转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 39 / 149 下载 TSV

上一页 39 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003177 Chr01 NC_080387.1:50558889-50558899promoter 内 2944-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 50559946-50560389(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr05G003769 Chr05 NC_080391.1:50931278-50931288promoter 内 2894-2904 bp + 1097 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 50932385-50935430(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr05G003780 Chr05 NC_080391.1:51130183-51130193promoter 内 2890-2900 bp + 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 51131294-51134370(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr05G001161 Chr05 NC_080391.1:9764155-9764165promoter 内 2689-2699 bp + 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 9757662-9762853(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr01G001180 Chr01 NC_080387.1:23850800-23850810promoter 内 2414-2424 bp + 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 23848331-23849223(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr05G001753 Chr05 NC_080391.1:17071758-17071768promoter 内 2283-2293 bp - 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 17067502-17070050(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr05G001772 Chr05 NC_080391.1:17416279-17416289promoter 内 2283-2293 bp - 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 17412009-17414571(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr06G000036 Chr06 NC_080392.1:323596-323606promoter 内 2129-2139 bp - 1862 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 319027-321734(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr06G000037 Chr06 NC_080392.1:323596-323606promoter 内 1999-2009 bp - 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 321502-321604(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr03G000212 Chr03 NC_080389.1:2470069-2470079promoter 内 1968-1978 bp - 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 2472102-2472657(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr03G004497 Chr03 NC_080389.1:63085665-63085675promoter 内 1939-1949 bp + 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 63087727-63089470(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr07G002429 Chr07 NC_080393.1:22612038-22612048promoter 内 1817-1827 bp + 2174 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 22606680-22609864(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAGC
SmilChr04G003301 Chr04 NC_080390.1:49720816-49720826promoter 内 1754-1764 bp + 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 49723063-49725432(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTGGCTGTCA
SmilChr03G001666 Chr03 NC_080389.1:21677609-21677619promoter 内 1594-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 21673326-21675212(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr03G000744 Chr03 NC_080389.1:8485230-8485240promoter 内 1583-1593 bp - 2408 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 8480356-8482822(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr02G004187 Chr02 NC_080388.1:64199782-64199792promoter 内 1494-1504 bp + 2497 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 64196032-64197285(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr03G002950 Chr03 NC_080389.1:46229978-46229988promoter 内 1345-1355 bp - 2646 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 46223676-46227332(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr03G001667 Chr03 NC_080389.1:21677609-21677619promoter 内 1265-1275 bp + 2726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 21680345-21684580(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr02G003085 Chr02 NC_080388.1:51751022-51751032promoter 内 1252-1262 bp - 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 51753771-51754938(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr01G003060 Chr01 NC_080387.1:49486562-49486572promoter 内 1215-1225 bp + 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 49489348-49493065(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr01G001878 Chr01 NC_080387.1:33805355-33805365promoter 内 1053-1063 bp - 2938 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 33808303-33811676(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr03G003811 Chr03 NC_080389.1:57162302-57162312promoter 内 1026-1036 bp - 2965 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 57156463-57159337(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTGGCTGTCA
SmilChr01G004608 Chr01 NC_080387.1:64057340-64057350promoter 内 996-1006 bp - 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 64049753-64054345(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTGGCTGTCA
SmilChr05G002955 Chr05 NC_080391.1:35711531-35711541promoter 内 927-937 bp - 3064 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 35705690-35708467(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr01G005594 Chr01 NC_080387.1:72570770-72570780promoter 内 918-928 bp + 3073 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 72573853-72574621(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr06G001923 Chr06 NC_080392.1:23285790-23285800promoter 内 885-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 23280582-23282684(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTGGCTGTCA
SmilChr07G000151 Chr07 NC_080393.1:901432-901442promoter 内 706-716 bp - 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 895682-898147(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr02G003086 Chr02 NC_080388.1:51751022-51751032promoter 内 694-704 bp - 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 51754329-51754979(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr03G000574 Chr03 NC_080389.1:6237539-6237549promoter 内 602-612 bp + 3389 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 6240938-6243384(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr01G005505 Chr01 NC_080387.1:71911941-71911951promoter 内 524-534 bp + 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 71906613-71908474(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAGC
SmilChr02G004314 Chr02 NC_080388.1:65481222-65481232promoter 内 375-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 65475690-65477606(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTT
SmilChr05G001162 Chr05 NC_080391.1:9764155-9764165promoter 内 326-336 bp + 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 9767830-9773437(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCA
SmilChr07G001449 Chr07 NC_080393.1:11257892-11257902promoter 内 117-127 bp + 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 11261776-11264240(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTGGCTGTCA
SmilChr02G000495 Chr02 NC_080388.1:6836776-6836786promoter 内 135-145 bp + 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 6832840-6832920(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAC
SmilChr01G005673 Chr01 NC_080387.1:73002689-73002699promoter 内 3834-3844 bp - 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 73002856-73004410(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAC
SmilChr07G002029 Chr07 NC_080393.1:18318298-18318308promoter 内 3818-3828 bp + 173 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 18318481-18319237(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCG
SmilChr01G000979 Chr01 NC_080387.1:20743968-20743978promoter 内 3769-3779 bp - 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 20744200-20746027(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAGG
SmilChr06G000246 Chr06 NC_080392.1:1640490-1640500promoter 内 3133-3143 bp - 858 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 1641358-1643323(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAC
SmilChr01G001034 Chr01 NC_080387.1:21493436-21493446promoter 内 3054-3064 bp - 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 21494383-21495550(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G005667 Chr01 NC_080387.1:72968930-72968940promoter 内 2976-2986 bp - 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 72969955-72972116(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAC
SmilChr03G002802 Chr03 NC_080389.1:44498804-44498814promoter 内 2733-2743 bp + 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 44500072-44508118(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr01G005858 Chr01 NC_080387.1:74516376-74516386promoter 内 2511-2521 bp + 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 74509077-74514896(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr07G002902 Chr07 NC_080393.1:29418792-29418802promoter 内 2158-2168 bp + 1833 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 29416888-29416959(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr02G004436 Chr02 NC_080388.1:66747505-66747515promoter 内 1986-1996 bp - 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 66749520-66753009(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr02G004435 Chr02 NC_080388.1:66747505-66747515promoter 内 1653-1663 bp - 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 66741004-66745167(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr05G002692 Chr05 NC_080391.1:30647796-30647806promoter 内 1333-1343 bp - 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 30643519-30645138(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr01G005406 Chr01 NC_080387.1:71315609-71315619promoter 内 940-950 bp + 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 71311053-71312558(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr07G001347 Chr07 NC_080393.1:10420700-10420710promoter 内 367-377 bp - 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 10424334-10425910(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr02G004000 Chr02 NC_080388.1:62344045-62344055promoter 内 3978-3988 bp - 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 62339553-62344032(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr05G001766 Chr05 NC_080391.1:17385045-17385055promoter 内 3978-3988 bp + 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 17385068-17389540(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA