转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 24 / 143 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003234 Chr07 NC_080393.1:34312089-34312100promoter 内 861-872 bp - 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 34304733-34308960(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr02G002005 Chr02 NC_080388.1:36195014-36195025promoter 内 813-824 bp - 3177 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 36188049-36191837(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr04G002233 Chr04 NC_080390.1:36043390-36043401promoter 内 731-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 36046660-36053627(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAGC
SmilChr05G002936 Chr05 NC_080391.1:35382514-35382525promoter 内 621-632 bp + 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35385894-35386706(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr01G004855 Chr01 NC_080387.1:66727959-66727970promoter 内 610-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 66731350-66734673(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGTT
SmilChr08G001486 Chr08 NC_080394.1:11972720-11972731promoter 内 573-584 bp - 3417 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 11963684-11969303(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr08G000086 Chr08 NC_080394.1:490950-490961promoter 内 520-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 494431-496899(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr03G001033 Chr03 NC_080389.1:12028005-12028016promoter 内 451-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 12031555-12031661(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr01G000122 Chr01 NC_080387.1:2047512-2047523promoter 内 399-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 2051114-2052985(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr03G002971 Chr03 NC_080389.1:46503284-46503295promoter 内 321-332 bp - 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 46506964-46507737(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCAC
SmilChr07G000873 Chr07 NC_080393.1:6246500-6246511promoter 内 197-208 bp - 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6250304-6253305(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCTC
SmilChr08G002419 Chr08 NC_080394.1:22995417-22995428promoter 内 163-174 bp - 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 22983495-22991590(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr08G000925 Chr08 NC_080394.1:6827168-6827179promoter 内 152-163 bp - 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6831017-6834446(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCAC
SmilChr01G006138 Chr01 NC_080387.1:76886873-76886884promoter 内 75-86 bp - 3915 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 76890799-76892272(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr01G000120 Chr01 NC_080387.1:2047512-2047523promoter 内 5-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 2043018-2043527(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr07G000854 Chr07 NC_080393.1:6079998-6080009promoter 内 792-803 bp - 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 6083207-6091922(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCT
SmilChr03G001196 Chr03 NC_080389.1:13781475-13781486promoter 内 3421-3432 bp + 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 13777504-13780906(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAA
SmilChr03G000590 Chr03 NC_080389.1:6565510-6565521promoter 内 2267-2278 bp + 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 6567244-6570284(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr05G002692 Chr05 NC_080391.1:30647795-30647806promoter 内 1333-1344 bp + 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 30643519-30645138(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAC
SmilChr06G000279 Chr06 NC_080392.1:1930748-1930759promoter 内 1140-1151 bp - 2850 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 1927180-1927898(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr06G000130 Chr06 NC_080392.1:922231-922242promoter 内 3984-3995 bp - 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 922248-929003(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAA
SmilChr06G000280 Chr06 NC_080392.1:1930748-1930759promoter 内 3955-3966 bp - 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 1929024-1930713(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr05G001749 Chr05 NC_080391.1:17033751-17033762promoter 内 3731-3742 bp - 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 17034021-17036216(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCTC
SmilChr01G005715 Chr01 NC_080387.1:73359562-73359573promoter 内 3625-3636 bp + 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 73356046-73359197(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAA
SmilChr02G000638 Chr02 NC_080388.1:9669667-9669678promoter 内 3446-3457 bp + 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 9664075-9669123(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCT
SmilChr01G001489 Chr01 NC_080387.1:28670191-28670202promoter 内 3271-3282 bp + 719 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 28670921-28673589(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr05G001761 Chr05 NC_080391.1:17319448-17319459promoter 内 3241-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 17320208-17321899(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCTC
SmilChr05G003586 Chr05 NC_080391.1:47912703-47912714promoter 内 3142-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 47913562-47919109(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAA
SmilChr07G003602 Chr07 NC_080393.1:42147208-42147219promoter 内 3082-3093 bp - 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 42148127-42152944(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAA
SmilChr01G000495 Chr01 NC_080387.1:10098505-10098516promoter 内 2752-2763 bp + 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 10099754-10101707(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTG
SmilChr02G003614 Chr02 NC_080388.1:57380175-57380186promoter 内 2486-2497 bp - 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 57373768-57378671(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGGA
SmilChr02G004216 Chr02 NC_080388.1:64397133-64397144promoter 内 2434-2445 bp + 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 64391702-64395577(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCTC
SmilChr05G001939 Chr05 NC_080391.1:19756539-19756550promoter 内 2269-2280 bp - 1721 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 19751612-19754818(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGAG
SmilChr03G000204 Chr03 NC_080389.1:2301432-2301443promoter 内 2187-2198 bp + 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 2303246-2315523(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr04G000139 Chr04 NC_080390.1:1191626-1191637promoter 内 2093-2104 bp - 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 1188095-1189729(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr06G000129 Chr06 NC_080392.1:922231-922242promoter 内 1950-1961 bp - 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 912905-920191(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr01G004241 Chr01 NC_080387.1:60716903-60716914promoter 内 1874-1885 bp + 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 60719030-60723206(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGAG
SmilChr02G002704 Chr02 NC_080388.1:46890050-46890061promoter 内 1635-1646 bp - 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 46882839-46887695(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr05G001498 Chr05 NC_080391.1:13751539-13751550promoter 内 1612-1623 bp - 2378 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 13753928-13755172(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCT
SmilChr04G001952 Chr04 NC_080390.1:31720082-31720093promoter 内 1611-1622 bp + 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 31722472-31724124(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGTT
SmilChr02G004109 Chr02 NC_080388.1:63386004-63386015promoter 内 1438-1449 bp + 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 63388567-63394413(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGAT
SmilChr01G006167 Chr01 NC_080387.1:77161490-77161501promoter 内 1425-1436 bp + 2565 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 77164066-77165735(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr07G001782 Chr07 NC_080393.1:15124729-15124740promoter 内 1160-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 15127570-15129172(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGTT
SmilChr07G003491 Chr07 NC_080393.1:39527522-39527533promoter 内 1153-1164 bp + 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 39519406-39524685(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTAAC
SmilChr01G000572 Chr01 NC_080387.1:11867792-11867803promoter 内 1152-1163 bp - 2838 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 11861723-11864954(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGG
SmilChr04G001623 Chr04 NC_080390.1:27001692-27001703promoter 内 978-989 bp + 3012 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 26994654-26998680(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAA
SmilChr01G005826 Chr01 NC_080387.1:74259757-74259768promoter 内 964-975 bp + 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 74262794-74267868(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr04G001624 Chr04 NC_080390.1:27001692-27001703promoter 内 789-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 27004904-27011019(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTA
SmilChr05G003900 Chr05 NC_080391.1:52755904-52755915promoter 内 711-722 bp + 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 52750239-52752625(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAA
SmilChr02G002079 Chr02 NC_080388.1:37377825-37377836promoter 内 483-494 bp + 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 37372666-37374318(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCT