转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 27 / 130 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003987 Chr01 NC_080387.1:58299862-58299874promoter 内 999-1011 bp + 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 58302864-58303077(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATACT
SmilChr02G005060 Chr02 NC_080388.1:72294162-72294174promoter 内 996-1008 bp + 2993 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 72297167-72298973(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAAGAATATGCC
SmilChr01G002413 Chr01 NC_080387.1:41497891-41497903promoter 内 855-867 bp - 3134 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 41501037-41504490(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTATT
SmilChr01G005392 Chr01 NC_080387.1:71211184-71211196promoter 内 763-775 bp - 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71205989-71207958(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATACT
SmilChr01G003628 Chr01 NC_080387.1:54823877-54823889promoter 内 698-710 bp - 3291 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 54817452-54820586(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGGGAATATTTC
SmilChr02G004023 Chr02 NC_080388.1:62522544-62522556promoter 内 554-566 bp + 3435 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 62518392-62519109(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCCCTC
SmilChr01G003645 Chr01 NC_080387.1:54941406-54941418promoter 内 540-552 bp - 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 54934911-54937957(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAGGGAATATTTC
SmilChr02G002232 Chr02 NC_080388.1:39671403-39671415promoter 内 434-446 bp - 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 39665191-39667848(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATCCT
SmilChr02G002926 Chr02 NC_080388.1:49662625-49662637promoter 内 416-428 bp - 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 49666210-49667026(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTTTG
SmilChr02G001079 Chr02 NC_080388.1:19342933-19342945promoter 内 352-364 bp - 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 19336612-19339296(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATCCT
SmilChr01G000531 Chr01 NC_080387.1:10844352-10844364promoter 内 300-312 bp - 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 10837853-10840663(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATCCT
SmilChr02G003104 Chr02 NC_080388.1:51963108-51963120promoter 内 197-209 bp - 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 51966912-51969101(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCCTTT
SmilChr02G002552 Chr02 NC_080388.1:44418409-44418421promoter 内 128-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 44412869-44414548(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCAGAATATCCT
SmilChr01G001653 Chr01 NC_080387.1:30585384-30585396promoter 内 1935-1947 bp + 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 30587450-30600951(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATGCT
SmilChr02G004521 Chr02 NC_080388.1:67738975-67738987promoter 内 1413-1425 bp - 2576 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 67734728-67736399(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAAGAATATGCC
SmilChr03G001907 Chr03 NC_080389.1:26690692-26690704promoter 内 3887-3899 bp - 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 26690806-26691552(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGATATTCTCGT
SmilChr01G001319 Chr01 NC_080387.1:26219530-26219542promoter 内 3516-3528 bp + 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 26216407-26219057(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGCATATTCTATT
SmilChr02G004637 Chr02 NC_080388.1:68832284-68832296promoter 内 2757-2769 bp + 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 68830047-68831052(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCTGTT
SmilChr01G005572 Chr01 NC_080387.1:72479004-72479016promoter 内 1388-1400 bp - 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 72481617-72483066(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTTTA
SmilChr01G005436 Chr01 NC_080387.1:71496274-71496286promoter 内 1093-1105 bp - 2896 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 71499182-71500235(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTTTA
SmilChr01G004366 Chr01 NC_080387.1:61848417-61848429promoter 内 866-878 bp + 3123 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 61844665-61845294(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGATATTCTGCA
SmilChr02G001597 Chr02 NC_080388.1:29814614-29814626promoter 内 515-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 29808667-29811140(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAAGAATATACT
SmilChr01G003033 Chr01 NC_080387.1:49358803-49358815promoter 内 140-152 bp + 3849 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 49362664-49366686(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAGGGAATATTCA
SmilChr03G000032 Chr03 NC_080389.1:402493-402505promoter 内 3908-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 399639-402412(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTGAGTATATTCC
SmilChr03G001138 Chr03 NC_080389.1:13098830-13098842promoter 内 3294-3306 bp + 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 13099537-13103091(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAAGAATATGCC
SmilChr01G000609 Chr01 NC_080387.1:13463976-13463988promoter 内 3112-3124 bp - 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 13460631-13463099(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAAGAATATACT
SmilChr01G005497 Chr01 NC_080387.1:71874916-71874928promoter 内 3102-3114 bp + 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 71870273-71874029(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCTGTT
SmilChr01G002232 Chr01 NC_080387.1:38798041-38798053promoter 内 3037-3049 bp - 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 38799005-38801879(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTGTC
SmilChr01G000219 Chr01 NC_080387.1:3859929-3859941promoter 内 2938-2950 bp + 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3854243-3858878(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTTTA
SmilChr01G002216 Chr01 NC_080387.1:38488586-38488598promoter 内 2881-2893 bp - 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 38489706-38492423(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTGTC
SmilChr03G000268 Chr03 NC_080389.1:3098946-3098958promoter 内 2774-2786 bp - 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3094510-3097731(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTGAGTATATTCC
SmilChr01G005098 Chr01 NC_080387.1:68806542-68806554promoter 内 2501-2513 bp - 1488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 68802452-68805054(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GACAGAATATCCT
SmilChr01G001302 Chr01 NC_080387.1:25935171-25935183promoter 内 2383-2395 bp - 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 25929596-25933565(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGCAGAATATCCC
SmilChr01G002490 Chr01 NC_080387.1:42621210-42621222promoter 内 2264-2276 bp + 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 42615577-42619485(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTATATTCTATA
SmilChr02G000048 Chr02 NC_080388.1:648635-648647promoter 内 2123-2135 bp + 1866 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 650513-656626(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TATAGAATATCCC
SmilChr02G000173 Chr02 NC_080388.1:2219946-2219958promoter 内 2100-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 2211989-2218057(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TATAGAATATCCC
SmilChr01G002278 Chr01 NC_080387.1:39546018-39546030promoter 内 2095-2107 bp + 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 39547924-39548787(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGCAGAATATCCC
SmilChr01G002042 Chr01 NC_080387.1:36096335-36096347promoter 内 1939-1951 bp + 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 36091412-36094285(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGATATTCTGCA
SmilChr02G002671 Chr02 NC_080388.1:46287437-46287449promoter 内 1700-1712 bp + 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 46289738-46291631(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGCAGAATATCCC
SmilChr01G003031 Chr01 NC_080387.1:49358803-49358815promoter 内 1232-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49353674-49356046(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCCCTG
SmilChr01G001229 Chr01 NC_080387.1:24577556-24577568promoter 内 1083-1095 bp + 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 24569064-24574650(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGATATTCTGCA
SmilChr02G004791 Chr02 NC_080388.1:70110406-70110418promoter 内 963-975 bp - 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 70113444-70114579(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGATATTCTATA
SmilChr02G002358 Chr02 NC_080388.1:41362397-41362409promoter 内 916-928 bp + 3073 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 41365482-41368906(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAGGGAATATTCA
SmilChr01G001318 Chr01 NC_080387.1:26219530-26219542promoter 内 851-863 bp + 3138 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 26215736-26216392(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGCATATTCTATT
SmilChr02G003012 Chr02 NC_080388.1:50811296-50811308promoter 内 144-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 50804113-50807451(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTATATTCTATA
SmilChr02G002276 Chr02 NC_080388.1:40211222-40211234promoter 内 134-146 bp - 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 40215089-40215653(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTTTA
SmilChr01G002213 Chr01 NC_080387.1:38488586-38488598promoter 内 22-34 bp - 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 38481612-38484619(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GACAGAATATCCT
SmilChr01G002230 Chr01 NC_080387.1:38798041-38798053promoter 内 22-34 bp - 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 38791046-38794074(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GACAGAATATCCT
SmilChr02G005185 Chr02 NC_080388.1:73167699-73167711promoter 内 3809-3821 bp + 180 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 73167891-73170879(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATGAGAATATACT
SmilChr02G004051 Chr02 NC_080388.1:62839964-62839976promoter 内 3489-3501 bp + 500 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 62836145-62839464(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTCTC