Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000593; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001545-RA_Salv SmilChr05G000593 MIKC_MADS XP_057764223.1 MP00609 TTTTTTCCATTTTTGGTAA

可能结合的靶基因

9941 个结合位点 7575 个候选靶基因 第 36 / 152 下载 TSV

上一页 36 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001881 Chr05 NC_080391.1:19075172-19075190promoter 内 2-20 bp - 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 19079171-19080733(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTACCAAAAAAGGGAAATG
SmilChr01G003642 Chr01 NC_080387.1:54921847-54921865promoter 内 3914-3932 bp - 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 54919370-54921778(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr04G002302 Chr04 NC_080390.1:37264373-37264391promoter 内 3824-3842 bp - 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 37261224-37264214(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GTATTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr03G001231 Chr03 NC_080389.1:14227266-14227284promoter 内 3780-3798 bp - 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 14220513-14227063(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr01G000255 Chr01 NC_080387.1:4888490-4888508promoter 内 3766-3784 bp + 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4888725-4895148(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr01G005018 Chr01 NC_080387.1:68171982-68172000promoter 内 3729-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 68172254-68178732(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr06G000577 Chr06 NC_080392.1:4932242-4932260promoter 内 3718-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4932525-4933898(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr06G001942 Chr06 NC_080392.1:23851905-23851923promoter 内 3708-3726 bp - 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 23852198-23856471(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr01G001828 Chr01 NC_080387.1:33214758-33214776promoter 内 3610-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33215149-33216677(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATTCCAAAAAAGGAAATCA
SmilChr03G003378 Chr03 NC_080389.1:52121259-52121277promoter 内 3515-3533 bp + 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 52121745-52127255(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr06G000081 Chr06 NC_080392.1:606959-606977promoter 内 3486-3504 bp - 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 603449-606462(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATATTTGGAAG
SmilChr06G002073 Chr06 NC_080392.1:27336394-27336412promoter 内 3439-3457 bp - 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 27336956-27339774(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr02G003060 Chr02 NC_080388.1:51410870-51410888promoter 内 3376-3394 bp - 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 51388125-51410263(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr03G004043 Chr03 NC_080389.1:59428463-59428481promoter 内 3270-3288 bp - 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 59424271-59427750(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr06G000556 Chr06 NC_080392.1:4757952-4757970promoter 内 3260-3278 bp - 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4751777-4757229(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCATTTTTGGTGT
SmilChr03G002665 Chr03 NC_080389.1:42351481-42351499promoter 内 3243-3261 bp + 740 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 42352239-42358802(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr01G001507 Chr01 NC_080387.1:28900276-28900294promoter 内 3133-3151 bp + 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 28901144-28904373(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATCTTCCCTTTTTTGGCAC
SmilChr01G001827 Chr01 NC_080387.1:33214758-33214776promoter 内 3079-3097 bp - 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33207252-33213854(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGATTTCCTTTTTTGGAAT
SmilChr01G003741 Chr01 NC_080387.1:55716810-55716828promoter 内 3071-3089 bp + 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 55717740-55721386(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GTTTTGCTATTTTTGGAAA
SmilChr04G002362 Chr04 NC_080390.1:38106737-38106755promoter 内 3055-3073 bp + 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 38107683-38113503(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCGTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G004375 Chr01 NC_080387.1:61952048-61952066promoter 内 2977-2995 bp - 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 61953072-61954889(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TAACCAAAAAAAGAAAAAA
SmilChr05G004244 Chr05 NC_080391.1:56251899-56251917promoter 内 2968-2986 bp + 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 56247092-56250884(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr06G000744 Chr06 NC_080392.1:6917684-6917702promoter 内 2906-2924 bp + 1077 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 6910599-6916607(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr05G001800 Chr05 NC_080391.1:17750321-17750339promoter 内 2863-2881 bp - 1120 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 17744931-17749201(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr02G002288 Chr02 NC_080388.1:40415609-40415627promoter 内 2547-2565 bp - 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 40417063-40422432(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr03G002011 Chr03 NC_080389.1:30048924-30048942promoter 内 2441-2459 bp + 1542 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30046483-30047382(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr01G003643 Chr01 NC_080387.1:54921847-54921865promoter 内 2418-2436 bp - 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 54923430-54924421(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr03G004339 Chr03 NC_080389.1:61713072-61713090promoter 内 2409-2427 bp + 1574 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 61707763-61711498(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CTTCCAAATATGGAAAGAA
SmilChr04G004160 Chr04 NC_080390.1:56285412-56285430promoter 内 2377-2395 bp - 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 56287036-56288624(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr04G002033 Chr04 NC_080390.1:33021333-33021351promoter 内 2354-2372 bp - 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33022980-33027433(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATTCCAAAAAAGGAAATCA
SmilChr04G002664 Chr04 NC_080390.1:42048123-42048141promoter 内 2315-2333 bp - 1668 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 42044750-42046455(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr01G005460 Chr01 NC_080387.1:71619210-71619228promoter 内 2000-2018 bp - 1983 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 71615057-71617227(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTTCCTTTTTGGGTGA
SmilChr01G005017 Chr01 NC_080387.1:68171982-68172000promoter 内 1869-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 68167299-68169868(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr01G004969 Chr01 NC_080387.1:67796679-67796697promoter 内 1589-1607 bp - 2394 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 67793183-67794285(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATTTTTCCCTTTTGGGGAA
SmilChr04G001503 Chr04 NC_080390.1:24642041-24642059promoter 内 1349-1367 bp + 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 24644693-24647729(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CTTCTTCCTTTTTTGGCTA
SmilChr05G001077 Chr05 NC_080391.1:8961847-8961865promoter 内 1118-1136 bp + 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 8956587-8958982(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr05G003362 Chr05 NC_080391.1:44429751-44429769promoter 内 1042-1060 bp + 2941 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 44424122-44426810(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr01G001418 Chr01 NC_080387.1:27770491-27770509promoter 内 1029-1047 bp - 2954 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 27763875-27767537(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATATTTCCATTTTAGGAAA
SmilChr01G003644 Chr01 NC_080387.1:54921847-54921865promoter 内 727-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 54925121-54932996(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr03G004379 Chr03 NC_080389.1:62001397-62001415promoter 内 288-306 bp - 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 62005110-62006938(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCCTAAAATGGAAATAT
SmilChr04G000469 Chr04 NC_080390.1:5014558-5014576promoter 内 217-235 bp + 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 5018342-5019145(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TCATTTCTATTTTTGGAAA
SmilChr05G000226 Chr05 NC_080391.1:1763502-1763520promoter 内 2914-2932 bp + 1069 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 1764589-1772255(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCCATTCCCTTTTTGGCAA
SmilChr01G003336 Chr01 NC_080387.1:52108361-52108379promoter 内 1739-1757 bp + 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 52105785-52106117(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTGCCAAAAAGGGAATGGG
SmilChr03G004385 Chr03 NC_080389.1:62060374-62060392promoter 内 3123-3141 bp + 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 62061252-62064809(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCTATTTTTGGACT
SmilChr05G000225 Chr05 NC_080391.1:1763502-1763520promoter 内 2267-2285 bp + 1716 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 1758643-1761786(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTGCCAAAAAGGGAATGGG
SmilChr01G004589 Chr01 NC_080387.1:63901155-63901173promoter 内 2109-2127 bp + 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 63903047-63905894(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCATTTTTGGATG
SmilChr02G000338 Chr02 NC_080388.1:4336708-4336726promoter 内 1937-1955 bp - 2046 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 4338772-4339104(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TACCCCAAAATGGAAAAAC
SmilChr05G003973 Chr05 NC_080391.1:53535325-53535343promoter 内 1171-1189 bp + 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 53530986-53532513(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCTAAAAATGGCAAAAA
SmilChr01G001554 Chr01 NC_080387.1:29548381-29548399promoter 内 451-469 bp - 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 29539497-29544849(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTGCCATTTTTAGAAA
SmilChr02G005422 Chr02 NC_080388.1:74686897-74686915promoter 内 383-401 bp + 3600 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 74681555-74683297(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCTAAAAATGGCAAAAA