转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 22 / 139 下载 TSV

上一页 22 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002953 Chr04 NC_080390.1:45860179-45860190promoter 内 2798-2809 bp + 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 45851075-45858987(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTCC
SmilChr01G003992 Chr01 NC_080387.1:58350193-58350204promoter 内 2516-2527 bp + 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 58345415-58348719(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTGGG
SmilChr04G003130 Chr04 NC_080390.1:47904216-47904227promoter 内 2350-2361 bp - 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 47902505-47902576(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGCGACGTGGC
SmilChr03G004247 Chr03 NC_080389.1:60963222-60963233promoter 内 2319-2330 bp - 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 60964904-60965829(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGACG
SmilChr05G000148 Chr05 NC_080391.1:1213505-1213516promoter 内 2295-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 1194552-1211810(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTCG
SmilChr02G005587 Chr02 NC_080388.1:75674201-75674212promoter 内 2171-2182 bp - 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 75668157-75672382(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGACGACGTGGC
SmilChr04G004167 Chr04 NC_080390.1:56315385-56315396promoter 内 2050-2061 bp - 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 56317336-56318794(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTGGC
SmilChr02G001605 Chr02 NC_080388.1:29879819-29879830promoter 内 1950-1961 bp + 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29881870-29888854(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTCGACGTGGC
SmilChr05G000161 Chr05 NC_080391.1:1290687-1290698promoter 内 1716-1727 bp + 2274 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 1285097-1288413(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTCG
SmilChr01G001534 Chr01 NC_080387.1:29375948-29375959promoter 内 1673-1684 bp - 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29370413-29373631(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTCGACGTGGC
SmilChr01G001569 Chr01 NC_080387.1:29697294-29697305promoter 内 1651-1662 bp - 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29691777-29694955(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTCGACGTGGC
SmilChr03G001937 Chr03 NC_080389.1:27500097-27500108promoter 内 1496-1507 bp + 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 27502602-27504582(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCAGACGTGGG
SmilChr02G003460 Chr02 NC_080388.1:55894350-55894361promoter 内 1403-1414 bp + 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 55896948-55897020(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTCGACGTGGC
SmilChr02G001601 Chr02 NC_080388.1:29859699-29859710promoter 内 1120-1131 bp + 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29854104-29856829(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTCG
SmilChr01G004036 Chr01 NC_080387.1:58774446-58774457promoter 内 1093-1104 bp + 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 58777354-58779040(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGACGACGTGGC
SmilChr02G002920 Chr02 NC_080388.1:49511966-49511977promoter 内 1059-1070 bp + 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 49508532-49509035(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGCCT
SmilChr02G002948 Chr02 NC_080388.1:50010852-50010863promoter 内 941-952 bp - 3049 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 50013912-50014415(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGCCT
SmilChr05G000150 Chr05 NC_080391.1:1223892-1223903promoter 内 916-927 bp + 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 1220281-1220818(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTCG
SmilChr03G004245 Chr03 NC_080389.1:60963222-60963233promoter 内 821-832 bp - 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 60957313-60960053(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTCGACGTGGC
SmilChr04G003129 Chr04 NC_080390.1:47904216-47904227promoter 内 585-596 bp - 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 47897872-47900811(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGCGACGTGGC
SmilChr03G004059 Chr03 NC_080389.1:59551569-59551580promoter 内 399-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 59539744-59547978(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGCGACGTGGC
SmilChr01G002869 Chr01 NC_080387.1:47301582-47301593promoter 内 1904-1915 bp - 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 47303679-47304702(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGAG
SmilChr02G000347 Chr02 NC_080388.1:4512428-4512439promoter 内 1761-1772 bp + 2229 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 4514668-4515375(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGGA
SmilChr02G000290 Chr02 NC_080388.1:3682361-3682372promoter 内 1666-1677 bp - 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 3679397-3680037(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGGA
SmilChr02G000453 Chr02 NC_080388.1:6035610-6035621promoter 内 854-865 bp + 3136 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 6028130-6032474(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTC
SmilChr02G004010 Chr02 NC_080388.1:62422734-62422745promoter 内 3918-3929 bp + 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 62422817-62427184(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGGA
SmilChr02G003665 Chr02 NC_080388.1:58043496-58043507promoter 内 2607-2618 bp + 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 58044890-58052071(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACTCACGTGGC
SmilChr03G001829 Chr03 NC_080389.1:25065099-25065110promoter 内 2542-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 25063548-25063651(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCTGACGTGGA
SmilChr04G000879 Chr04 NC_080390.1:11171850-11171861promoter 内 2489-2500 bp + 1501 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 11173362-11175955(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGGA
SmilChr03G000807 Chr03 NC_080389.1:9230783-9230794promoter 内 2344-2355 bp + 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 9232440-9236815(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGGT
SmilChr01G001973 Chr01 NC_080387.1:35112490-35112501promoter 内 2275-2286 bp - 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 35114216-35115779(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTG
SmilChr01G001962 Chr01 NC_080387.1:34909857-34909868promoter 内 2186-2197 bp - 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 34911672-34914031(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTG
SmilChr02G000710 Chr02 NC_080388.1:11458875-11458886promoter 内 2140-2151 bp - 1850 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 11455871-11457025(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACTCACGTGGC
SmilChr03G001461 Chr03 NC_080389.1:17460082-17460093promoter 内 2047-2058 bp + 1943 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 17462036-17467359(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCTGACGTGGG
SmilChr02G003418 Chr02 NC_080388.1:55412379-55412390promoter 内 690-701 bp - 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 55406754-55409079(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGGA
SmilChr03G002006 Chr03 NC_080389.1:29970867-29970878promoter 内 284-295 bp + 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 29964010-29967161(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTC
SmilChr01G000780 Chr01 NC_080387.1:17012190-17012201promoter 内 198-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 17005209-17008398(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTC
SmilChr03G002044 Chr03 NC_080389.1:30921400-30921411promoter 内 164-175 bp - 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 30925237-30928407(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTC
SmilChr03G002047 Chr03 NC_080389.1:30984881-30984892promoter 内 162-173 bp - 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 30988720-30991890(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTC
SmilChr03G004428 Chr03 NC_080389.1:62424125-62424136promoter 内 3646-3657 bp + 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 62420524-62423781(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAGAT
SmilChr02G002826 Chr02 NC_080388.1:48365214-48365225promoter 内 3638-3649 bp + 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 48358381-48364862(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGAC
SmilChr04G000808 Chr04 NC_080390.1:10118518-10118529promoter 内 3062-3073 bp - 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 10114692-10117590(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGGA
SmilChr03G002459 Chr03 NC_080389.1:38939730-38939741promoter 内 3030-3041 bp - 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 38935585-38938770(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGGA
SmilChr01G004674 Chr01 NC_080387.1:64834708-64834719promoter 内 3027-3038 bp - 963 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 64835682-64837584(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGAG
SmilChr01G001072 Chr01 NC_080387.1:22124848-22124859promoter 内 2915-2926 bp + 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 22121188-22123773(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTG
SmilChr02G003971 Chr02 NC_080388.1:61881295-61881306promoter 内 2780-2791 bp + 1210 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 61879309-61880085(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTG
SmilChr04G003965 Chr04 NC_080390.1:55141760-55141771promoter 内 2597-2608 bp - 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 55138128-55140367(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACACGTGGC
SmilChr02G001365 Chr02 NC_080388.1:25721731-25721742promoter 内 2532-2543 bp - 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 25723200-25723790(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAGAA
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SmilChr04G003964 Chr04 NC_080390.1:55141760-55141771promoter 内 2075-2086 bp - 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 55131980-55139845(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACACGTGGC