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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 23 / 137 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001578 Chr06 NC_080392.1:17226873-17226887promoter 内 3935-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 17226939-17228422(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCCGACGACGTGGCG
SmilChr04G001585 Chr04 NC_080390.1:26339490-26339504promoter 内 984-998 bp - 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 26342507-26355706(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTAGCTGACGTGGCT
SmilChr01G005693 Chr01 NC_080387.1:73209337-73209351promoter 内 3954-3968 bp - 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 73205725-73209304(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGGCCGTT
SmilChr08G004480 Chr08 NC_080394.1:54414076-54414090promoter 内 3904-3918 bp + 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 54414173-54416642(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCCAGC
SmilChr04G003242 Chr04 NC_080390.1:49202914-49202928promoter 内 3840-3854 bp + 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 49203075-49209290(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCCTCC
SmilChr04G003338 Chr04 NC_080390.1:50052260-50052274promoter 内 3840-3854 bp + 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 50052421-50058572(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCCTCC
SmilChr08G003666 Chr08 NC_080394.1:40479343-40479357promoter 内 3760-3774 bp - 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 40475763-40479116(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCCTCC
SmilChr08G002037 Chr08 NC_080394.1:18159610-18159624promoter 内 3668-3682 bp + 319 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 18159943-18161765(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTGACCTAA
SmilChr08G003076 Chr08 NC_080394.1:30949346-30949360promoter 内 2608-2622 bp - 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 30950739-30958661(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGTTGCCACGTGGCA
SmilChr08G003334 Chr08 NC_080394.1:34636833-34636847promoter 内 1948-1962 bp - 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 34638886-34640922(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAGCTGACGTGGAA
SmilChr08G004819 Chr08 NC_080394.1:57479676-57479690promoter 内 1601-1615 bp - 2386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 57474275-57477290(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCACTATT
SmilChr08G001858 Chr08 NC_080394.1:15961466-15961480promoter 内 3944-3958 bp + 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15961523-15963989(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCCACT
SmilChr01G005786 Chr01 NC_080387.1:73946217-73946231promoter 内 3898-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 73946320-73951969(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATGATGACGTGGCT
SmilChr02G002832 Chr02 NC_080388.1:48466267-48466281promoter 内 3884-3898 bp + 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 48466384-48467903(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCCTCC
SmilChr03G000193 Chr03 NC_080389.1:2134077-2134091promoter 内 3871-3885 bp - 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 2134207-2145325(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTGCTTACGTGGCG
SmilChr02G005538 Chr02 NC_080388.1:75412285-75412299promoter 内 3584-3598 bp - 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 75408257-75411882(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGACACGTCATCACT
SmilChr07G003101 Chr07 NC_080393.1:32840861-32840875promoter 内 3526-3540 bp + 461 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 32841336-32843269(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCGCCGGC
SmilChr01G002038 Chr01 NC_080387.1:36007724-36007738promoter 内 3473-3487 bp - 514 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 36008252-36008563(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATAGTGACGTGGCA
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SmilChr05G001413 Chr05 NC_080391.1:12752598-12752612promoter 内 3050-3064 bp - 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 12753549-12754367(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCCGGCGACGTGGCC
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SmilChr07G002561 Chr07 NC_080393.1:24353030-24353044promoter 内 2263-2277 bp - 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 24349118-24351306(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGCTTA
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SmilChr01G004137 Chr01 NC_080387.1:59885873-59885887promoter 内 1596-1610 bp + 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 59881414-59883482(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCCGGCGACGTGGCC
SmilChr01G005785 Chr01 NC_080387.1:73946217-73946231promoter 内 1272-1286 bp - 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 73940626-73943502(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCATCATT
SmilChr01G003775 Chr01 NC_080387.1:56159969-56159983promoter 内 1157-1171 bp - 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 56154167-56157139(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCGCCTTT
SmilChr01G004138 Chr01 NC_080387.1:59885873-59885887promoter 内 1130-1144 bp + 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 59888744-59891578(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCGCCGGC
SmilChr02G001601 Chr02 NC_080388.1:29859697-29859711promoter 内 1119-1133 bp - 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 29854104-29856829(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCGTCGTT
SmilChr01G003481 Chr01 NC_080387.1:53369116-53369130promoter 内 899-913 bp - 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 53363761-53366028(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTCCACGTCGGCAAC
SmilChr01G004472 Chr01 NC_080387.1:62818256-62818270promoter 内 417-431 bp - 3570 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 62821840-62825865(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAAGGTGACGTGGAA
SmilChr08G001716 Chr08 NC_080394.1:14389819-14389833promoter 内 393-407 bp + 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 14393427-14395516(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGACTTC
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SmilChr04G003790 Chr04 NC_080390.1:54075689-54075703promoter 内 24-38 bp - 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54079666-54080493(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCGATCACGTGGCA
SmilChr04G004176 Chr04 NC_080390.1:56369833-56369847promoter 内 24-38 bp - 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 56362912-56365870(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCGCCGGC
SmilChr02G002867 Chr02 NC_080388.1:48846620-48846634promoter 内 1483-1497 bp + 2504 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 48826093-48844116(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr04G000493 Chr04 NC_080390.1:5380698-5380712promoter 内 377-391 bp + 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 5384322-5389410(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGCACGC
SmilChr08G004355 Chr08 NC_080394.1:53251605-53251619promoter 内 3574-3588 bp - 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 53245753-53251192(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr05G003477 Chr05 NC_080391.1:46156693-46156707promoter 内 2525-2539 bp + 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 46154175-46155231(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr08G004305 Chr08 NC_080394.1:52746816-52746830promoter 内 1629-1643 bp + 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 52741575-52744458(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr06G001381 Chr06 NC_080392.1:14457271-14457285promoter 内 755-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 14460517-14463743(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGCCTACGTGGCA
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SmilChr05G004370 Chr05 NC_080391.1:57219272-57219286promoter 内 275-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 57213480-57215560(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGGCCCACGTGGCT
SmilChr08G002066 Chr08 NC_080394.1:18537616-18537630promoter 内 3714-3728 bp - 273 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 18537903-18540785(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr08G001381 Chr08 NC_080394.1:11015369-11015383promoter 内 3689-3703 bp - 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 11005805-11015071(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGCACGC
SmilChr03G003138 Chr03 NC_080389.1:48614633-48614647promoter 内 2848-2862 bp - 1139 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 48615786-48618697(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGCCTACGTGGCA