转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003833; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013392-RA_Salv SmilChr02G003833 MYB XP_057794421.1 MP00476 TAACCGTAATA

可能结合的靶基因

9904 个结合位点 7981 个候选靶基因 第 28 / 160 下载 TSV

上一页 28 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002252 Chr04 NC_080390.1:36490749-36490759promoter 内 324-334 bp - 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 36483905-36487082(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTAATA
SmilChr01G000012 Chr01 NC_080387.1:278267-278277promoter 内 323-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 271082-274599(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTATCA
SmilChr03G001215 Chr03 NC_080389.1:13968251-13968261promoter 内 316-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 13971936-13972914(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTTCA
SmilChr05G001299 Chr05 NC_080391.1:11209480-11209490promoter 内 310-320 bp + 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 11213171-11220589(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTAAAA
SmilChr08G001977 Chr08 NC_080394.1:17440248-17440258promoter 内 302-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 17443947-17444431(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTAAAA
SmilChr02G001032 Chr02 NC_080388.1:18261271-18261281promoter 内 280-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 18264992-18268102(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTATCA
SmilChr07G001994 Chr07 NC_080393.1:17611616-17611626promoter 内 249-259 bp - 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 17615368-17619499(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTTTACGGTTG
SmilChr02G003705 Chr02 NC_080388.1:58581490-58581500promoter 内 245-255 bp + 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 58576139-58577744(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTTTACGGTTG
SmilChr06G002128 Chr06 NC_080392.1:28620060-28620070promoter 内 237-247 bp + 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 28623824-28623930(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTTC
SmilChr07G003489 Chr07 NC_080393.1:39464107-39464117promoter 内 235-245 bp - 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 39458740-39460351(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTAATA
SmilChr03G001333 Chr03 NC_080389.1:15566235-15566245promoter 内 232-242 bp - 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 15559588-15562476(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTAC
SmilChr07G002085 Chr07 NC_080393.1:18967027-18967037promoter 内 227-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 18970801-18971935(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTAAAA
SmilChr02G000278 Chr02 NC_080388.1:3561540-3561550promoter 内 222-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 3555896-3557771(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTAAAA
SmilChr05G000408 Chr05 NC_080391.1:3086578-3086588promoter 内 214-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 3074322-3082801(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TGAAACGGTTA
SmilChr01G001152 Chr01 NC_080387.1:23472011-23472021promoter 内 158-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 23475854-23482002(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTATCA
SmilChr03G001356 Chr03 NC_080389.1:15932343-15932353promoter 内 151-161 bp - 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 15927053-15928503(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAGA
SmilChr08G001939 Chr08 NC_080394.1:17028336-17028346promoter 内 143-153 bp + 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 17023351-17024488(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 GAAGACGGTTA
SmilChr06G002312 Chr06 NC_080392.1:33394381-33394391promoter 内 139-149 bp + 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 33398243-33401510(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTATCA
SmilChr02G004371 Chr02 NC_080388.1:66047556-66047566promoter 内 98-108 bp + 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 66042505-66043663(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTTTACGGTTG
SmilChr03G001480 Chr03 NC_080389.1:17856230-17856240promoter 内 91-101 bp - 3900 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 17849127-17852330(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTATCA
SmilChr04G003849 Chr04 NC_080390.1:54480696-54480706promoter 内 73-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 54484624-54487324(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTTTACGGTTG
SmilChr02G000239 Chr02 NC_080388.1:3103764-3103774promoter 内 41-51 bp - 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 3099708-3099814(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTTC
SmilChr07G000133 Chr07 NC_080393.1:784340-784350promoter 内 41-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 788300-789816(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTAAAA
SmilChr03G000765 Chr03 NC_080389.1:8744843-8744853promoter 内 38-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 8748806-8752097(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTATCA
SmilChr07G001129 Chr07 NC_080393.1:8461454-8461464promoter 内 32-42 bp - 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 8465423-8468774(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTTTACGGTTG
SmilChr01G002293 Chr01 NC_080387.1:39775789-39775799promoter 内 31-41 bp - 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 39762061-39771829(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTATCA
SmilChr02G002135 Chr02 NC_080388.1:38468997-38469007promoter 内 28-38 bp + 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 38464018-38465034(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TGATACGGTTG
SmilChr02G004368 Chr02 NC_080388.1:65980795-65980805promoter 内 23-33 bp + 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 65974899-65976827(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTTTACGGTTG
SmilChr07G004568 Chr07 NC_080393.1:58480547-58480557promoter 内 6-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 58473329-58476562(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTATCA
SmilChr07G003802 Chr07 NC_080393.1:46819845-46819855promoter 内 3706-3716 bp + 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 6 46820140-46821456(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTAAA
SmilChr05G001562 Chr05 NC_080391.1:14304224-14304234promoter 内 2540-2550 bp - 1451 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 5 14300146-14302773(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTATA
SmilChr01G001723 Chr01 NC_080387.1:31775077-31775087promoter 内 3705-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 31774114-31774791(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTAAA
SmilChr01G001800 Chr01 NC_080387.1:32915766-32915776promoter 内 3705-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 32914803-32915480(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTAAA
SmilChr07G003911 Chr07 NC_080393.1:49343137-49343147promoter 内 3570-3580 bp + 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 49331621-49342716(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TATAACGGTTA
SmilChr01G002510 Chr01 NC_080387.1:42996255-42996265promoter 内 3873-3883 bp + 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 42996383-43000308(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTATA
SmilChr01G001081 Chr01 NC_080387.1:22235042-22235052promoter 内 3765-3775 bp + 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 22235278-22236773(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTAAA
SmilChr03G000327 Chr03 NC_080389.1:3733591-3733601promoter 内 3725-3735 bp - 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 3733867-3734983(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TATAACGGTTA
SmilChr06G000492 Chr06 NC_080392.1:4029350-4029360promoter 内 3648-3658 bp + 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 4025325-4029007(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TATAACGGTTA
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SmilChr03G002048 Chr03 NC_080389.1:31008966-31008976promoter 内 3504-3514 bp - 487 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 31009463-31012396(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TATAACGGTTA
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SmilChr02G002370 Chr02 NC_080388.1:41502968-41502978promoter 内 3099-3109 bp + 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 41503870-41505828(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTATA
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SmilChr01G001392 Chr01 NC_080387.1:27377039-27377049promoter 内 2155-2165 bp - 1836 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 27372506-27375203(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTATA
SmilChr08G000985 Chr08 NC_080394.1:7384556-7384566promoter 内 2053-2063 bp - 1938 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 7381473-7382618(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 CAACCGTAACT
SmilChr04G000418 Chr04 NC_080390.1:4415461-4415471promoter 内 1648-1658 bp + 2343 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 4417814-4419641(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTTATA