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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 29 / 141 下载 TSV

上一页 29 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003056 Chr05 NC_080391.1:38379836-38379850promoter 内 2617-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 38381220-38381576(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCGTCGGTGAGGC
SmilChr05G002657 Chr05 NC_080391.1:30075540-30075554promoter 内 1113-1127 bp - 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 30071236-30072666(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr03G001704 Chr03 NC_080389.1:22638200-22638214promoter 内 221-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 22632393-22634434(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCGTCGGTGAGGC
SmilChr01G003949 Chr01 NC_080387.1:57874460-57874474promoter 内 3725-3739 bp - 262 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 57874736-57878256(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr08G000028 Chr08 NC_080394.1:184957-184971promoter 内 3534-3548 bp - 453 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 185424-189535(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr07G000592 Chr07 NC_080393.1:4039024-4039038promoter 内 3468-3482 bp - 519 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 4032483-4038505(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr08G000027 Chr08 NC_080394.1:184957-184971promoter 内 3235-3249 bp - 752 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 179349-184205(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr08G003971 Chr08 NC_080394.1:47729868-47729882promoter 内 2864-2878 bp + 1123 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 47731005-47732498(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr01G003838 Chr01 NC_080387.1:56734600-56734614promoter 内 2826-2840 bp + 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 56729916-56733439(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGGCACCGACAGAA
SmilChr03G001497 Chr03 NC_080389.1:18279003-18279017promoter 内 2374-2388 bp + 1613 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 18280630-18288688(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr07G000553 Chr07 NC_080393.1:3815936-3815950promoter 内 2159-2173 bp - 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 3811121-3814108(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr08G001749 Chr08 NC_080394.1:14712906-14712920promoter 内 1720-1734 bp - 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 14715187-14719858(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr01G002137 Chr01 NC_080387.1:37353836-37353850promoter 内 1604-1618 bp + 2383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 37346822-37351453(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr08G000287 Chr08 NC_080394.1:1958901-1958915promoter 内 1518-1532 bp + 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 1954142-1956432(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr05G004325 Chr05 NC_080391.1:56904455-56904469promoter 内 1442-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 56907014-56908601(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr05G004252 Chr05 NC_080391.1:56316851-56316865promoter 内 1417-1431 bp + 2570 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 56319435-56322856(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr02G001950 Chr02 NC_080388.1:35183512-35183526promoter 内 580-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 35186933-35203320(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCGTCGGTGAGGC
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SmilChr04G000151 Chr04 NC_080390.1:1326292-1326306promoter 内 301-315 bp + 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 1318684-1322606(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr01G001705 Chr01 NC_080387.1:31487127-31487141promoter 内 256-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 31481695-31483396(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATGCACCGACACAC
SmilChr02G001705 Chr02 NC_080388.1:31360791-31360805promoter 内 3573-3587 bp - 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 31361219-31369495(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr02G002064 Chr02 NC_080388.1:37202274-37202288promoter 内 3563-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 37199198-37201850(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr08G004564 Chr08 NC_080394.1:55245889-55245903promoter 内 3412-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 55242514-55245314(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
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SmilChr02G000925 Chr02 NC_080388.1:16072694-16072708promoter 内 3047-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 16073648-16081123(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr07G000627 Chr07 NC_080393.1:4235000-4235014promoter 内 2942-2956 bp - 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 4232362-4233955(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr01G003607 Chr01 NC_080387.1:54612564-54612578promoter 内 2837-2851 bp + 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 54610428-54611414(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr01G004256 Chr01 NC_080387.1:60833483-60833497promoter 内 2809-2823 bp - 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 60834675-60835611(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr01G000955 Chr01 NC_080387.1:20208637-20208651promoter 内 2711-2725 bp + 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 20209927-20213471(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr03G004269 Chr03 NC_080389.1:61171803-61171817promoter 内 2641-2655 bp + 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 61165887-61170457(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr04G002900 Chr04 NC_080390.1:45271971-45271985promoter 内 2594-2608 bp - 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 45273378-45273800(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr08G003339 Chr08 NC_080394.1:34701501-34701515promoter 内 2501-2515 bp - 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 34703001-34707305(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr06G000327 Chr06 NC_080392.1:2399556-2399570promoter 内 2286-2300 bp - 1701 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 2396356-2397855(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGCTGTCGGTGTTGG
SmilChr02G002446 Chr02 NC_080388.1:42691101-42691115promoter 内 2216-2230 bp - 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 42688073-42689330(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
SmilChr03G003236 Chr03 NC_080389.1:50261856-50261870promoter 内 2137-2151 bp + 1850 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 50263720-50268385(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGG
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SmilChr08G002009 Chr08 NC_080394.1:17852315-17852329promoter 内 1975-1989 bp + 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 17854341-17855799(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGACGTCGGTGAGGG
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SmilChr02G004005 Chr02 NC_080388.1:62377337-62377351promoter 内 1587-1601 bp - 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 62379751-62380769(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGGCACCGACGGCT
SmilChr05G001651 Chr05 NC_080391.1:15561411-15561425promoter 内 1406-1420 bp - 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 15556863-15558830(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CACTGTCGGTGCCTC
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SmilChr03G004270 Chr03 NC_080389.1:61171803-61171817promoter 内 321-335 bp + 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 61166084-61168137(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCG
SmilChr06G000326 Chr06 NC_080392.1:2399556-2399570promoter 内 172-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 2394247-2395741(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGCTGTCGGTGTTGG
SmilChr08G004849 Chr08 NC_080394.1:57717351-57717365promoter 内 3950-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57714611-57717314(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAATCACCGACAACA