转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 30 / 151 下载 TSV

上一页 30 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003463 Chr04 NC_080390.1:51107138-51107150promoter 内 295-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 51110844-51121902(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCAGT
SmilChr04G002928 Chr04 NC_080390.1:45545508-45545520promoter 内 3976-3988 bp - 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 45545533-45546438(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTAGTAGGTAGC
SmilChr02G004898 Chr02 NC_080388.1:70998859-70998871promoter 内 3899-3911 bp + 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 70998961-71000673(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTGTT
SmilChr01G003651 Chr01 NC_080387.1:54970363-54970375promoter 内 1733-1745 bp + 2256 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 54972631-54975991(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTGTT
SmilChr03G000250 Chr03 NC_080389.1:2941816-2941828promoter 内 1581-1593 bp + 2408 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 2944236-2951268(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTGG
SmilChr04G002733 Chr04 NC_080390.1:42998281-42998293promoter 内 107-119 bp - 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 43002175-43002248(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGGTAGGTGCG
SmilChr04G002118 Chr04 NC_080390.1:34166167-34166179promoter 内 3763-3775 bp + 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 34166405-34170446(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTAG
SmilChr02G000009 Chr02 NC_080388.1:70070-70082promoter 内 3652-3664 bp - 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 70419-73585(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAATTAGGTAAG
SmilChr04G003849 Chr04 NC_080390.1:54483920-54483932promoter 内 3297-3309 bp - 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 54484624-54487324(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAG
SmilChr05G000459 Chr05 NC_080391.1:3474516-3474528promoter 内 3074-3086 bp + 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3470204-3473601(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTAGTAGGTAAA
SmilChr05G001012 Chr05 NC_080391.1:8306116-8306128promoter 内 2226-2238 bp + 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 8302989-8304353(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTGAC
SmilChr04G000635 Chr04 NC_080390.1:7216496-7216508promoter 内 2117-2129 bp - 1872 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7211092-7214624(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCAGT
SmilChr02G001951 Chr02 NC_080388.1:35214929-35214941promoter 内 1846-1858 bp - 2143 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 35211877-35212786(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTACC
SmilChr03G004100 Chr03 NC_080389.1:59884165-59884177promoter 内 1696-1708 bp + 2293 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 59886470-59902314(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCGTG
SmilChr05G000911 Chr05 NC_080391.1:7226477-7226489promoter 内 1585-1597 bp - 2404 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7228893-7230180(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACAGTAGGTAGG
SmilChr05G000974 Chr05 NC_080391.1:7875348-7875360promoter 内 1304-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7878045-7879089(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACAGTAGGTAGG
SmilChr01G002778 Chr01 NC_080387.1:46246509-46246521promoter 内 1052-1064 bp + 2937 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 46249458-46250993(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTAAC
SmilChr04G002117 Chr04 NC_080390.1:34166167-34166179promoter 内 992-1004 bp + 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 34161536-34163170(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAGGTAGGTGGC
SmilChr03G000014 Chr03 NC_080389.1:139789-139801promoter 内 201-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 143589-147616(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAATTAGGTAAG
SmilChr02G001327 Chr02 NC_080388.1:24743410-24743422promoter 内 2439-2451 bp + 1550 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 24738717-24741860(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGGTTAGGTAAG
SmilChr03G003459 Chr03 NC_080389.1:52968648-52968660promoter 内 1674-1686 bp + 2315 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 52970975-52976716(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACCCTG
SmilChr05G001444 Chr05 NC_080391.1:13190601-13190613promoter 内 466-478 bp - 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 13184673-13187078(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCACCTACCTCT
SmilChr01G001657 Chr01 NC_080387.1:30639458-30639470promoter 内 3625-3637 bp - 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 30639834-30641550(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTTAGGTAAA
SmilChr01G006111 Chr01 NC_080387.1:76650094-76650106promoter 内 3496-3508 bp - 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 76650599-76651828(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTGGGTAGGTAGA
SmilChr03G002559 Chr03 NC_080389.1:40746617-40746629promoter 内 3478-3490 bp + 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 40747140-40750800(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCACCTACCCTC
SmilChr05G001845 Chr05 NC_080391.1:18481149-18481161promoter 内 2513-2525 bp - 1476 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 18482637-18483512(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAGA
SmilChr05G001008 Chr05 NC_080391.1:8285410-8285422promoter 内 2275-2287 bp - 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 8280302-8283696(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTATA
SmilChr03G002557 Chr03 NC_080389.1:40746617-40746629promoter 内 1849-1861 bp + 2140 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 40741252-40744477(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGGGTAGGTGCA
SmilChr04G001525 Chr04 NC_080390.1:25174512-25174524promoter 内 1779-1791 bp - 2210 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 25171119-25172302(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTTTA
SmilChr04G000539 Chr04 NC_080390.1:5997668-5997680promoter 内 1768-1780 bp + 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 5999901-6020574(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTTTA
SmilChr04G003667 Chr04 NC_080390.1:53121543-53121555promoter 内 1408-1420 bp - 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 53114874-53118962(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACCCTG
SmilChr01G000132 Chr01 NC_080387.1:2220975-2220987promoter 内 1160-1172 bp - 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 2216359-2218146(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTCA
SmilChr01G004316 Chr01 NC_080387.1:61352041-61352053promoter 内 792-804 bp + 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 61331580-61348844(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTTAGGTAAA
SmilChr04G001186 Chr04 NC_080390.1:18106119-18106131promoter 内 147-159 bp + 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 18109973-18112965(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTCA
SmilChr05G001953 Chr05 NC_080391.1:19979908-19979920promoter 内 3863-3875 bp - 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 19976654-19979782(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACACA
SmilChr04G000779 Chr04 NC_080390.1:9537486-9537498promoter 内 3862-3874 bp - 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 9531284-9537359(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTTA
SmilChr01G004317 Chr01 NC_080387.1:61352041-61352053promoter 内 3691-3703 bp + 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 61350831-61351743(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTTAGGTAAA
SmilChr01G005580 Chr01 NC_080387.1:72519886-72519898promoter 内 3637-3649 bp - 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 72520250-72520370(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAGA
SmilChr01G001620 Chr01 NC_080387.1:30303618-30303630promoter 内 3514-3526 bp - 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 30300687-30303143(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCAAG
SmilChr01G001629 Chr01 NC_080387.1:30358957-30358969promoter 内 3335-3347 bp + 654 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 30359623-30362373(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTTTA
SmilChr03G004240 Chr03 NC_080389.1:60933183-60933195promoter 内 3086-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 60928567-60932280(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGGTAGGTAGC
SmilChr01G002024 Chr01 NC_080387.1:35795895-35795907promoter 内 3072-3084 bp + 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 35793992-35794978(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAAGTAGGTAGA
SmilChr04G001808 Chr04 NC_080390.1:29565041-29565053promoter 内 3031-3043 bp - 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 29566011-29569111(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCGGTAGGTGGC
SmilChr01G002050 Chr01 NC_080387.1:36316845-36316857promoter 内 3022-3034 bp - 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 36317824-36318761(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAAGTAGGTAGA
SmilChr05G000127 Chr05 NC_080391.1:1020196-1020208promoter 内 2987-2999 bp + 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 1021210-1024350(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACTCA
SmilChr03G000985 Chr03 NC_080389.1:11160495-11160507promoter 内 2934-2946 bp - 1055 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 11161562-11164787(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTTAGGTAAA
SmilChr03G000511 Chr03 NC_080389.1:5502354-5502366promoter 内 2930-2942 bp - 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 5503425-5506651(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTTAGGTAAA
SmilChr03G002032 Chr03 NC_080389.1:30464434-30464446promoter 内 2813-2825 bp + 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 30459959-30463258(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAAGTAGGTAAA
SmilChr04G001851 Chr04 NC_080390.1:30174416-30174428promoter 内 2777-2789 bp - 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 30175640-30177631(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAAA
SmilChr02G001674 Chr02 NC_080388.1:30999394-30999406promoter 内 2740-2752 bp - 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 30995524-30998145(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTTTA