转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 43 / 128 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004298 Chr02 NC_080388.1:65348576-65348587promoter 内 3407-3418 bp + 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 65344753-65347993(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr01G003038 Chr01 NC_080387.1:49375319-49375330promoter 内 2870-2881 bp + 1120 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 49376450-49380940(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAGACAGAGCA
SmilChr02G001401 Chr02 NC_080388.1:26594735-26594746promoter 内 2478-2489 bp - 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 26591744-26593223(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGG
SmilChr01G000845 Chr01 NC_080387.1:18295650-18295661promoter 内 2349-2360 bp - 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 18297302-18299187(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr01G000815 Chr01 NC_080387.1:17600841-17600852promoter 内 2291-2302 bp - 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 17598615-17599142(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr03G001854 Chr03 NC_080389.1:25529340-25529351promoter 内 2148-2159 bp + 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 25527080-25527498(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTTTA
SmilChr01G000770 Chr01 NC_080387.1:16836931-16836942promoter 内 1994-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 16832299-16834935(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G003860 Chr02 NC_080388.1:60438904-60438915promoter 内 1843-1854 bp - 2147 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 60433766-60436757(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G000784 Chr02 NC_080388.1:12887942-12887953promoter 内 1686-1697 bp - 2304 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 12884119-12885638(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGG
SmilChr01G000565 Chr01 NC_080387.1:11696953-11696964promoter 内 1565-1576 bp + 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 11699389-11703233(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G000397 Chr02 NC_080388.1:4912852-4912863promoter 内 1489-1500 bp + 2501 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 4915364-4916889(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAGACAGAGCA
SmilChr01G000145 Chr01 NC_080387.1:2438073-2438084promoter 内 1099-1110 bp + 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 2440975-2446801(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G001329 Chr01 NC_080387.1:26460908-26460919promoter 内 823-834 bp - 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 26464086-26473494(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr02G003157 Chr02 NC_080388.1:52606212-52606223promoter 内 529-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 52609684-52612850(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr02G003612 Chr02 NC_080388.1:57369626-57369637promoter 内 386-397 bp + 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 57365660-57366022(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTC
SmilChr01G000567 Chr01 NC_080387.1:11746137-11746148promoter 内 309-320 bp + 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 11739553-11742456(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr03G001226 Chr03 NC_080389.1:14144937-14144948promoter 内 18-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 14148920-14152203(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G001161 Chr01 NC_080387.1:23606683-23606694promoter 内 3711-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 23606973-23612688(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr02G001053 Chr02 NC_080388.1:18780185-18780196promoter 内 3514-3525 bp + 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 18780672-18786763(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G000646 Chr01 NC_080387.1:14445972-14445983promoter 内 3423-3434 bp + 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 14446550-14447300(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G004308 Chr02 NC_080388.1:65453898-65453909promoter 内 3413-3424 bp - 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 65454486-65460577(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCCG
SmilChr03G001191 Chr03 NC_080389.1:13713697-13713708promoter 内 3395-3406 bp - 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 13707541-13713102(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G002818 Chr01 NC_080387.1:46750414-46750425promoter 内 3138-3149 bp + 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 46751277-46755300(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGTT
SmilChr01G003406 Chr01 NC_080387.1:52724571-52724582promoter 内 2591-2602 bp + 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 52725981-52727578(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGTT
SmilChr01G003764 Chr01 NC_080387.1:56025966-56025977promoter 内 2542-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 56027425-56028951(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTC
SmilChr02G004527 Chr02 NC_080388.1:67870110-67870121promoter 内 2378-2389 bp - 1612 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 67864466-67868498(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G002776 Chr02 NC_080388.1:47831286-47831297promoter 内 2282-2293 bp + 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 47833005-47834022(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGTT
SmilChr03G001397 Chr03 NC_080389.1:16587586-16587597promoter 内 2251-2262 bp + 1739 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 16589336-16595237(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGTC
SmilChr03G001468 Chr03 NC_080389.1:17541393-17541404promoter 内 2234-2245 bp + 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 17543160-17547153(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGTC
SmilChr03G001818 Chr03 NC_080389.1:24843092-24843103promoter 内 2229-2240 bp - 1761 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 24844864-24846175(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTTTA
SmilChr02G003328 Chr02 NC_080388.1:54536692-54536703promoter 内 2185-2196 bp - 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 54528113-54534887(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G001718 Chr01 NC_080387.1:31662557-31662568promoter 内 1626-1637 bp + 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 31656640-31660193(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTCTCG
SmilChr02G001298 Chr02 NC_080388.1:24040302-24040313promoter 内 1440-1451 bp + 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 24034473-24037752(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTCCG
SmilChr02G004563 Chr02 NC_080388.1:68142229-68142240promoter 内 1310-1321 bp - 2680 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 68144920-68148537(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTTTA
SmilChr02G000643 Chr02 NC_080388.1:9726997-9727008promoter 内 1275-1286 bp - 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 9721651-9724282(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGG
SmilChr03G001225 Chr03 NC_080389.1:14144937-14144948promoter 内 1239-1250 bp + 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 14147699-14148817(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
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