转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 42 / 136 下载 TSV

上一页 42 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003072 Chr05 NC_080391.1:38656779-38656789promoter 内 368-378 bp - 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 38651653-38653156(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTC
SmilChr06G000227 Chr06 NC_080392.1:1532303-1532313promoter 内 313-323 bp + 3678 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 1517848-1528625(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCA
SmilChr04G003675 Chr04 NC_080390.1:53210814-53210824promoter 内 3990-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 53210825-53212810(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTC
SmilChr06G001524 Chr06 NC_080392.1:16431260-16431270promoter 内 3990-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 16431271-16432656(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTC
SmilChr02G002018 Chr02 NC_080388.1:36383716-36383726promoter 内 3934-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 36383783-36388678(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTG
SmilChr02G001968 Chr02 NC_080388.1:35612485-35612495promoter 内 3927-3937 bp - 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 35612559-35613464(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGA
SmilChr03G001736 Chr03 NC_080389.1:23367522-23367532promoter 内 3918-3928 bp - 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 23363616-23367449(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGG
SmilChr05G003885 Chr05 NC_080391.1:52600875-52600885promoter 内 3916-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 52600960-52603911(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTT
SmilChr03G003297 Chr03 NC_080389.1:51096323-51096333promoter 内 3890-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 51096434-51098033(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTT
SmilChr01G002213 Chr01 NC_080387.1:38484820-38484830promoter 内 3790-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 38481612-38484619(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCG
SmilChr01G002230 Chr01 NC_080387.1:38794275-38794285promoter 内 3790-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 38791046-38794074(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCG
SmilChr04G003541 Chr04 NC_080390.1:51763431-51763441promoter 内 3753-3763 bp + 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 51763679-51768482(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGC
SmilChr04G003019 Chr04 NC_080390.1:46602536-46602546promoter 内 3751-3761 bp - 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 46601435-46602296(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGC
SmilChr03G002482 Chr03 NC_080389.1:39408230-39408240promoter 内 3742-3752 bp + 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 39408489-39409055(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGTCAGCGCC
SmilChr05G003884 Chr05 NC_080391.1:52600875-52600885promoter 内 3604-3614 bp - 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 52598222-52600488(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGC
SmilChr08G000538 Chr08 NC_080394.1:3919102-3919112promoter 内 3516-3526 bp + 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3919587-3928432(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTC
SmilChr01G000469 Chr01 NC_080387.1:9585434-9585444promoter 内 3413-3423 bp + 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 9586022-9587586(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTC
SmilChr05G001855 Chr05 NC_080391.1:18579802-18579812promoter 内 3370-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 18580433-18581610(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGC
SmilChr01G001343 Chr01 NC_080387.1:26700019-26700029promoter 内 3368-3378 bp - 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 26698517-26699396(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTC
SmilChr02G001480 Chr02 NC_080388.1:27684185-27684195promoter 内 3348-3358 bp + 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27683437-27683542(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCG
SmilChr02G001421 Chr02 NC_080388.1:26823774-26823784promoter 内 3297-3307 bp + 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 26821704-26823080(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGA
SmilChr01G003698 Chr01 NC_080387.1:55355303-55355313promoter 内 3284-3294 bp + 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 55353220-55354596(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGA
SmilChr04G000373 Chr04 NC_080390.1:3767048-3767058promoter 内 3277-3287 bp + 714 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3765168-3766334(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCG
SmilChr04G000372 Chr04 NC_080390.1:3756273-3756283promoter 内 3275-3285 bp + 716 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3754391-3755557(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCG
SmilChr01G005288 Chr01 NC_080387.1:70221914-70221924promoter 内 3216-3226 bp - 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 70222699-70224075(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGA
SmilChr08G002557 Chr08 NC_080394.1:24871125-24871135promoter 内 3186-3196 bp - 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24868593-24870320(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGC
SmilChr05G001769 Chr05 NC_080391.1:17398789-17398799promoter 内 3115-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 17395426-17397913(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTC
SmilChr07G000157 Chr07 NC_080393.1:939356-939366promoter 内 3090-3100 bp - 901 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 940267-942214(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCG
SmilChr08G003698 Chr08 NC_080394.1:41431761-41431771promoter 内 3065-3075 bp - 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 41432697-41433688(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCG
SmilChr08G003699 Chr08 NC_080394.1:41441324-41441334promoter 内 3065-3075 bp - 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 41442260-41443227(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCG
SmilChr06G002098 Chr06 NC_080392.1:27929535-27929545promoter 内 3004-3014 bp - 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27927304-27928548(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCC
SmilChr03G002805 Chr03 NC_080389.1:44517197-44517207promoter 内 2955-2965 bp - 1036 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 44518243-44519190(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTG
SmilChr04G002438 Chr04 NC_080390.1:39045480-39045490promoter 内 2952-2962 bp - 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 39046529-39046602(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAACG
SmilChr07G001826 Chr07 NC_080393.1:15756116-15756126promoter 内 2724-2734 bp + 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 15748621-15754849(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCG
SmilChr01G001344 Chr01 NC_080387.1:26700019-26700029promoter 内 2716-2726 bp - 1275 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 26701304-26704417(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCA
SmilChr05G002152 Chr05 NC_080391.1:22740802-22740812promoter 内 2686-2696 bp - 1305 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 22742117-22744510(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTT
SmilChr04G001110 Chr04 NC_080390.1:15935092-15935102promoter 内 2632-2642 bp + 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 15929849-15933733(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGA
SmilChr04G001827 Chr04 NC_080390.1:29806623-29806633promoter 内 2585-2595 bp - 1406 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 29808039-29808850(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCG
SmilChr07G004194 Chr07 NC_080393.1:53990870-53990880promoter 内 2583-2593 bp - 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 53986045-53989462(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTC
SmilChr04G001053 Chr04 NC_080390.1:14996327-14996337promoter 内 2556-2566 bp - 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 14997772-15001653(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGA
SmilChr02G003061 Chr02 NC_080388.1:51432793-51432803promoter 内 2544-2554 bp - 1447 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 51434250-51435702(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTT
SmilChr02G002741 Chr02 NC_080388.1:47379424-47379434promoter 内 2415-2425 bp - 1576 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 47381010-47385361(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGA
SmilChr03G004750 Chr03 NC_080389.1:64595336-64595346promoter 内 2415-2425 bp + 1576 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 64586076-64593760(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCG
SmilChr07G001756 Chr07 NC_080393.1:14877537-14877547promoter 内 2341-2351 bp - 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 14879197-14883102(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAACG
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SmilChr03G003298 Chr03 NC_080389.1:51096323-51096333promoter 内 2294-2304 bp - 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 51098030-51098693(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTT
SmilChr02G001967 Chr02 NC_080388.1:35612485-35612495promoter 内 2286-2296 bp - 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 35609110-35610780(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCT
SmilChr03G002803 Chr03 NC_080389.1:44517197-44517207promoter 内 2263-2273 bp - 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 44513519-44515469(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGTG
SmilChr04G002122 Chr04 NC_080390.1:34242868-34242878promoter 内 2244-2254 bp - 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 34244625-34244697(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGA
SmilChr01G004857 Chr01 NC_080387.1:66741499-66741509promoter 内 2104-2114 bp + 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 66736214-66739612(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTT