转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 43 / 143 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G003087 Chr06 NC_080392.1:43730498-43730509promoter 内 778-789 bp + 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 43733721-43736786(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTT
SmilChr04G004053 Chr04 NC_080390.1:55710033-55710044promoter 内 746-757 bp - 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 55702812-55706789(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTA
SmilChr04G003965 Chr04 NC_080390.1:55143617-55143628promoter 内 740-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 55138128-55140367(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGG
SmilChr08G001965 Chr08 NC_080394.1:17349125-17349136promoter 内 437-448 bp - 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 17345063-17345572(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTT
SmilChr01G000891 Chr01 NC_080387.1:18952276-18952287promoter 内 293-304 bp - 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 18955984-18963499(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAG
SmilChr04G003964 Chr04 NC_080390.1:55143617-55143628promoter 内 218-229 bp - 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 55131980-55139845(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGG
SmilChr02G000154 Chr02 NC_080388.1:2020689-2020700promoter 内 3936-3947 bp - 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 2018728-2020635(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATT
SmilChr06G001444 Chr06 NC_080392.1:15265289-15265300promoter 内 3845-3856 bp + 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15265445-15268458(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATG
SmilChr06G001526 Chr06 NC_080392.1:16444691-16444702promoter 内 3662-3673 bp + 328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 16445030-16449309(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr01G000872 Chr01 NC_080387.1:18595618-18595629promoter 内 3520-3531 bp + 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 18594111-18595148(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAT
SmilChr08G001302 Chr08 NC_080394.1:10372299-10372310promoter 内 3205-3216 bp - 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 10368713-10371514(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr01G005703 Chr01 NC_080387.1:73273459-73273470promoter 内 3164-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 73274296-73277234(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr07G003389 Chr07 NC_080393.1:36708896-36708907promoter 内 3138-3149 bp + 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 36709759-36711188(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAGT
SmilChr01G005376 Chr01 NC_080387.1:70986340-70986351promoter 内 3060-3071 bp + 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 70980715-70985410(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGT
SmilChr08G000829 Chr08 NC_080394.1:6130070-6130081promoter 内 3030-3041 bp - 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 6128038-6129110(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr06G001362 Chr06 NC_080392.1:14190886-14190897promoter 内 2925-2936 bp - 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 14189003-14189821(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATT
SmilChr01G002766 Chr01 NC_080387.1:46057475-46057486promoter 内 2856-2867 bp + 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 46051009-46056341(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAA
SmilChr06G001398 Chr06 NC_080392.1:14622408-14622419promoter 内 2770-2781 bp - 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 14620616-14621188(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATT
SmilChr02G003299 Chr02 NC_080388.1:54279771-54279782promoter 内 2633-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54252125-54278414(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAGC
SmilChr01G002615 Chr01 NC_080387.1:44418592-44418603promoter 内 2631-2642 bp - 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 44411608-44417233(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATG
SmilChr07G003078 Chr07 NC_080393.1:32415712-32415723promoter 内 2600-2611 bp - 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 32417113-32418853(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAT
SmilChr08G002188 Chr08 NC_080394.1:19764817-19764828promoter 内 2574-2585 bp + 1416 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 19766244-19768683(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATG
SmilChr04G001434 Chr04 NC_080390.1:23398136-23398147promoter 内 2419-2430 bp + 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 23386135-23396565(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCGC
SmilChr08G001588 Chr08 NC_080394.1:13125876-13125887promoter 内 2292-2303 bp - 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 13127585-13130162(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCGA
SmilChr08G001600 Chr08 NC_080394.1:13246080-13246091promoter 内 2198-2209 bp - 1792 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 13247883-13250365(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCGA
SmilChr08G001067 Chr08 NC_080394.1:8235702-8235713promoter 内 2126-2137 bp - 1864 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 8229523-8233838(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATT
SmilChr06G001443 Chr06 NC_080392.1:15265289-15265300promoter 内 2048-2059 bp + 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15261107-15263347(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAT
SmilChr05G004202 Chr05 NC_080391.1:55896904-55896915promoter 内 1968-1979 bp + 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 55898937-55902971(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATT
SmilChr04G002141 Chr04 NC_080390.1:34427390-34427401promoter 内 1821-1832 bp + 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 34429570-34437474(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTA
SmilChr04G004136 Chr04 NC_080390.1:56168410-56168421promoter 内 1739-1750 bp + 2251 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 56161622-56166159(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCGA
SmilChr03G002272 Chr03 NC_080389.1:35864037-35864048promoter 内 1602-1613 bp + 2388 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 35866436-35868613(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCTG
SmilChr03G004265 Chr03 NC_080389.1:61131576-61131587promoter 内 1459-1470 bp + 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 61134118-61138266(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTA
SmilChr06G000732 Chr06 NC_080392.1:6750808-6750819promoter 内 1413-1424 bp + 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 6753396-6755476(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATG
SmilChr01G001557 Chr01 NC_080387.1:29590556-29590567promoter 内 1363-1374 bp + 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 29593194-29595995(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr07G001385 Chr07 NC_080393.1:10753853-10753864promoter 内 1356-1367 bp + 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 10756498-10756717(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr07G002334 Chr07 NC_080393.1:21649739-21649750promoter 内 1329-1340 bp - 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 21640900-21647078(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr06G002176 Chr06 NC_080392.1:29969782-29969793promoter 内 1004-1015 bp + 2986 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 29965550-29966796(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGC
SmilChr01G002999 Chr01 NC_080387.1:48977965-48977976promoter 内 947-958 bp - 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 48970122-48974922(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTG
SmilChr08G003630 Chr08 NC_080394.1:39583387-39583398promoter 内 899-910 bp - 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 39586489-39586826(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGC
SmilChr08G000652 Chr08 NC_080394.1:4844527-4844538promoter 内 865-876 bp - 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 4847663-4851168(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAA
SmilChr05G001624 Chr05 NC_080391.1:15140329-15140340promoter 内 785-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15143545-15143919(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAA
SmilChr08G001592 Chr08 NC_080394.1:13166264-13166275promoter 内 785-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 13169480-13171852(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAT
SmilChr01G005039 Chr01 NC_080387.1:68338681-68338692promoter 内 697-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 68332443-68335388(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTT
SmilChr08G001604 Chr08 NC_080394.1:13287587-13287598promoter 内 552-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 13291036-13293307(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAT
SmilChr06G002315 Chr06 NC_080392.1:33414882-33414893promoter 内 499-510 bp + 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 33408187-33411391(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAA
SmilChr06G000151 Chr06 NC_080392.1:1062826-1062837promoter 内 306-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1053337-1059142(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGT
SmilChr01G004222 Chr01 NC_080387.1:60587341-60587352promoter 内 202-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 60582237-60583553(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCTG
SmilChr01G001093 Chr01 NC_080387.1:22375914-22375925promoter 内 192-203 bp - 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 22379723-22397006(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAG
SmilChr08G002729 Chr08 NC_080394.1:26926717-26926728promoter 内 144-155 bp + 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 26930574-26935533(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr06G000182 Chr06 NC_080392.1:1263162-1263173promoter 内 95-106 bp + 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1267068-1270344(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG