靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00001018-RA_Salv |
SmilChr08G000478 |
GATA | XP_057781809.1 |
MP00130 |
AGATCTAGATCTGAA |
9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 40 / 121 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr01G001619 |
Chr01 | NC_080387.1:30293601-30293615promoter 内 1297-1311 bp |
+ | 2690 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 30296305-30300618(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TCAATTAGATCTGAA |
SmilChr01G001854 |
Chr01 | NC_080387.1:33477340-33477354promoter 内 1127-1141 bp |
- | 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 33471818-33474480(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GATTCTAGATCCGGT |
SmilChr04G001726 |
Chr04 | NC_080390.1:28502252-28502266promoter 内 1078-1092 bp |
- | 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 28505175-28509187(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
ATCAGATCCATTTTT |
SmilChr03G000088 |
Chr03 | NC_080389.1:1016016-1016030promoter 内 1029-1043 bp |
+ | 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 1008412-1013058(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CTCAGATCTATAAAT |
SmilChr02G002447 |
Chr02 | NC_080388.1:42702933-42702947promoter 内 963-977 bp |
+ | 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 42698713-42699909(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CTCAGATCCCGGCCC |
SmilChr01G003626 |
Chr01 | NC_080387.1:54803582-54803596promoter 内 897-911 bp |
+ | 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 54806686-54807969(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GCATCGAGATCTGGC |
SmilChr02G004211 |
Chr02 | NC_080388.1:64371382-64371396promoter 内 893-907 bp |
- | 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 64374490-64376363(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GTCAGATCTAGTCAT |
SmilChr03G000859 |
Chr03 | NC_080389.1:9822588-9822602promoter 内 836-850 bp |
+ | 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 9813814-9819437(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CTCAGATCTATAAAT |
SmilChr04G003263 |
Chr04 | NC_080390.1:49363028-49363042promoter 内 766-780 bp |
+ | 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 49359417-49359807(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CTCAGATCCAATCTA |
SmilChr01G002356 |
Chr01 | NC_080387.1:40746415-40746429promoter 内 738-752 bp |
- | 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 40740704-40743166(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
ATAGCTGGATCTGAC |
SmilChr04G003813 |
Chr04 | NC_080390.1:54281707-54281721promoter 内 627-641 bp |
- | 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 54273051-54278347(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TGGTCTAGATCCGGT |
SmilChr01G003643 |
Chr01 | NC_080387.1:54920035-54920049promoter 内 606-620 bp |
+ | 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 54923430-54924421(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GCATCGAGATCTGGC |
SmilChr02G000257 |
Chr02 | NC_080388.1:3292426-3292440promoter 内 553-567 bp |
+ | 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 3295874-3297706(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
AGAATGAGATCTGAT |
SmilChr04G003775 |
Chr04 | NC_080390.1:53944810-53944824promoter 内 471-485 bp |
- | 3516 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 53940086-53941294(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
AGATAGAGATCTGAA |
SmilChr02G000255 |
Chr02 | NC_080388.1:3292426-3292440promoter 内 389-403 bp |
+ | 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 3285444-3288828(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
ATCAGATCTCATTCT |
SmilChr01G005615 |
Chr01 | NC_080387.1:72667052-72667066promoter 内 373-387 bp |
- | 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 72670680-72671653(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CTCAGATCCAATTAA |
SmilChr01G005880 |
Chr01 | NC_080387.1:74735082-74735096promoter 内 210-224 bp |
- | 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 74738873-74740800(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TTGAGATCTAGAACA |
SmilChr03G001728 |
Chr03 | NC_080389.1:23218741-23218755promoter 内 191-205 bp |
+ | 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 23222551-23224466(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
ATATGTAGATCTGGT |
SmilChr02G001160 |
Chr02 | NC_080388.1:21165583-21165597promoter 内 120-134 bp |
- | 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 21160679-21161716(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
AGAACTAGATCTCTG |
SmilChr04G000047 |
Chr04 | NC_080390.1:438444-438458promoter 内 88-102 bp |
- | 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 424179-434545(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GCTATTAGATCTGAA |
SmilChr03G000170 |
Chr03 | NC_080389.1:1866000-1866014promoter 内 87-101 bp |
+ | 3900 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.0/ 100 | 1 | 1869914-1872256(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
ATTTATAGATCTGAG |
SmilChr02G004238 |
Chr02 | NC_080388.1:64562776-64562790promoter 内 1677-1691 bp |
- | 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 10 | 64558095-64560466(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TCGTTCAGATCTGAC |
SmilChr01G004273 |
Chr01 | NC_080387.1:60969196-60969210promoter 内 2230-2244 bp |
+ | 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 9 | 60970967-60974633(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GGCGACAGATCTGAT |
SmilChr04G002104 |
Chr04 | NC_080390.1:33975859-33975873promoter 内 3445-3459 bp |
+ | 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 33976415-33981921(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
AGCCGCAGATCTGAG |
SmilChr05G001424 |
Chr05 | NC_080391.1:12914769-12914783promoter 内 2993-3007 bp |
- | 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 12911891-12913775(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
AGATTTAGATCTTAT |
SmilChr02G002601 |
Chr02 | NC_080388.1:45149555-45149569promoter 内 1979-1993 bp |
+ | 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 45151577-45154195(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GATTTTAGATCTAGG |
SmilChr03G001375 |
Chr03 | NC_080389.1:16218652-16218666promoter 内 1408-1422 bp |
+ | 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 16221245-16224490(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
AGGCACAGATCTGAA |
SmilChr02G000322 |
Chr02 | NC_080388.1:4041265-4041279promoter 内 1147-1161 bp |
- | 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 4044119-4047447(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
ATCAGATCCACTTTT |
SmilChr02G000262 |
Chr02 | NC_080388.1:3414589-3414603promoter 内 1074-1088 bp |
+ | 2913 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 3409681-3411676(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TCCAGATCTGCTGCT |
SmilChr01G000056 |
Chr01 | NC_080387.1:872614-872628promoter 内 649-663 bp |
+ | 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 875966-877320(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GATTTTAGATCTAGG |
SmilChr02G002677 |
Chr02 | NC_080388.1:46355405-46355419promoter 内 333-347 bp |
+ | 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 46349234-46351751(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TCCAGATCTAAATAG |
SmilChr05G001327 |
Chr05 | NC_080391.1:11499047-11499061promoter 内 158-172 bp |
- | 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 3 | 11494396-11495218(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GCTGCCGGATCTGAC |
SmilChr04G002354 |
Chr04 | NC_080390.1:38043976-38043990promoter 内 3797-3811 bp |
- | 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 38034536-38043786(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GCTTCTAGATCTGTA |
SmilChr04G000595 |
Chr04 | NC_080390.1:6665129-6665143promoter 内 3795-3809 bp |
- | 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 6662870-6664937(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
AAATCTCGATCTGAG |
SmilChr02G003326 |
Chr02 | NC_080388.1:54526503-54526517promoter 内 3621-3635 bp |
+ | 366 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 54523480-54526137(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
ATCAGATCCAAAGAC |
SmilChr01G003550 |
Chr01 | NC_080387.1:54106512-54106526promoter 内 3617-3631 bp |
- | 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 54104430-54106142(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CCGTCCAGATCTGCT |
SmilChr03G003893 |
Chr03 | NC_080389.1:58016289-58016303promoter 内 3470-3484 bp |
+ | 517 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 58016820-58018212(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GTAACTAGATCTAAT |
SmilChr02G003224 |
Chr02 | NC_080388.1:53486576-53486590promoter 内 3410-3424 bp |
+ | 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 53480965-53485999(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CTCAGATCTAGGCGA |
SmilChr03G002121 |
Chr03 | NC_080389.1:32965366-32965380promoter 内 3309-3323 bp |
+ | 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 32966058-32966610(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GGCACTAGATCTAGA |
SmilChr04G002356 |
Chr04 | NC_080390.1:38043976-38043990promoter 内 2794-2808 bp |
- | 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 38045183-38046468(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TACAGATCTAGAAGC |
SmilChr04G002120 |
Chr04 | NC_080390.1:34194985-34194999promoter 内 2782-2796 bp |
- | 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 34196204-34199247(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CCTAGATCTAAAATC |
SmilChr03G004114 |
Chr03 | NC_080389.1:60050413-60050427promoter 内 2568-2582 bp |
- | 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 60043388-60048994(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CGTTACGGATCTGAA |
SmilChr05G001580 |
Chr05 | NC_080391.1:14509200-14509214promoter 内 2520-2534 bp |
+ | 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 14510681-14512590(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GGTTTCAGATCTGTC |
SmilChr02G004733 |
Chr02 | NC_080388.1:69566791-69566805promoter 内 2408-2422 bp |
- | 1579 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 69561938-69565212(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TCGGTCAGATCTGAG |
SmilChr03G004519 |
Chr03 | NC_080389.1:63263911-63263925promoter 内 2302-2316 bp |
+ | 1685 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 63265610-63268258(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TTGTTCGGATCTGAA |
SmilChr02G003514 |
Chr02 | NC_080388.1:56336582-56336596promoter 内 2272-2286 bp |
+ | 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 56329508-56334867(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
TCCAGATCTAAATAG |
SmilChr03G001989 |
Chr03 | NC_080389.1:29172324-29172338promoter 内 2176-2190 bp |
- | 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 29168575-29170513(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
GTTTATAGATCTGGG |
SmilChr02G003515 |
Chr02 | NC_080388.1:56336582-56336596promoter 内 1946-1960 bp |
+ | 2041 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 56338637-56340457(+) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CTATTTAGATCTGGA |
SmilChr02G004476 |
Chr02 | NC_080388.1:67156977-67156991promoter 内 1805-1819 bp |
+ | 2182 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 67144439-67154795(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
CTCAGATCTGCGGCT |
SmilChr01G004502 |
Chr01 | NC_080387.1:63130824-63130838promoter 内 1742-1756 bp |
+ | 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.9/ 100 | 2 | 63125172-63128579(-) |
SMil_00001018-RA_Salv |
MP00130 |
ACCAGATCTCATTCC |