02G004195 Chr02 NC_080388.1:64285046-64285065promoter 内 198-217 bp - 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 64288849-64296311(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATGAACACGACAAAGCAGGG
SmilChr01G005503 Chr01 NC_080387.1:71894987-71895006promoter 内 179-198 bp - 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 71898809-71900601(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAAAAAAGAACAAAAAAAAA
SmilChr01G006182 Chr01 NC_080387.1:77339740-77339759promoter 内 177-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 77343564-77346499(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AACTTAAGGACAAAATTGTT
SmilChr07G004039 Chr07 NC_080393.1:51653531-51653550promoter 内 111-130 bp + 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 51644271-51649660(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTGAAAAGGACAAAAGGTTC
SmilChr08G001020 Chr08 NC_080394.1:7732354-7732373promoter 内 111-130 bp + 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 7725085-7728483(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGAAGACGACAATGAAAAA
SmilChr02G005535 Chr02 NC_080388.1:75402650-75402669promoter 内 109-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 75395535-75398777(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATAGACTTTGTCGTCTTACT
SmilChr03G000717 Chr03 NC_080389.1:7955625-7955644promoter 内 88-107 bp - 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 7959538-7962296(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CCGCAAAGGACAAAAACGTG
SmilChr03G000852 Chr03 NC_080389.1:9740052-9740071promoter 内 73-92 bp + 3909 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 9733194-9736143(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGCTTGAAGACAAAATGAAG
SmilChr06G000196 Chr06 NC_080392.1:1355007-1355026promoter 内 24-43 bp + 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 1348396-1351049(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GTCATCACGACAAAAAATGG
SmilChr01G004601 Chr01 NC_080387.1:63991439-63991458promoter 内 13-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 63995427-64002877(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGTAGTTTTGTCCTTTAATA
SmilChr08G001637 Chr08 NC_080394.1:13570203-13570222promoter 内 1325-1344 bp - 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 3 13572879-13576655(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGAATCGGACAAAACTAAC
SmilChr02G005118 Chr02 NC_080388.1:72679752-72679771promoter 内 3946-3965 bp + 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 72677708-72679716(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CAATAGACGACAAGACTCTG
SmilChr05G002764 Chr05 NC_080391.1:32029664-32029683promoter 内 3910-3929 bp + 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 32029755-32033678(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTAATTTTTGTAGTTTTGGT
SmilChr02G005119 Chr02 NC_080388.1:72679858-72679877promoter 内 3813-3832 bp - 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 72680046-72684140(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CAATAGACGACAAGACTCTG
SmilChr05G001926 Chr05 NC_080391.1:19528604-19528623promoter 内 3724-3743 bp - 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 19528881-19537029(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATCAAAGAGACAAAAATGAT
SmilChr04G000396 Chr04 NC_080390.1:4106464-4106483promoter 内 3373-3392 bp - 609 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 4107092-4109949(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ACCGAACCGACAAAACCGAG
SmilChr07G003957 Chr07 NC_080393.1:50154236-50154255promoter 内 3107-3126 bp + 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 50152437-50153361(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TAATTAAGGACAAAACAGAA
SmilChr02G003267 Chr02 NC_080388.1:53933787-53933806promoter 内 909-928 bp - 3073 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 53936879-53938637(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTAAAAATGACAAAAAATTT
SmilChr02G005311 Chr02 NC_080388.1:74001624-74001643promoter 内 751-770 bp + 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 74004874-74006424(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTATATTTTGTCTTTAATTA
SmilChr05G001925 Chr05 NC_080391.1:19528539-19528558promoter 内 420-439 bp - 3562 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 19521808-19524977(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATCATTTTTGTCTCTTTGAT
SmilChr03G003477 Chr03 NC_080389.1:53310828-53310847promoter 内 3975-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 53310854-53316655(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAAATAACAACAAAAAAAAA
SmilChr08G003098 Chr08 NC_080394.1:31162511-31162530promoter 内 3971-3990 bp - 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 31162541-31165886(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AACAAAAATACAAAAATTAG
SmilChr01G005113 Chr01 NC_080387.1:68903588-68903607promoter 内 3952-3971 bp + 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68903637-68905770(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATAAATTTTGTCTTATTCGA
SmilChr08G003738 Chr08 NC_080394.1:42259760-42259779promoter 内 3939-3958 bp + 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42259822-42262659(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTGATTTTTGTCTTTTATAA
SmilChr08G000809 Chr08 NC_080394.1:5962096-5962115promoter 内 3922-3941 bp - 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5962175-5964349(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GACTATCCGACAAAAATTGT
SmilChr03G000646 Chr03 NC_080389.1:7175228-7175247promoter 内 3916-3935 bp + 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 7172638-7175162(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CAATAGACGACAAGACTTTG
SmilChr08G003368 Chr08 NC_080394.1:35297760-35297779promoter 内 3897-3916 bp - 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35297864-35298937(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAAAAAACTACAAAAACATA
SmilChr02G005471 Chr02 NC_080388.1:74979668-74979687promoter 内 3893-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 74977964-74979579(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTTTTTTTTGTCATAATCTA
SmilChr08G002426 Chr08 NC_080394.1:23035086-23035105promoter 内 3865-3884 bp + 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 23031041-23034969(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTAAAAATGACAAAAAATTT
SmilChr05G001342 Chr05 NC_080391.1:11824475-11824494promoter 内 3847-3866 bp + 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 11824629-11828189(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTCTTTTTTGTCGCTTGCAG
SmilChr08G002554 Chr08 NC_080394.1:24835677-24835696promoter 内 3839-3858 bp + 143 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 24832088-24835534(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTAAAAATGACAAAAAATTT
SmilChr01G003174 Chr01 NC_080387.1:50545582-50545601promoter 内 3820-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 50545763-50553870(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CATAAAACTACAAAAATCCA
SmilChr03G000113 Chr03 NC_080389.1:1245170-1245189promoter 内 3819-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1245352-1248850(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTTTTTTTATT
SmilChr08G002183 Chr08 NC_080394.1:19723819-19723838promoter 内 3819-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 19724001-19724894(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATTGTTTTTGTATTTTTGTT
SmilChr06G002965 Chr06 NC_080392.1:42436897-42436916promoter 内 3812-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42432502-42436727(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTAAAAATGACAAAAAATTT
SmilChr08G002539 Chr08 NC_080394.1:24670100-24670119promoter 内 3803-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 24666571-24669921(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTAAAAATGACAAAAAATTT
SmilChr05G002317 Chr05 NC_080391.1:24993460-24993479promoter 内 3796-3815 bp - 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 24991817-24993274(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TCAACTTTTGTCTTCATTTT
SmilChr02G001860 Chr02 NC_080388.1:33826931-33826950promoter 内 3789-3808 bp - 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 33825683-33826738(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CCAGTTTTTGTTGTTTTTCT
SmilChr05G002015 Chr05 NC_080391.1:20899913-20899932promoter 内 3785-3804 bp - 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 20900129-20900494(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGAACCCGACAAAGTACAT
SmilChr05G000719 Chr05 NC_080391.1:5501448-5501467promoter 内 3774-3793 bp - 208 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5501675-5503387(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CAAATAATGACAAAACGAGA
SmilChr08G000504 Chr08 NC_080394.1:3686156-3686175promoter 内 3770-3789 bp + 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 3682367-3685944(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGATACAAGACAAAAAATGT