转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004179; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00012156-RA_Salv SmilChr03G004179 WRKY XP_057799230.1 MP00464 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9864 个结合位点 7299 个候选靶基因 第 46 / 146 下载 TSV

上一页 46 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002706 Chr02 NC_080388.1:46912398-46912411promoter 内 2748-2761 bp - 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 46906815-46911158(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTAGTTGACTTTCA
SmilChr02G000236 Chr02 NC_080388.1:3018607-3018620promoter 内 2645-2658 bp - 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 3016743-3017264(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAGTTGACTATTT
SmilChr04G001918 Chr04 NC_080390.1:31284819-31284832promoter 内 2540-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31275684-31283371(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTCTTTGACTTGTG
SmilChr01G003341 Chr01 NC_080387.1:52201449-52201462promoter 内 2455-2468 bp + 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52198054-52199916(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAAAGTCAACATT
SmilChr04G000399 Chr04 NC_080390.1:4117033-4117046promoter 内 2442-2455 bp + 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4118592-4120985(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCATTTGACTTTTT
SmilChr01G005118 Chr01 NC_080387.1:68979999-68980012promoter 内 2354-2367 bp - 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 68977183-68978365(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATCTTTGACTTTAT
SmilChr03G002424 Chr03 NC_080389.1:38511792-38511805promoter 内 2325-2338 bp + 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 38506408-38510129(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTAAAGTCAAAGGT
SmilChr03G002198 Chr03 NC_080389.1:34590740-34590753promoter 内 2317-2330 bp - 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34588198-34589069(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTCGTTGACTTAAT
SmilChr02G000861 Chr02 NC_080388.1:14783728-14783741promoter 内 2314-2327 bp + 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14785415-14786777(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTGGTTGACTTCCC
SmilChr01G000152 Chr01 NC_080387.1:2587316-2587329promoter 内 2298-2311 bp - 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2589019-2591200(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAAAGTG
SmilChr05G000075 Chr05 NC_080391.1:382812-382825promoter 内 2167-2180 bp - 1821 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 378227-380991(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTCTTTGACTTTGT
SmilChr02G002144 Chr02 NC_080388.1:38566032-38566045promoter 内 2113-2126 bp + 1875 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 38567920-38571160(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACCTTTGACTTCTG
SmilChr03G001103 Chr03 NC_080389.1:12695577-12695590promoter 内 2063-2076 bp + 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12691818-12693652(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCTTAGTCAACGCT
SmilChr03G002222 Chr03 NC_080389.1:35027699-35027712promoter 内 2023-2036 bp + 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34986555-35025734(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CAGAAGTCAAAGGT
SmilChr01G004790 Chr01 NC_080387.1:66118358-66118371promoter 内 1860-1873 bp + 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 66120499-66122980(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTAGTTGACTTTCA
SmilChr04G002949 Chr04 NC_080390.1:45820651-45820664promoter 内 1817-1830 bp + 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45817736-45818480(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAGAGTCAACGGA
SmilChr02G000237 Chr02 NC_080388.1:3018607-3018620promoter 内 1786-1799 bp - 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 3020822-3022040(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAATAGTCAACTCA
SmilChr03G002726 Chr03 NC_080389.1:43310774-43310787promoter 内 1754-1767 bp - 2234 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43313021-43320338(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAAAGTCAACTTG
SmilChr01G005616 Chr01 NC_080387.1:72675285-72675298promoter 内 1738-1751 bp - 2250 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72672952-72673035(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGCGTTGACTACAT
SmilChr02G002400 Chr02 NC_080388.1:41882934-41882947promoter 内 1738-1751 bp + 2250 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41885197-41886517(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CACTTTGACTTTGT
SmilChr01G005163 Chr01 NC_080387.1:69406747-69406760promoter 内 1717-1730 bp - 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69409031-69438236(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAACAAA
SmilChr02G004390 Chr02 NC_080388.1:66249011-66249024promoter 内 1577-1590 bp - 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 66251435-66255580(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCGAAGTCAACTCT
SmilChr02G004428 Chr02 NC_080388.1:66634013-66634026promoter 内 1564-1577 bp + 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 66636450-66640662(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATCTTTGACTTTAT
SmilChr04G000554 Chr04 NC_080390.1:6173725-6173738promoter 内 1507-1520 bp - 2481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6176219-6178488(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAAAAGTCAAATGC
SmilChr02G004209 Chr02 NC_080388.1:64358848-64358861promoter 内 1444-1457 bp + 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64352947-64356304(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATAAAGTCAAAGAT
SmilChr04G000915 Chr04 NC_080390.1:11908342-11908355promoter 内 1373-1386 bp + 2615 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 11903946-11905727(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAAAGTCAACATT
SmilChr01G004622 Chr01 NC_080387.1:64244344-64244357promoter 内 1358-1371 bp + 2630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64246987-64247791(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTTGTTGACTTTGT
SmilChr01G004325 Chr01 NC_080387.1:61410472-61410485promoter 内 1355-1368 bp + 2633 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 61404681-61407839(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAAAGTCAACTTG
SmilChr01G003865 Chr01 NC_080387.1:56894528-56894541promoter 内 1242-1255 bp - 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56897287-56900336(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAATAGTCAACTCA
SmilChr02G001328 Chr02 NC_080388.1:24739944-24739957promoter 内 1120-1133 bp - 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24742825-24747007(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CACAAGTCAAAGAC
SmilChr03G002204 Chr03 NC_080389.1:34685926-34685939promoter 内 821-834 bp - 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34689106-34692549(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAAAGTCAACATT
SmilChr02G003381 Chr02 NC_080388.1:54924385-54924398promoter 内 699-712 bp + 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54927687-54930592(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGAGTTGACTATTT
SmilChr02G002983 Chr02 NC_080388.1:50424993-50425006promoter 内 600-613 bp + 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50415867-50421605(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAATGTCAACGGC
SmilChr01G003342 Chr01 NC_080387.1:52201449-52201462promoter 内 594-607 bp + 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52204856-52207135(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AATGTTGACTTTGA
SmilChr03G003382 Chr03 NC_080389.1:52189357-52189370promoter 内 548-561 bp + 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52175671-52185917(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTGAAGTCAACTCT
SmilChr03G004204 Chr03 NC_080389.1:60653036-60653049promoter 内 514-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60643505-60649562(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTTGTTGACTTTGT
SmilChr01G000878 Chr01 NC_080387.1:18664632-18664645promoter 内 203-216 bp - 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 18659187-18660847(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTTGTTGACTTTGT
SmilChr01G004748 Chr01 NC_080387.1:65651021-65651034promoter 内 200-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 65644932-65647233(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAACAAG
SmilChr04G003588 Chr04 NC_080390.1:52322475-52322488promoter 内 133-146 bp + 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52317441-52318620(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAAGAGTCAACCAC
SmilChr04G002192 Chr04 NC_080390.1:35455047-35455060promoter 内 64-77 bp + 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 35458984-35459621(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTCGTTGACCATGG
SmilChr01G004027 Chr01 NC_080387.1:58699265-58699278promoter 内 40-53 bp + 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 58694404-58695317(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AACAAGTCAACAGC
SmilChr02G005319 Chr02 NC_080388.1:74063482-74063495promoter 内 29-42 bp - 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74067454-74069023(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAACAAA
SmilChr04G004032 Chr04 NC_080390.1:55575885-55575898promoter 内 21-34 bp - 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55579865-55581898(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAACAAG
SmilChr04G002267 Chr04 NC_080390.1:36679867-36679880promoter 内 1095-1108 bp - 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 36682773-36686580(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAAAGTCAAAGGA
SmilChr04G003353 Chr04 NC_080390.1:50135158-50135171promoter 内 3328-3341 bp + 660 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 50130386-50134498(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CAAAAGTCAAAACC
SmilChr03G004161 Chr03 NC_080389.1:60394827-60394840promoter 内 1208-1221 bp + 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 60391093-60392047(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAATGCC
SmilChr01G002777 Chr01 NC_080387.1:46212661-46212674promoter 内 991-1004 bp - 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 46205267-46209664(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTTG
SmilChr04G000160 Chr04 NC_080390.1:1393969-1393982promoter 内 848-861 bp - 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 1390228-1390829(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTGTTGACTTTAT
SmilChr03G001263 Chr03 NC_080389.1:14604451-14604464promoter 内 644-657 bp - 3344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 14598107-14601107(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTGTTGACTTTAT
SmilChr03G002874 Chr03 NC_080389.1:45416151-45416164promoter 内 227-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 45419925-45425806(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCCTTTGACTTTGA