转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 4 / 143 下载 TSV

上一页 4 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001296 Chr03 NC_080389.1:15154623-15154634promoter 内 1333-1344 bp + 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 15157291-15160121(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTA
SmilChr04G003472 Chr04 NC_080390.1:51193811-51193822promoter 内 974-985 bp + 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 51186651-51190795(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCGA
SmilChr07G003718 Chr07 NC_080393.1:44996727-44996738promoter 内 861-872 bp - 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 44999867-45005975(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAT
SmilChr02G002779 Chr02 NC_080388.1:47876048-47876059promoter 内 766-777 bp + 3224 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 47879283-47889343(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGT
SmilChr07G003662 Chr07 NC_080393.1:43772957-43772968promoter 内 355-366 bp + 3635 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 43776603-43779290(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTA
SmilChr01G001657 Chr01 NC_080387.1:30637564-30637575promoter 内 1731-1742 bp - 2259 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 30639834-30641550(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAC
SmilChr05G001148 Chr05 NC_080391.1:9650383-9650394promoter 内 1480-1491 bp - 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 9645751-9647873(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGTG
SmilChr07G004228 Chr07 NC_080393.1:54561266-54561277promoter 内 999-1010 bp + 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 54564268-54565857(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGTG
SmilChr04G002298 Chr04 NC_080390.1:37238324-37238335promoter 内 3124-3135 bp + 866 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 3 37230755-37237458(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCAA
SmilChr06G000057 Chr06 NC_080392.1:453705-453716promoter 内 2434-2445 bp - 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 3 455272-459376(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAC
SmilChr03G003815 Chr03 NC_080389.1:57182466-57182477promoter 内 3243-3254 bp - 747 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 57178742-57181719(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGG
SmilChr06G000666 Chr06 NC_080392.1:5854034-5854045promoter 内 2907-2918 bp + 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 5855128-5859600(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGG
SmilChr03G004684 Chr03 NC_080389.1:64251649-64251660promoter 内 2704-2715 bp + 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 64249254-64250363(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCGT
SmilChr05G000004 Chr05 NC_080391.1:8020-8031promoter 内 2649-2660 bp - 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 9372-18827(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAA
SmilChr03G001633 Chr03 NC_080389.1:21025225-21025236promoter 内 2025-2036 bp - 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 21022167-21023260(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTG
SmilChr07G000883 Chr07 NC_080393.1:6317528-6317539promoter 内 1572-1583 bp - 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 6319957-6320466(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCAA
SmilChr03G004685 Chr03 NC_080389.1:64251649-64251660promoter 内 597-608 bp + 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 64255053-64258501(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGCCAGCTGTC
SmilChr07G001039 Chr07 NC_080393.1:7619686-7619697promoter 内 2250-2261 bp - 1740 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 7614746-7617946(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGG
SmilChr02G002493 Chr02 NC_080388.1:43373356-43373367promoter 内 1573-1584 bp + 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 43367254-43370939(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAA
SmilChr06G002767 Chr06 NC_080392.1:40272655-40272666promoter 内 1242-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 40275414-40277411(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGG
SmilChr03G000109 Chr03 NC_080389.1:1198841-1198852promoter 内 1200-1211 bp + 2790 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 1201642-1202819(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTG
SmilChr07G001042 Chr07 NC_080393.1:7619686-7619697promoter 内 823-834 bp - 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 7622864-7623971(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCAA
SmilChr05G002942 Chr05 NC_080391.1:35483655-35483666promoter 内 322-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 35487334-35490090(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCAA
SmilChr03G000905 Chr03 NC_080389.1:10366458-10366469promoter 内 258-269 bp - 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 10370201-10373104(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAC
SmilChr06G000769 Chr06 NC_080392.1:7186689-7186700promoter 内 3412-3423 bp - 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 7185653-7186111(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTA
SmilChr08G001483 Chr08 NC_080394.1:11955446-11955457promoter 内 3399-3410 bp - 591 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 11952984-11954855(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTA
SmilChr01G004470 Chr01 NC_080387.1:62797207-62797218promoter 内 951-962 bp + 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 62792722-62794168(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCAG
SmilChr02G000382 Chr02 NC_080388.1:4785535-4785546promoter 内 2411-2422 bp + 1579 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 4780702-4783956(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAA
SmilChr02G003381 Chr02 NC_080388.1:54925698-54925709promoter 内 2012-2023 bp + 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 54927687-54930592(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGT
SmilChr05G001041 Chr05 NC_080391.1:8527044-8527055promoter 内 1796-1807 bp + 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 8529249-8532604(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTT
SmilChr05G000222 Chr05 NC_080391.1:1737351-1737362promoter 内 901-912 bp + 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 1731104-1734262(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr05G003454 Chr05 NC_080391.1:45943673-45943684promoter 内 524-535 bp + 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 45937513-45940207(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr02G002232 Chr02 NC_080388.1:39671336-39671347promoter 内 502-513 bp + 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 39665191-39667848(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr01G000531 Chr01 NC_080387.1:10844177-10844188promoter 内 476-487 bp + 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 10837853-10840663(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr06G002415 Chr06 NC_080392.1:34898194-34898205promoter 内 439-450 bp + 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 34891816-34894643(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr04G001874 Chr04 NC_080390.1:30566093-30566104promoter 内 415-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 30569679-30572231(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr05G000922 Chr05 NC_080391.1:7317444-7317455promoter 内 390-401 bp - 3600 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 7321055-7323686(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr06G002454 Chr06 NC_080392.1:35330814-35330825promoter 内 277-288 bp + 3713 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 35324385-35327101(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr06G001505 Chr06 NC_080392.1:16083418-16083429promoter 内 3890-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 16082373-16083318(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAA
SmilChr05G002470 Chr05 NC_080391.1:27218130-27218141promoter 内 3700-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 27218431-27222151(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAA
SmilChr02G004809 Chr02 NC_080388.1:70261658-70261669promoter 内 3250-3261 bp - 740 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 70262409-70265309(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAA
SmilChr03G003666 Chr03 NC_080389.1:55508913-55508924promoter 内 3096-3107 bp + 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 55502685-55508019(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr01G001002 Chr01 NC_080387.1:21112710-21112721promoter 内 2932-2943 bp + 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 21113779-21114130(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTA
SmilChr02G001866 Chr02 NC_080388.1:33892255-33892266promoter 内 2723-2734 bp + 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 33893533-33894546(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGT
SmilChr05G000517 Chr05 NC_080391.1:3992388-3992399promoter 内 2668-2679 bp - 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 3989011-3991066(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTG
SmilChr03G000302 Chr03 NC_080389.1:3452585-3452596promoter 内 2641-2652 bp - 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 3449974-3451236(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTT
SmilChr02G000383 Chr02 NC_080388.1:4785535-4785546promoter 内 2514-2525 bp + 1476 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 4787022-4791337(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTT
SmilChr03G000841 Chr03 NC_080389.1:9606327-9606338promoter 内 2285-2296 bp - 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 9608043-9612518(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr07G003454 Chr07 NC_080393.1:38590056-38590067promoter 内 2251-2262 bp - 1739 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 38591806-38594786(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr05G002970 Chr05 NC_080391.1:36089177-36089188promoter 内 2056-2067 bp + 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 36091122-36092295(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTT