转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 47 / 134 下载 TSV

上一页 47 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000559 Chr03 NC_080389.1:6065086-6065100promoter 内 736-750 bp + 3251 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 6058931-6061835(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCGCCACA
SmilChr03G000429 Chr03 NC_080389.1:4658859-4658873promoter 内 225-239 bp + 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 4662635-4663814(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCCTGTAATGATTAA
SmilChr03G002091 Chr03 NC_080389.1:32184837-32184851promoter 内 179-193 bp - 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 32188659-32197066(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATTTTG
SmilChr01G003173 Chr01 NC_080387.1:50541126-50541140promoter 内 3952-3966 bp - 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 50541175-50542457(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATAAAG
SmilChr01G002581 Chr01 NC_080387.1:43942726-43942740promoter 内 3951-3965 bp - 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 43942147-43942690(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGGTAATGATGTT
SmilChr03G001657 Chr03 NC_080389.1:21529351-21529365promoter 内 3840-3854 bp + 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 21529512-21531719(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAATAATGATTGA
SmilChr03G001041 Chr03 NC_080389.1:12129256-12129270promoter 内 3598-3612 bp + 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 12129659-12133243(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATGAATAATGATGAA
SmilChr01G001175 Chr01 NC_080387.1:23813208-23813222promoter 内 3581-3595 bp + 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 23813628-23815370(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTATAATGATTAG
SmilChr02G001150 Chr02 NC_080388.1:20959039-20959053promoter 内 3433-3447 bp - 554 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 20959607-20961547(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAGAGTC
SmilChr03G002441 Chr03 NC_080389.1:38755350-38755364promoter 内 3393-3407 bp - 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 38755958-38757062(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATTGTG
SmilChr02G000430 Chr02 NC_080388.1:5509791-5509805promoter 内 3383-3397 bp + 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 5510409-5511098(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAGTAATGATGTC
SmilChr02G002882 Chr02 NC_080388.1:49097027-49097041promoter 内 3341-3355 bp + 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 49094072-49096381(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGCTGTA
SmilChr01G004973 Chr01 NC_080387.1:67818874-67818888promoter 内 3308-3322 bp + 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 67819567-67820587(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAGTTAATGATTAC
SmilChr02G000667 Chr02 NC_080388.1:10289456-10289470promoter 内 2950-2964 bp + 1037 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 10290507-10291419(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAATGATGATTAG
SmilChr03G001040 Chr03 NC_080389.1:12129256-12129270promoter 内 2866-2880 bp + 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 12127188-12128135(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATTCAT
SmilChr03G001229 Chr03 NC_080389.1:14168254-14168268promoter 内 2838-2852 bp - 1149 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 14169417-14173721(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATTAAG
SmilChr02G004856 Chr02 NC_080388.1:70710674-70710688promoter 内 2660-2674 bp - 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 70707559-70709347(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGATCTAATGATTAT
SmilChr01G004465 Chr01 NC_080387.1:62751869-62751883promoter 内 2491-2505 bp + 1496 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 62745873-62750373(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTAGAAAT
SmilChr01G001218 Chr01 NC_080387.1:24448793-24448807promoter 内 2440-2454 bp + 1547 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 24450354-24518435(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTATAATGATTAG
SmilChr02G001049 Chr02 NC_080388.1:18564861-18564875promoter 内 2439-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 18566423-18567151(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTGCGATGATTAG
SmilChr01G002580 Chr01 NC_080387.1:43942726-43942740promoter 内 2153-2167 bp - 1834 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 43928311-43940892(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGGTAATGATGTT
SmilChr03G001705 Chr03 NC_080389.1:22632506-22632520promoter 内 1983-1997 bp - 2004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 22634524-22635551(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTGTCCAC
SmilChr02G001466 Chr02 NC_080388.1:27393814-27393828promoter 内 1951-1965 bp + 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 27390573-27391778(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATAATA
SmilChr02G000516 Chr02 NC_080388.1:7124790-7124804promoter 内 1945-1959 bp - 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 7120527-7122748(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGCGTAATGATTGG
SmilChr02G003727 Chr02 NC_080388.1:58906585-58906599promoter 内 1755-1769 bp - 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 58896027-58904353(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAATAATGATTGA
SmilChr01G001176 Chr01 NC_080387.1:23813208-23813222promoter 内 1752-1766 bp + 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 23815457-23819500(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTATAATGATTAG
SmilChr03G001651 Chr03 NC_080389.1:21453314-21453328promoter 内 1699-1713 bp + 2288 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 21449896-21451026(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTGTCCAC
SmilChr01G004466 Chr01 NC_080387.1:62751869-62751883promoter 内 1431-1445 bp + 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 62754439-62755737(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTCTAATGATGAG
SmilChr01G001102 Chr01 NC_080387.1:22546833-22546847promoter 内 1377-1391 bp + 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 22549457-22555678(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAAAGTAATAATTAC
SmilChr03G002172 Chr03 NC_080389.1:33774348-33774362promoter 内 1332-1346 bp + 2655 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 33777017-33780060(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCATGTGATGATTAA
SmilChr01G000873 Chr01 NC_080387.1:18608646-18608660promoter 内 1081-1095 bp + 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 18604931-18605740(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTGTCCAC
SmilChr01G000870 Chr01 NC_080387.1:18572299-18572313promoter 内 1019-1033 bp + 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 18567168-18569331(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTGTCCAC
SmilChr01G003719 Chr01 NC_080387.1:55516397-55516411promoter 内 870-884 bp - 3117 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 55519528-55523997(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGGAATC
SmilChr03G001364 Chr03 NC_080389.1:16001569-16001583promoter 内 634-648 bp - 3353 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 15995515-15998216(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTCTAATGATTAA
SmilChr01G005272 Chr01 NC_080387.1:70155267-70155281promoter 内 560-574 bp + 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 70158708-70159433(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTTTATAATGATGAT
SmilChr02G000425 Chr02 NC_080388.1:5430214-5430228promoter 内 153-167 bp - 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 5424566-5426380(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTGATGATGATTAA
SmilChr02G000237 Chr02 NC_080388.1:3016943-3016957promoter 内 122-136 bp - 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 3020822-3022040(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTGTCCAC
SmilChr02G003168 Chr02 NC_080388.1:52706535-52706549promoter 内 3848-3862 bp - 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52703178-52706396(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGTTAATGATGAG
SmilChr03G002976 Chr03 NC_080389.1:46605128-46605142promoter 内 3820-3834 bp + 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46601679-46604961(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTACGCAC
SmilChr02G001309 Chr02 NC_080388.1:24335822-24335836promoter 内 3756-3770 bp + 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 24321846-24335591(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATGA
SmilChr01G000077 Chr01 NC_080387.1:1349506-1349520promoter 内 3707-3721 bp - 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1346809-1349226(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGGACAATGATTGC
SmilChr02G000646 Chr02 NC_080388.1:9763378-9763392promoter 内 3695-3709 bp - 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9763684-9767184(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGTTATA
SmilChr03G000437 Chr03 NC_080389.1:4725666-4725680promoter 内 3564-3578 bp - 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 4724393-4725243(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCGAGTGATGATTAC
SmilChr01G005468 Chr01 NC_080387.1:71671282-71671296promoter 内 3550-3564 bp + 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 71667769-71670845(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCATCACC
SmilChr01G004972 Chr01 NC_080387.1:67818874-67818888promoter 内 3540-3554 bp + 447 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 67816486-67818427(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTAACTAT
SmilChr03G002035 Chr03 NC_080389.1:30712819-30712833promoter 内 3533-3547 bp + 454 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 30713287-30715139(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTCTAATGATGAG
SmilChr03G000876 Chr03 NC_080389.1:9948837-9948851promoter 内 3501-3515 bp - 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9944069-9948351(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAATTTAATGATTAC
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SmilChr02G002978 Chr02 NC_080388.1:50333253-50333267promoter 内 3323-3337 bp - 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50333931-50336240(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGCTGTA
SmilChr02G002090 Chr02 NC_080388.1:37493920-37493934promoter 内 3287-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37487786-37493220(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAAGCAATGATTGT