转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G004136; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000866-RA_Salv SmilChr04G004136 MYB XP_057806072.1 MP00627 TTACCTACCG

可能结合的靶基因

9835 个结合位点 8075 个候选靶基因 第 14 / 162 下载 TSV

上一页 14 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002797 Chr01 NC_080387.1:46465365-46465374promoter 内 95-104 bp + 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 46458193-46461468(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr02G004656 Chr02 NC_080388.1:68971444-68971453promoter 内 48-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 68975397-68976452(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr06G001065 Chr06 NC_080392.1:10517304-10517313promoter 内 3653-3662 bp - 339 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 10517652-10518255(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G002492 Chr07 NC_080393.1:23591685-23591694promoter 内 3411-3420 bp - 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 23592275-23600386(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr02G002577 Chr02 NC_080388.1:44818249-44818258promoter 内 3346-3355 bp + 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 44818904-44820917(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G006052 Chr01 NC_080387.1:76014677-76014686promoter 内 3265-3274 bp + 727 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 76012807-76013950(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr01G004976 Chr01 NC_080387.1:67831400-67831409promoter 内 3211-3220 bp - 781 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 67832190-67832949(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr02G002998 Chr02 NC_080388.1:50662551-50662560promoter 内 3203-3212 bp - 789 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 50658167-50661762(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G000184 Chr03 NC_080389.1:1958617-1958626promoter 内 3192-3201 bp - 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 1959426-1962875(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr06G000098 Chr06 NC_080392.1:708445-708454promoter 内 3116-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 704306-707569(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr07G003184 Chr07 NC_080393.1:33930216-33930225promoter 内 3061-3070 bp + 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 33927118-33929285(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr08G000008 Chr08 NC_080394.1:94530-94539promoter 内 2861-2870 bp + 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 95670-97456(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr04G000141 Chr04 NC_080390.1:1210076-1210085promoter 内 2547-2556 bp + 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 1205391-1208631(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr05G002247 Chr05 NC_080391.1:24147335-24147344promoter 内 2506-2515 bp - 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 24144159-24145849(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr07G001776 Chr07 NC_080393.1:15049417-15049426promoter 内 2197-2206 bp + 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 15051221-15051595(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr04G003642 Chr04 NC_080390.1:52905404-52905413promoter 内 2112-2121 bp + 1880 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 52907293-52913197(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr06G000949 Chr06 NC_080392.1:9139125-9139134promoter 内 2078-2087 bp - 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 9136268-9137211(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G003858 Chr03 NC_080389.1:57670934-57670943promoter 内 1938-1947 bp + 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 57672997-57674764(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr07G001135 Chr07 NC_080393.1:8528964-8528973promoter 内 1728-1737 bp - 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 8524402-8526700(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr02G002398 Chr02 NC_080388.1:41867750-41867759promoter 内 1713-1722 bp + 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 41870038-41876295(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr07G004730 Chr07 NC_080393.1:60182541-60182550promoter 内 1575-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 60184967-60188167(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr04G000874 Chr04 NC_080390.1:11098421-11098430promoter 内 1546-1555 bp - 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 11100876-11102437(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr01G004114 Chr01 NC_080387.1:59666124-59666133promoter 内 1451-1460 bp - 2541 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 59668674-59671246(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G001678 Chr07 NC_080393.1:14224439-14224448promoter 内 1319-1328 bp + 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 14221145-14221766(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr08G000009 Chr08 NC_080394.1:94530-94539promoter 内 1045-1054 bp + 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 97486-100787(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr04G001185 Chr04 NC_080390.1:18022780-18022789promoter 内 801-810 bp - 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 18025980-18027111(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr01G005017 Chr01 NC_080387.1:68173414-68173423promoter 内 446-455 bp - 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 68167299-68169868(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr06G000100 Chr06 NC_080392.1:708445-708454promoter 内 331-340 bp - 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 712115-714846(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr02G004278 Chr02 NC_080388.1:64972368-64972377promoter 内 106-115 bp + 3886 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 64976263-64976652(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr02G000377 Chr02 NC_080388.1:4755038-4755047promoter 内 103-112 bp - 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 4758936-4763213(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr04G001560 Chr04 NC_080390.1:25899198-25899207promoter 内 3989-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 25899210-25902942(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr06G002611 Chr06 NC_080392.1:37546237-37546246promoter 内 3985-3994 bp + 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 37546253-37547565(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G004191 Chr03 NC_080389.1:60584188-60584197promoter 内 3984-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 60584205-60587429(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr02G002290 Chr02 NC_080388.1:40431297-40431306promoter 内 3975-3984 bp + 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 40431323-40434945(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G002654 Chr03 NC_080389.1:42201980-42201989promoter 内 3949-3958 bp + 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 42190409-42201937(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr06G001458 Chr06 NC_080392.1:15431338-15431347promoter 内 3928-3937 bp - 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 15431411-15434638(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr05G000541 Chr05 NC_080391.1:4145885-4145894promoter 内 3909-3918 bp - 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 4139977-4145802(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G002312 Chr05 NC_080391.1:24948823-24948832promoter 内 3905-3914 bp - 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 24945187-24948736(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G002313 Chr05 NC_080391.1:24955040-24955049promoter 内 3905-3914 bp - 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 24951404-24954953(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G001243 Chr01 NC_080387.1:24934478-24934487promoter 内 3815-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 24933517-24934301(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr04G002209 Chr04 NC_080390.1:35756036-35756045promoter 内 3815-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 35755075-35755859(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G004423 Chr07 NC_080393.1:56836706-56836715promoter 内 3815-3824 bp - 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 56836892-56837676(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr03G001926 Chr03 NC_080389.1:27021609-27021618promoter 内 3798-3807 bp - 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27018285-27021415(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G004969 Chr01 NC_080387.1:67794514-67794523promoter 内 3763-3772 bp - 229 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 67793183-67794285(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G003402 Chr05 NC_080391.1:45111793-45111802promoter 内 3760-3769 bp - 232 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 45108643-45111561(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr07G004243 Chr07 NC_080393.1:54857789-54857798promoter 内 3750-3759 bp + 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 54858040-54860461(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G004468 Chr03 NC_080389.1:62759261-62759270promoter 内 3716-3725 bp - 276 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 62756420-62758985(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr04G001442 Chr04 NC_080390.1:23682318-23682327promoter 内 3518-3527 bp + 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 23682801-23685784(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G000542 Chr05 NC_080391.1:4145885-4145894promoter 内 3482-3491 bp - 510 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 4146404-4153035(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G002107 Chr07 NC_080393.1:19195241-19195250promoter 内 3211-3220 bp - 781 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 19196031-19197938(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT