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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004246; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021799-RA_Salv SmilChr08G004246 WRKY XP_057780410.1 MP00422 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9791 个结合位点 6535 个候选靶基因 第 30 / 131 下载 TSV

上一页 30 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000546 Chr03 NC_080389.1:5925547-5925559promoter 内 517-529 bp + 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 5920385-5922075(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAGTTGACTTCA
SmilChr02G002877 Chr02 NC_080388.1:49034930-49034942promoter 内 243-255 bp + 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 49038688-49045424(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAATGT
SmilChr01G005861 Chr01 NC_080387.1:74550057-74550069promoter 内 234-246 bp - 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 74534652-74546302(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAATGT
SmilChr01G002800 Chr01 NC_080387.1:46488383-46488395promoter 内 193-205 bp - 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 46492191-46494360(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TCAGTTGACTATT
SmilChr03G000101 Chr03 NC_080389.1:1128913-1128925promoter 内 162-174 bp - 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 1122336-1125086(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAAGTCAACTTA
SmilChr02G001121 Chr02 NC_080388.1:20212860-20212872promoter 内 29-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 20206755-20208900(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GGCTTTGACTTCT
SmilChr02G001533 Chr02 NC_080388.1:28599063-28599075promoter 内 3951-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28598548-28599025(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CCCTTTGACTTTC
SmilChr03G000196 Chr03 NC_080389.1:2222869-2222881promoter 内 3947-3959 bp - 42 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2222923-2228958(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ACATTTGACTTTT
SmilChr01G002045 Chr01 NC_080387.1:36195244-36195256promoter 内 3936-3948 bp + 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36195309-36197167(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AATAGTCAACTTT
SmilChr01G001043 Chr01 NC_080387.1:21678090-21678102promoter 内 3810-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21673892-21677911(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GTTGTTGACTTTA
SmilChr01G002334 Chr01 NC_080387.1:40500148-40500160promoter 内 3810-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40495964-40499969(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GTTGTTGACTTTA
SmilChr01G002031 Chr01 NC_080387.1:35891066-35891078promoter 内 3786-3798 bp - 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 35889237-35890863(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AATAGTCAACTTT
SmilChr02G000656 Chr02 NC_080388.1:9969728-9969740promoter 内 3562-3574 bp + 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 9968660-9969301(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAGTTGACTTCA
SmilChr01G001574 Chr01 NC_080387.1:29786510-29786522promoter 内 3482-3494 bp + 507 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 29787029-29788408(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAATGT
SmilChr02G004942 Chr02 NC_080388.1:71366187-71366199promoter 内 3347-3359 bp + 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71366841-71374911(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GTAAGTCAACTGC
SmilChr01G005716 Chr01 NC_080387.1:73365539-73365551promoter 内 3322-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 73366218-73368088(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GCCGTTGACATTT
SmilChr01G004507 Chr01 NC_080387.1:63167750-63167762promoter 内 3144-3156 bp - 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63168607-63170690(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GTGGTTGACTTAT
SmilChr02G004858 Chr02 NC_080388.1:70721466-70721478promoter 内 3078-3090 bp + 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 70719282-70720555(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GTTGTTGACTTTA
SmilChr02G000457 Chr02 NC_080388.1:6100081-6100093promoter 内 2803-2815 bp + 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6101279-6102811(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TAAGGTCAACGTG
SmilChr02G000061 Chr02 NC_080388.1:777827-777839promoter 内 2576-2588 bp + 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 776342-776414(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAGTTGACTATT
SmilChr02G000456 Chr02 NC_080388.1:6100081-6100093promoter 内 1922-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6093714-6098014(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CACGTTGACCTTA
SmilChr02G005550 Chr02 NC_080388.1:75474496-75474508promoter 内 1659-1671 bp - 2330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 75476838-75489011(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TCAGTTGACTATT
SmilChr02G001508 Chr02 NC_080388.1:28104557-28104569promoter 内 1477-1489 bp - 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28107081-28108787(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ACATTTGACTTTT
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SmilChr02G002608 Chr02 NC_080388.1:45242872-45242884promoter 内 918-930 bp - 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 45237515-45239801(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAATGT
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SmilChr03G000706 Chr03 NC_080389.1:7858603-7858615promoter 内 841-853 bp - 3148 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7861763-7864719(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ACATTTGACTTTT
SmilChr02G004857 Chr02 NC_080388.1:70721466-70721478promoter 内 314-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 70711405-70717791(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GTTGTTGACTTTA
SmilChr01G004808 Chr01 NC_080387.1:66303764-66303776promoter 内 249-261 bp - 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 66295259-66300024(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAATGT
SmilChr02G002373 Chr02 NC_080388.1:41561317-41561329promoter 内 40-52 bp + 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 41549344-41557368(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ACATTTGACTTTT
SmilChr01G001593 Chr01 NC_080387.1:30008207-30008219promoter 内 3808-3820 bp - 181 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 30004775-30008026(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GAAAGTCAACAAA
SmilChr02G000790 Chr02 NC_080388.1:12990923-12990935promoter 内 3571-3583 bp + 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 12991353-12997293(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GAAAGTCAACAAA
SmilChr01G001594 Chr01 NC_080387.1:30008207-30008219promoter 内 3241-3253 bp - 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 30008967-30010165(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TTTGTTGACTTTC
SmilChr01G000241 Chr01 NC_080387.1:4497109-4497121promoter 内 3214-3226 bp + 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 4497896-4500637(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAAGTCAAAGCT
SmilChr02G001468 Chr02 NC_080388.1:27409446-27409458promoter 内 3841-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 27407029-27409298(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATTGTTGACTTTA
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SmilChr02G002869 Chr02 NC_080388.1:48882288-48882300promoter 内 2245-2257 bp - 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 48884044-48887808(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GGCATTGACTTTG
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SmilChr02G001467 Chr02 NC_080388.1:27409446-27409458promoter 内 1563-1575 bp + 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 27403928-27407020(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATTGTTGACTTTA
SmilChr02G004870 Chr02 NC_080388.1:70796818-70796830promoter 内 1113-1125 bp - 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 70792979-70793942(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CAAAGTCAATGCC
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SmilChr01G005993 Chr01 NC_080387.1:75535193-75535205promoter 内 3926-3938 bp + 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 75533859-75535130(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CGCGTTGACCTGT
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SmilChr01G003990 Chr01 NC_080387.1:58324852-58324864promoter 内 2671-2683 bp + 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 58320695-58323534(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TTAGTTGACTTCG