转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 13 / 149 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002037 Chr04 NC_080390.1:33089424-33089434promoter 内 1594-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 33085708-33087027(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr05G003241 Chr05 NC_080391.1:41664585-41664595promoter 内 1467-1477 bp + 2524 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 41667119-41669394(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr06G002246 Chr06 NC_080392.1:31879606-31879616promoter 内 1434-1444 bp - 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 31882173-31883019(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr03G001702 Chr03 NC_080389.1:22622738-22622748promoter 内 1400-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 22625339-22626262(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr01G000904 Chr01 NC_080387.1:19093429-19093439promoter 内 1116-1126 bp - 2875 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 19086795-19090554(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G002370 Chr05 NC_080391.1:25951925-25951935promoter 内 1074-1084 bp + 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 25954852-25955773(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G003209 Chr05 NC_080391.1:41149387-41149397promoter 内 941-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 41142431-41146337(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr06G002827 Chr06 NC_080392.1:41039862-41039872promoter 内 934-944 bp - 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 41033105-41036805(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr06G002138 Chr06 NC_080392.1:28965243-28965253promoter 内 211-221 bp - 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 28969033-28973043(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr03G001538 Chr03 NC_080389.1:19288124-19288134promoter 内 3645-3655 bp - 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 19286477-19287778(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr04G001186 Chr04 NC_080390.1:18109594-18109604promoter 内 3622-3632 bp + 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 18109973-18112965(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G002922 Chr05 NC_080391.1:35173538-35173548promoter 内 3557-3567 bp + 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 35173982-35176679(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr02G000524 Chr02 NC_080388.1:7219815-7219825promoter 内 3336-3346 bp + 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 7220480-7224847(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G003325 Chr05 NC_080391.1:43585583-43585593promoter 内 3332-3342 bp - 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 43584160-43584924(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr07G003114 Chr07 NC_080393.1:33018395-33018405promoter 内 3256-3266 bp - 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 33019140-33021828(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr06G000873 Chr06 NC_080392.1:8257514-8257524promoter 内 3209-3219 bp + 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 8254374-8256732(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr03G001241 Chr03 NC_080389.1:14298713-14298723promoter 内 3127-3137 bp + 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 14296983-14297849(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr04G001879 Chr04 NC_080390.1:30699859-30699869promoter 内 3109-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 30698489-30698977(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr01G004903 Chr01 NC_080387.1:67095374-67095384promoter 内 3029-3039 bp + 962 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 67092391-67094412(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGCCAGCTGGA
SmilChr06G002194 Chr06 NC_080392.1:30415583-30415593promoter 内 2979-2989 bp - 1012 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 30416605-30418907(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr01G000925 Chr01 NC_080387.1:19606776-19606786promoter 内 2945-2955 bp + 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 19590326-19605730(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr07G003098 Chr07 NC_080393.1:32763875-32763885promoter 内 2924-2934 bp + 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 32764952-32766118(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G003644 Chr03 NC_080389.1:55115927-55115937promoter 内 2913-2923 bp - 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 55117015-55119453(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr05G002990 Chr05 NC_080391.1:36613555-36613565promoter 内 2903-2913 bp - 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 36614653-36615787(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr06G001272 Chr06 NC_080392.1:13303617-13303627promoter 内 2858-2868 bp - 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 13300910-13302484(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr04G000796 Chr04 NC_080390.1:9836895-9836905promoter 内 2842-2852 bp - 1149 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 9833809-9835746(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr02G001106 Chr02 NC_080388.1:19894919-19894929promoter 内 2816-2826 bp + 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 19896104-19900667(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr01G000667 Chr01 NC_080387.1:14824291-14824301promoter 内 2804-2814 bp + 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 14820548-14823104(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr01G002728 Chr01 NC_080387.1:45631505-45631515promoter 内 2785-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 45632721-45634169(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGT
SmilChr03G001832 Chr03 NC_080389.1:25124551-25124561promoter 内 2782-2792 bp - 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 25095084-25123342(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G002875 Chr05 NC_080391.1:34430661-34430671promoter 内 2779-2789 bp + 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 34428404-34429449(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr05G003000 Chr05 NC_080391.1:37092376-37092386promoter 内 2717-2727 bp - 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 37093660-37096214(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr04G001504 Chr04 NC_080390.1:24673003-24673013promoter 内 2682-2692 bp - 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 24674322-24674428(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr04G001127 Chr04 NC_080390.1:16331699-16331709promoter 内 2667-2677 bp - 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 16329986-16330375(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr01G000895 Chr01 NC_080387.1:19004823-19004833promoter 内 2658-2668 bp - 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 19002793-19003490(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr06G001991 Chr06 NC_080392.1:25321281-25321291promoter 内 2640-2650 bp - 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 25315027-25319930(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr02G003233 Chr02 NC_080388.1:53603294-53603304promoter 内 2622-2632 bp + 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 53600462-53601925(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAG
SmilChr05G003481 Chr05 NC_080391.1:46204748-46204758promoter 内 2606-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 46206143-46208911(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr07G001571 Chr07 NC_080393.1:12943005-12943015promoter 内 2591-2601 bp + 1400 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 12944415-12948060(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G001934 Chr03 NC_080389.1:27353828-27353838promoter 内 2553-2563 bp - 1438 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 27351809-27352390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr01G000329 Chr01 NC_080387.1:6722512-6722522promoter 内 2532-2542 bp - 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 6723981-6724799(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr03G001712 Chr03 NC_080389.1:22902879-22902889promoter 内 2401-2411 bp + 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 22904479-22920232(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G001805 Chr03 NC_080389.1:24665368-24665378promoter 内 2381-2391 bp - 1610 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 24666988-24675013(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr03G001205 Chr03 NC_080389.1:13883947-13883957promoter 内 2273-2283 bp + 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 13885675-13888972(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G002829 Chr05 NC_080391.1:33572892-33572902promoter 内 2256-2266 bp + 1735 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 33574637-33579467(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr01G002016 Chr01 NC_080387.1:35735060-35735070promoter 内 2172-2182 bp + 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 35732175-35733241(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr06G001632 Chr06 NC_080392.1:18291299-18291309promoter 内 2153-2163 bp - 1838 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 18293147-18293485(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr01G002729 Chr01 NC_080387.1:45631505-45631515promoter 内 2123-2133 bp - 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 45633383-45635183(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGT
SmilChr04G000514 Chr04 NC_080390.1:5643744-5643754promoter 内 2075-2085 bp - 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 5645670-5657433(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr03G003063 Chr03 NC_080389.1:47579899-47579909promoter 内 2062-2072 bp - 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 47581838-47583674(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA