转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 44 / 126 下载 TSV

上一页 44 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005361 Chr02 NC_080388.1:74327857-74327871promoter 内 2179-2193 bp + 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 74329679-74332328(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CATAGCCACGTGGCG
SmilChr08G003154 Chr08 NC_080394.1:32046914-32046928promoter 内 1804-1818 bp + 2183 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 32044022-32044731(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGACACGTGTCCTTG
SmilChr04G000146 Chr04 NC_080390.1:1272771-1272785promoter 内 809-823 bp + 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 1275963-1281253(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTAAGACACGTGTCA
SmilChr08G001816 Chr08 NC_080394.1:15322361-15322375promoter 内 347-361 bp + 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 15326015-15328983(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGTGAACACGTGGCT
SmilChr01G000149 Chr01 NC_080387.1:2550958-2550972promoter 内 119-133 bp - 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 2554840-2563158(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTGTCTGCC
SmilChr03G000031 Chr03 NC_080389.1:381756-381770promoter 内 3909-3923 bp - 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 379389-381678(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGAGCACACGTGTCG
SmilChr01G003727 Chr01 NC_080387.1:55591976-55591990promoter 内 3905-3919 bp - 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55588948-55591894(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCAGACACGTGGCG
SmilChr01G004131 Chr01 NC_080387.1:59823047-59823061promoter 内 3905-3919 bp + 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 59822460-59822965(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCTGACCT
SmilChr07G004017 Chr07 NC_080393.1:51248517-51248531promoter 内 3871-3885 bp - 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 51243936-51248401(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTCCCACGTGGCG
SmilChr02G003751 Chr02 NC_080388.1:59156517-59156531promoter 内 3865-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 59156653-59157317(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGTTGACGTGGCG
SmilChr07G000079 Chr07 NC_080393.1:379786-379800promoter 内 3852-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 375452-379651(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATAAAAGACGTGGCA
SmilChr01G004300 Chr01 NC_080387.1:61179895-61179909promoter 内 3850-3864 bp - 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61176901-61179758(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTGTACACGTGGCG
SmilChr01G002782 Chr01 NC_080387.1:46278934-46278948promoter 内 3790-3804 bp + 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 46272630-46278737(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAACTCC
SmilChr07G002136 Chr07 NC_080393.1:19509480-19509494promoter 内 3579-3593 bp - 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 19509902-19513320(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAACTCC
SmilChr06G000695 Chr06 NC_080392.1:6168796-6168810promoter 内 3565-3579 bp + 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6169232-6171275(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATAACAGACGTGGCA
SmilChr01G002905 Chr01 NC_080387.1:47753437-47753451promoter 内 3397-3411 bp - 590 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 47750657-47752847(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CAGGTACACGTGGCA
SmilChr04G002231 Chr04 NC_080390.1:36024627-36024641promoter 内 3384-3398 bp - 603 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36023044-36024024(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGAACTGACGTGGCA
SmilChr01G003728 Chr01 NC_080387.1:55591976-55591990promoter 内 3251-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55592726-55594756(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTCTGCA
SmilChr02G000322 Chr02 NC_080388.1:4043265-4043279promoter 内 3147-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4044119-4047447(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCATTTCA
SmilChr07G002812 Chr07 NC_080393.1:28162332-28162346promoter 内 3033-3047 bp + 954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28163300-28165693(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AACTCCCACGTGGCA
SmilChr03G003657 Chr03 NC_080389.1:55405690-55405704promoter 内 3020-3034 bp + 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55402730-55404723(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTGTCAAGA
SmilChr01G003214 Chr01 NC_080387.1:50938929-50938943promoter 内 2878-2892 bp - 1109 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 50926238-50937820(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAGGTCACGTGGAA
SmilChr03G001056 Chr03 NC_080389.1:12286568-12286582promoter 内 2466-2480 bp - 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 12282066-12285047(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGAAGACGTGGCT
SmilChr03G003660 Chr03 NC_080389.1:55424775-55424789promoter 内 2420-2434 bp - 1567 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55426356-55427793(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTGTCAAGA
SmilChr02G003752 Chr02 NC_080388.1:59156517-59156531promoter 内 2289-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 59158229-59162643(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGTTGACGTGGCG
SmilChr02G000710 Chr02 NC_080388.1:11458874-11458888promoter 内 2138-2152 bp - 1849 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 11455871-11457025(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GATACTCACGTGGCG
SmilChr01G000666 Chr01 NC_080387.1:14819321-14819335promoter 内 2070-2084 bp - 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 14814848-14817404(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGAAGACGTGGCT
SmilChr04G003909 Chr04 NC_080390.1:54830854-54830868promoter 内 1970-1984 bp + 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54832885-54835347(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCTTGACACGTGGCC
SmilChr01G000148 Chr01 NC_080387.1:2550958-2550972promoter 内 1811-1825 bp - 2176 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2548627-2548782(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCAGACACGTGGCC
SmilChr01G000668 Chr01 NC_080387.1:14819321-14819335promoter 内 1582-1596 bp - 2405 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 14821740-14822909(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCTTCTCC
SmilChr01G000147 Chr01 NC_080387.1:2550958-2550972promoter 内 1427-1441 bp - 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2545090-2548398(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCAGACACGTGGCC
SmilChr05G001965 Chr05 NC_080391.1:20226036-20226050promoter 内 1426-1440 bp + 2561 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 20222571-20223475(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAACTCC
SmilChr03G001059 Chr03 NC_080389.1:12286568-12286582promoter 内 1420-1434 bp - 2567 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 12289149-12290155(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCTTCTCC
SmilChr01G001163 Chr01 NC_080387.1:23621114-23621128promoter 内 1136-1150 bp + 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 23617057-23618263(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAACATC
SmilChr04G003125 Chr04 NC_080390.1:47858786-47858800promoter 内 1086-1100 bp + 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 47861701-47866822(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGTTGACGTGGCG
SmilChr02G005410 Chr02 NC_080388.1:74594987-74595001promoter 内 1064-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 74597924-74598825(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTTATCACGTGGCG
SmilChr08G004639 Chr08 NC_080394.1:55928567-55928581promoter 内 990-1004 bp + 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55919184-55925570(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCACCGAG
SmilChr04G003016 Chr04 NC_080390.1:46558129-46558143promoter 内 723-737 bp + 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 46553509-46554865(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGGGTAT
SmilChr08G000002 Chr08 NC_080394.1:24209-24223promoter 内 663-677 bp + 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27547-29579(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAACACGACGTGGCA
SmilChr02G005411 Chr02 NC_080388.1:74594987-74595001promoter 内 223-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 74598765-74599655(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTTATCACGTGGCG
SmilChr08G002750 Chr08 NC_080394.1:27152119-27152133promoter 内 144-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27155976-27158658(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCAGTTGACGTGGCA
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SmilChr04G003401 Chr04 NC_080390.1:50567739-50567753promoter 内 3871-3885 bp - 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 50567869-50569304(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCATCA
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SmilChr04G002461 Chr04 NC_080390.1:39435042-39435056promoter 内 2805-2819 bp + 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 39436238-39442760(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATAAATGACGTGGCA
SmilChr05G003658 Chr05 NC_080391.1:49285160-49285174promoter 内 1844-1858 bp + 2143 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 49267757-49283017(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGCCAAC
SmilChr04G002460 Chr04 NC_080390.1:39435042-39435056promoter 内 1151-1165 bp + 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 39425976-39432206(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCATTTAT
SmilChr08G002658 Chr08 NC_080394.1:26051197-26051211promoter 内 567-581 bp - 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 26054631-26060065(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGCCAAC