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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G003597; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00008984-RA_Salv SmilChr07G003597 Nin-like XP_057773587.1 MP00449 ATTTGGCTTTTCGGA

可能结合的靶基因

9453 个结合位点 8096 个候选靶基因 第 153 / 162 下载 TSV

上一页 153 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr01G003096 Chr01 NC_080387.1:49787887-49787901promoter 内 244-258 bp - 3743 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 49780127-49784144(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GCGTGGCTTTTCTCC
SmilChr01G001387 Chr01 NC_080387.1:27280938-27280952promoter 内 228-242 bp - 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 27272328-27277179(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CATTGGCTTTAGGCG
SmilChr01G001845 Chr01 NC_080387.1:33396584-33396598promoter 内 216-230 bp - 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 33400369-33405408(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AATTAAAAGCCAATA
SmilChr07G001985 Chr07 NC_080393.1:17490987-17491001promoter 内 198-212 bp + 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 17485428-17487198(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TGGAAAAAGCCAAGT
SmilChr07G002689 Chr07 NC_080393.1:26250457-26250471promoter 内 111-125 bp + 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 26254347-26256261(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TGTTGGCTTCTCCTT
SmilChr05G003694 Chr05 NC_080391.1:50052286-50052300promoter 内 95-109 bp + 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 50056192-50057215(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AGGTAGCTTTTCACG
SmilChr07G004081 Chr07 NC_080393.1:52255713-52255727promoter 内 94-108 bp + 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 52259620-52271226(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GCACGGCTTTTGTGA
SmilChr01G006037 Chr01 NC_080387.1:75871161-75871175promoter 内 77-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 75875085-75878965(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GCTTGGCTTCTCATC
SmilChr05G000013 Chr05 NC_080391.1:67027-67041promoter 内 74-88 bp + 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 60245-63114(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CGACAAAAGCCGTCA
SmilChr03G003249 Chr03 NC_080389.1:50373690-50373704promoter 内 3-17 bp - 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 50377688-50380609(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CGCCGAAAGCCACCA
SmilChr01G001528 Chr01 NC_080387.1:29274396-29274410promoter 内 2-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 29278395-29284771(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATAGAAAAGCCGCTA
SmilChr04G000022 Chr04 NC_080390.1:251652-251666promoter 内 2-16 bp + 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 255651-258098(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATATAGCTTTTCGAT
SmilChr02G001306 Chr02 NC_080388.1:24258988-24259002promoter 内 1569-1583 bp + 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 10 24254933-24256570(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTGTAAAGCCAAAG
SmilChr06G002081 Chr06 NC_080392.1:27427742-27427756promoter 内 758-772 bp - 3229 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 6 27423567-27424513(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTTGGCTTTACAAG
SmilChr02G000056 Chr02 NC_080388.1:725918-725932promoter 内 295-309 bp - 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 5 721543-722226(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTTGGCTTTACAAG
SmilChr08G001611 Chr08 NC_080394.1:13337398-13337412promoter 内 2840-2854 bp - 1147 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 13334313-13336251(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CAATGGCTTTTAAAA
SmilChr02G002064 Chr02 NC_080388.1:37203718-37203732promoter 内 2119-2133 bp - 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 37199198-37201850(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GTTTGGCTTTTGTTC
SmilChr07G000976 Chr07 NC_080393.1:7101883-7101897promoter 内 1136-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 7104748-7106514(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GGCAAAAAGCCGAAC
SmilChr06G000650 Chr06 NC_080392.1:5751844-5751858promoter 内 3984-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5748463-5751841(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATCGAAAAGACGGAG
SmilChr07G002976 Chr07 NC_080393.1:30331702-30331716promoter 内 3969-3983 bp + 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 30330620-30331684(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACTGTAAAGCCAAAG
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SmilChr04G002290 Chr04 NC_080390.1:37185600-37185614promoter 内 3890-3904 bp + 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 37184289-37185503(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AAACAAAAGCCAAAC
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SmilChr02G002196 Chr02 NC_080388.1:39196813-39196827promoter 内 3876-3890 bp - 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 39196938-39198398(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTAAGAGGCCAAAT
SmilChr02G002197 Chr02 NC_080388.1:39210419-39210433promoter 内 3876-3890 bp - 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 39210544-39212004(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTAAGAGGCCAAAT
SmilChr07G001354 Chr07 NC_080393.1:10490516-10490530promoter 内 3859-3873 bp - 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 10489145-10490388(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTTGGCTCTCCGAT
SmilChr01G002964 Chr01 NC_080387.1:48522030-48522044promoter 内 3793-3807 bp + 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48522238-48524845(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AAGTGGCTTTAGGAT
SmilChr01G004850 Chr01 NC_080387.1:66648425-66648439promoter 内 3697-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 66645360-66648135(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AGTCGGCTTTTTAAC
SmilChr03G000272 Chr03 NC_080389.1:3113021-3113035promoter 内 3674-3688 bp - 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 3113348-3114179(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GCACAGAAGCCAACT
SmilChr05G002514 Chr05 NC_080391.1:27895569-27895583promoter 内 3638-3652 bp + 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 27891862-27895220(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AGACAAAAGCCAATG
SmilChr02G001940 Chr02 NC_080388.1:34948402-34948416promoter 内 3637-3651 bp - 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 34945845-34948052(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATTTGGCCTTCCACT
SmilChr07G002835 Chr07 NC_080393.1:28393100-28393114promoter 内 3626-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 28393475-28394035(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GAGAAAAAGCCAAAT
SmilChr02G000322 Chr02 NC_080388.1:4043707-4043721promoter 内 3589-3603 bp + 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 4044119-4047447(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AGTTGGCTTTTTCCT
SmilChr04G001929 Chr04 NC_080390.1:31396100-31396114promoter 内 3564-3578 bp - 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 31393815-31395677(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CGACGGCTTTTGCCC
SmilChr04G000837 Chr04 NC_080390.1:10539804-10539818promoter 内 3552-3566 bp - 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 10536248-10539369(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCGTAGCTTTTCGAA
SmilChr08G004554 Chr08 NC_080394.1:55122423-55122437promoter 内 3499-3513 bp - 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 55122925-55123807(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GCACAGAAGCCAACT
SmilChr02G002099 Chr02 NC_080388.1:37662092-37662106promoter 内 3447-3461 bp + 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 37662646-37667014(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATTTGGCCTCTTAAA
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SmilChr04G001166 Chr04 NC_080390.1:17379535-17379549promoter 内 3350-3364 bp + 637 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 17380186-17383155(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTGAGACCTTTCGGA
SmilChr05G000188 Chr05 NC_080391.1:1544890-1544904promoter 内 3346-3360 bp - 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1500400-1544249(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCCCGGCTTTTGAAC
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SmilChr02G002114 Chr02 NC_080388.1:37825330-37825344promoter 内 3301-3315 bp + 686 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 37814648-37824644(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTTAAAAGCCATCG
SmilChr02G002437 Chr02 NC_080388.1:42531393-42531407promoter 内 3294-3308 bp + 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42527911-42530700(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TGGAAAAAGCCATTT
SmilChr08G004166 Chr08 NC_080394.1:50968455-50968469promoter 内 3288-3302 bp - 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 50969168-50969625(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTCAAAAAGCCGGCG
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SmilChr03G001678 Chr03 NC_080389.1:22049566-22049580promoter 内 2953-2967 bp - 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 22032539-22048532(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GATTGGCTTTACAGC
SmilChr01G003158 Chr01 NC_080387.1:50418182-50418196promoter 内 2904-2918 bp + 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 50414386-50417099(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AATAAAAAGCCACCA