Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G001896; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004057-RA_Salv SmilChr08G001896 MYB XP_057783815.1 MP00564 AAAAATTAGGTGAAA

可能结合的靶基因

9893 个结合位点 6984 个候选靶基因 第 18 / 140 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004244 Chr02 NC_080388.1:64636048-64636062promoter 内 1874-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 64638175-64643463(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAACTTATT
SmilChr02G005219 Chr02 NC_080388.1:73399616-73399630promoter 内 1466-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 73402151-73407155(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTGAGGTTGGTGAAA
SmilChr02G000950 Chr02 NC_080388.1:16512211-16512225promoter 内 1361-1375 bp + 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 16514851-16515779(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ACTAATTAGGTAAAA
SmilChr02G005092 Chr02 NC_080388.1:72511704-72511718promoter 内 1218-1232 bp + 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 72507868-72508935(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCCCACCTAACATCA
SmilChr02G000377 Chr02 NC_080388.1:4756103-4756117promoter 内 1168-1182 bp + 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 4758936-4763213(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GGAGGTTAGGTGGAG
SmilChr01G005074 Chr01 NC_080387.1:68619550-68619564promoter 内 1085-1099 bp - 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 68622466-68624722(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATTTGC
SmilChr01G004921 Chr01 NC_080387.1:67291066-67291080promoter 内 771-785 bp - 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 67294296-67303027(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATTTGC
SmilChr02G005309 Chr02 NC_080388.1:73992384-73992398promoter 内 632-646 bp + 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 73995753-73997638(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCAAATTAGGTAAAA
SmilChr01G004827 Chr01 NC_080387.1:66425982-66425996promoter 内 437-451 bp - 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 66429546-66432850(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GCACACCTAATTTTG
SmilChr01G001227 Chr01 NC_080387.1:24555940-24555954promoter 内 3916-3930 bp - 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24556025-24558788(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTTCACCTACTCTTC
SmilChr01G003251 Chr01 NC_080387.1:51227736-51227750promoter 内 3737-3751 bp - 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 51223504-51227486(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTGTGGTAGGTGAAG
SmilChr01G004462 Chr01 NC_080387.1:62719695-62719709promoter 内 3684-3698 bp + 303 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 62720012-62722038(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTAAATTAGGTAGAG
SmilChr01G002583 Chr01 NC_080387.1:43964828-43964842promoter 内 3572-3586 bp - 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 43965257-43966611(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATTTGC
SmilChr03G001875 Chr03 NC_080389.1:26017853-26017867promoter 内 3283-3297 bp + 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 26018571-26022345(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AAATGTTAGGTGAAT
SmilChr03G001876 Chr03 NC_080389.1:26046159-26046173promoter 内 3197-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 26022430-26045369(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTAAATTAGGTAGAG
SmilChr02G003629 Chr02 NC_080388.1:57624541-57624555promoter 内 2795-2809 bp + 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 57622191-57623349(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTTCACCTACCACAC
SmilChr01G003814 Chr01 NC_080387.1:56523309-56523323promoter 内 2587-2601 bp - 1400 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 56521142-56521909(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTGAGGTTGGTGAAA
SmilChr01G000522 Chr01 NC_080387.1:10658227-10658241promoter 内 2529-2543 bp - 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10659699-10665472(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTTCACCTAATATGT
SmilChr01G003852 Chr01 NC_080387.1:56799422-56799436promoter 内 2490-2504 bp + 1497 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 56800933-56801689(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTGAGGTTGGTGAAA
SmilChr01G001658 Chr01 NC_080387.1:30646810-30646824promoter 内 2483-2497 bp + 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 30648328-30650655(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GCAAATTTGGTGAAA
SmilChr01G005517 Chr01 NC_080387.1:71989346-71989360promoter 内 2473-2487 bp + 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71983508-71987832(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTCTACCTAATTTAC
SmilChr02G002061 Chr02 NC_080388.1:37128945-37128959promoter 内 2398-2412 bp - 1589 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 37130548-37136485(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAACATTT
SmilChr03G003558 Chr03 NC_080389.1:54237760-54237774promoter 内 2297-2311 bp + 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54234924-54236070(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTTCACCTACTCTTC
SmilChr02G001255 Chr02 NC_080388.1:23047695-23047709promoter 内 2233-2247 bp - 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 23049463-23051744(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATTTGC
SmilChr01G000970 Chr01 NC_080387.1:20560920-20560934promoter 内 2155-2169 bp + 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 20552989-20559088(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAACATTT
SmilChr01G002281 Chr01 NC_080387.1:39604886-39604900promoter 内 1766-1780 bp - 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 39607121-39613937(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTAACACAT
SmilChr03G001807 Chr03 NC_080389.1:24678188-24678202promoter 内 1754-1768 bp - 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24675884-24675955(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GGAGGTTAGGTGGAG
SmilChr01G004460 Chr01 NC_080387.1:62719695-62719709promoter 内 1355-1369 bp + 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 62713429-62717063(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTCTACCTAATTTAC
SmilChr01G003816 Chr01 NC_080387.1:56523309-56523323promoter 内 1304-1318 bp - 2683 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 56526006-56526977(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAACCTCAC
SmilChr01G003850 Chr01 NC_080387.1:56799422-56799436promoter 内 1137-1151 bp + 2850 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 56795583-56796572(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAACCTCAC
SmilChr02G005256 Chr02 NC_080388.1:73666360-73666374promoter 内 1094-1108 bp + 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 73663374-73663467(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GATCACCTACCTCTG
SmilChr01G005320 Chr01 NC_080387.1:70431425-70431439promoter 内 1077-1091 bp + 2910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 70424670-70428515(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAATTAGT
SmilChr01G005317 Chr01 NC_080387.1:70431425-70431439promoter 内 1071-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 70412045-70428509(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAATTAGT
SmilChr01G003590 Chr01 NC_080387.1:54442172-54442186promoter 内 1035-1049 bp + 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54437545-54439220(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTAATTAAA
SmilChr01G003593 Chr01 NC_080387.1:54470670-54470684promoter 内 1035-1049 bp + 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54466042-54467718(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTAATTAAA
SmilChr01G003782 Chr01 NC_080387.1:56204502-56204516promoter 内 1026-1040 bp + 2961 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 56198461-56201541(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CCCCACCTAATACTC
SmilChr02G005255 Chr02 NC_080388.1:73666360-73666374promoter 内 966-980 bp + 3021 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 73663258-73663339(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GATCACCTACCTCTG
SmilChr02G001254 Chr02 NC_080388.1:23027506-23027520promoter 内 894-908 bp + 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 23030613-23031678(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCAAATTAGGTAAAA
SmilChr01G005518 Chr01 NC_080387.1:71989346-71989360promoter 内 641-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71992706-71995479(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTAAATTAGGTAGAG
SmilChr01G004506 Chr01 NC_080387.1:63163922-63163936promoter 内 537-551 bp + 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 63167386-63168771(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CGGAGGTTGGTGAAA
SmilChr03G003548 Chr03 NC_080389.1:54106166-54106180promoter 内 470-484 bp + 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54109697-54111990(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AGTTATTAGGTGAGC
SmilChr02G000458 Chr02 NC_080388.1:6124877-6124891promoter 内 371-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6118977-6121261(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTCTACCTAATTTAC
SmilChr02G003319 Chr02 NC_080388.1:54459664-54459678promoter 内 298-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54453435-54455975(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTCCAACTAATTTTG
SmilChr03G000779 Chr03 NC_080389.1:8884306-8884320promoter 内 62-76 bp - 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 8876744-8880381(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTAAATTAGGTAGAG
SmilChr03G002290 Chr03 NC_080389.1:36096271-36096285promoter 内 1954-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 5 36098318-36099253(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GAAATGTAGGTGAAA
SmilChr01G003803 Chr01 NC_080387.1:56419030-56419044promoter 内 3172-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 56415007-56418215(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTCCAACTAATTTTA
SmilChr01G003871 Chr01 NC_080387.1:56957048-56957062promoter 内 3110-3124 bp - 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 56957939-56961038(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTCCAACTAATTTTA
SmilChr01G005898 Chr01 NC_080387.1:74884545-74884559promoter 内 1362-1376 bp - 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 74887184-74896636(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATTTTG
SmilChr01G002353 Chr01 NC_080387.1:40702248-40702262promoter 内 2671-2685 bp - 1316 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 40680169-40700932(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTATAGTAGGTGAAA
SmilChr03G000812 Chr03 NC_080389.1:9295149-9295163promoter 内 1319-1333 bp + 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 9297831-9300286(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATATAGTAGGTGAAA