转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 16 / 149 下载 TSV

上一页 16 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002335 Chr02 NC_080388.1:41064910-41064920promoter 内 2118-2128 bp - 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 41061442-41063037(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCC
SmilChr03G001211 Chr03 NC_080389.1:13933979-13933989promoter 内 2072-2082 bp + 1919 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 13935908-13936964(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr02G000055 Chr02 NC_080388.1:716138-716148promoter 内 1975-1985 bp + 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 718164-720898(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCT
SmilChr03G001210 Chr03 NC_080389.1:13933979-13933989promoter 内 1964-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 13929505-13931952(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr01G003163 Chr01 NC_080387.1:50439339-50439349promoter 内 1915-1925 bp - 2076 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 50441425-50448394(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr04G000957 Chr04 NC_080390.1:12672452-12672462promoter 内 1852-1862 bp + 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 12674601-12675732(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G002315 Chr03 NC_080389.1:36458210-36458220promoter 内 1842-1852 bp - 2149 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 36453037-36456061(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G001006 Chr03 NC_080389.1:11389160-11389170promoter 内 1801-1811 bp - 2190 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 11391360-11392626(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr04G001493 Chr04 NC_080390.1:24490226-24490236promoter 内 1680-1690 bp - 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 24492547-24493209(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr03G002979 Chr03 NC_080389.1:46628186-46628196promoter 内 1612-1622 bp - 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 46624053-46625807(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCA
SmilChr04G001811 Chr04 NC_080390.1:29604758-29604768promoter 内 1579-1589 bp - 2412 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 29607180-29610502(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr04G001411 Chr04 NC_080390.1:22965080-22965090promoter 内 1509-1519 bp + 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 22967572-22969579(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G000527 Chr03 NC_080389.1:5642172-5642182promoter 内 1428-1438 bp - 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 5644745-5645521(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr04G002619 Chr04 NC_080390.1:41598311-41598321promoter 内 1383-1393 bp - 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 41600929-41605099(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAG
SmilChr01G004184 Chr01 NC_080387.1:60279778-60279788promoter 内 1371-1381 bp + 2620 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 60282408-60283101(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCA
SmilChr03G001296 Chr03 NC_080389.1:15154624-15154634promoter 内 1334-1344 bp - 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 15157291-15160121(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTA
SmilChr03G002123 Chr03 NC_080389.1:33006709-33006719promoter 内 1315-1325 bp + 2676 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 33009395-33015750(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCA
SmilChr03G000520 Chr03 NC_080389.1:5593978-5593988promoter 内 1311-1321 bp - 2680 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 5596668-5597834(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr05G001756 Chr05 NC_080391.1:17241832-17241842promoter 内 1250-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 17244583-17245008(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr01G003816 Chr01 NC_080387.1:56523145-56523155promoter 内 1140-1150 bp + 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 56526006-56526977(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCC
SmilChr03G002092 Chr03 NC_080389.1:32252177-32252187promoter 内 1112-1122 bp - 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 32245226-32249298(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr01G003850 Chr01 NC_080387.1:56799590-56799600promoter 内 973-983 bp - 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 56795583-56796572(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCC
SmilChr04G003360 Chr04 NC_080390.1:50192982-50192992promoter 内 331-341 bp + 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 50196652-50204421(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCC
SmilChr01G001068 Chr01 NC_080387.1:22029826-22029836promoter 内 303-313 bp - 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 22024948-22026138(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr06G000050 Chr06 NC_080392.1:414107-414117promoter 内 292-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 408241-410408(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAG
SmilChr01G001328 Chr01 NC_080387.1:26440883-26440893promoter 内 270-280 bp - 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 26434729-26437162(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G001128 Chr05 NC_080391.1:9421270-9421280promoter 内 225-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 9417052-9417504(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCC
SmilChr06G002571 Chr06 NC_080392.1:36882616-36882626promoter 内 185-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 36878702-36878810(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr03G002301 Chr03 NC_080389.1:36229860-36229870promoter 内 149-159 bp - 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 36221533-36226018(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr04G003368 Chr04 NC_080390.1:50260975-50260985promoter 内 124-134 bp - 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 50254139-50257108(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCT
SmilChr03G001481 Chr03 NC_080389.1:17866601-17866611promoter 内 111-121 bp - 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 17859817-17862721(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr04G000991 Chr04 NC_080390.1:13589488-13589498promoter 内 64-74 bp - 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 13584890-13585561(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr04G001353 Chr04 NC_080390.1:21988404-21988414promoter 内 32-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 21992373-21995259(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCA
SmilChr05G001631 Chr05 NC_080391.1:15238005-15238015promoter 内 3956-3966 bp - 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 15234079-15237970(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCT
SmilChr07G000306 Chr07 NC_080393.1:2013767-2013777promoter 内 3945-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 2013823-2016134(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCA
SmilChr05G002419 Chr05 NC_080391.1:26703630-26703640promoter 内 3321-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 26701311-26702960(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr03G004047 Chr03 NC_080389.1:59443412-59443422promoter 内 3224-3234 bp - 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 59444189-59446271(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAG
SmilChr03G004712 Chr03 NC_080389.1:64375737-64375747promoter 内 3204-3214 bp - 787 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 64372608-64374950(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCA
SmilChr03G004456 Chr03 NC_080389.1:62659817-62659827promoter 内 2885-2895 bp - 1106 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 62660933-62664423(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAG
SmilChr04G001081 Chr04 NC_080390.1:15486133-15486143promoter 内 2720-2730 bp - 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 15487414-15489406(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr01G004495 Chr01 NC_080387.1:63074008-63074018promoter 内 2598-2608 bp - 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 63069932-63072615(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCA
SmilChr01G002759 Chr01 NC_080387.1:45932502-45932512promoter 内 2595-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 45924199-45931106(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAG
SmilChr05G001642 Chr05 NC_080391.1:15372966-15372976promoter 内 2552-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 15374415-15379375(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAG
SmilChr04G000167 Chr04 NC_080390.1:1503722-1503732promoter 内 2536-2546 bp + 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1501725-1502267(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr07G002366 Chr07 NC_080393.1:22036213-22036223promoter 内 2255-2265 bp + 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 21971754-22034477(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGT
SmilChr05G003642 Chr05 NC_080391.1:48835512-48835522promoter 内 2212-2222 bp + 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 48837301-48838857(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCT
SmilChr05G003710 Chr05 NC_080391.1:50193332-50193342promoter 内 2044-2054 bp - 1947 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 50189503-50191385(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCA
SmilChr02G004737 Chr02 NC_080388.1:69583613-69583623promoter 内 1958-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 69585656-69585774(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCA
SmilChr03G003200 Chr03 NC_080389.1:49538976-49538986promoter 内 1902-1912 bp + 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 49541075-49543951(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCA
SmilChr04G002755 Chr04 NC_080390.1:43286051-43286061promoter 内 1684-1694 bp - 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 43276063-43283744(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCA