转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G000025; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021663-RA_Salv SmilChr01G000025 SBP XP_057790305.1 MP00633 TTGTACGGA

可能结合的靶基因

8026 个结合位点 6833 个候选靶基因 第 51 / 137 下载 TSV

上一页 51 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004769 Chr01 NC_080387.1:65862198-65862206promoter 内 3854-3862 bp + 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 65858151-65862059(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr08G000164 Chr08 NC_080394.1:1106051-1106059promoter 内 3841-3849 bp + 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 1106211-1113960(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr06G002423 Chr06 NC_080392.1:34975924-34975932promoter 内 3836-3844 bp - 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 34971203-34975767(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr03G000571 Chr03 NC_080389.1:6220199-6220207promoter 内 3824-3832 bp + 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 6217100-6220030(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr04G002897 Chr04 NC_080390.1:45257931-45257939promoter 内 3814-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 45258118-45264582(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr08G003233 Chr08 NC_080394.1:33241974-33241982promoter 内 3808-3816 bp + 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 33238606-33241789(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr06G000468 Chr06 NC_080392.1:3814691-3814699promoter 内 3790-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 3810922-3814488(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr01G002253 Chr01 NC_080387.1:39169021-39169029promoter 内 3773-3781 bp - 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 39169249-39176589(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr05G003398 Chr05 NC_080391.1:45022269-45022277promoter 内 3773-3781 bp + 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 45022497-45023153(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACGTACGGA
SmilChr03G001779 Chr03 NC_080389.1:24302727-24302735promoter 内 3771-3779 bp + 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 24302957-24304005(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACGTACGGA
SmilChr07G000088 Chr07 NC_080393.1:461035-461043promoter 内 3770-3778 bp - 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 461266-470228(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr02G001044 Chr02 NC_080388.1:18506644-18506652promoter 内 3767-3775 bp - 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18501069-18506418(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr04G003873 Chr04 NC_080390.1:54618503-54618511promoter 内 3765-3773 bp + 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 54618739-54624545(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr02G004835 Chr02 NC_080388.1:70472360-70472368promoter 内 3756-3764 bp - 237 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 70472605-70475789(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr07G004015 Chr07 NC_080393.1:51224629-51224637promoter 内 3744-3752 bp + 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 51224886-51226869(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr06G002431 Chr06 NC_080392.1:35079576-35079584promoter 内 3694-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 35075471-35079277(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr01G002337 Chr01 NC_080387.1:40552822-40552830promoter 内 3693-3701 bp - 300 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 40547927-40552522(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACGTACGGA
SmilChr07G000714 Chr07 NC_080393.1:4968669-4968677promoter 内 3682-3690 bp - 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 4968988-4972128(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr01G004024 Chr01 NC_080387.1:58649184-58649192promoter 内 3666-3674 bp + 327 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 58648182-58648857(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 TCCGTACGT
SmilChr05G000930 Chr05 NC_080391.1:7455549-7455557promoter 内 3656-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 7452640-7455212(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 TCCGTACGT
SmilChr02G000945 Chr02 NC_080388.1:16479070-16479078promoter 内 3649-3657 bp - 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 16479422-16481071(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr07G000885 Chr07 NC_080393.1:6344695-6344703promoter 内 3641-3649 bp + 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 6345055-6348080(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACGTACGGA
SmilChr02G004748 Chr02 NC_080388.1:69689872-69689880promoter 内 3633-3641 bp - 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 69684844-69689512(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr01G002826 Chr01 NC_080387.1:46864932-46864940promoter 内 3625-3633 bp + 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 46865308-46866386(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACGTACGGA
SmilChr02G004653 Chr02 NC_080388.1:68961980-68961988promoter 内 3619-3627 bp + 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 68959571-68961606(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 TCCGTACGT
SmilChr08G000396 Chr08 NC_080394.1:2789495-2789503promoter 内 3602-3610 bp + 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 2783361-2789104(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr04G002921 Chr04 NC_080390.1:45472977-45472985promoter 内 3588-3596 bp - 405 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 45467096-45472572(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr08G000401 Chr08 NC_080394.1:2819526-2819534promoter 内 3587-3595 bp + 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 2814778-2819120(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr04G001309 Chr04 NC_080390.1:20896920-20896928promoter 内 3583-3591 bp - 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 20892283-20896510(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr06G001275 Chr06 NC_080392.1:13349702-13349710promoter 内 3583-3591 bp + 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 13350120-13353484(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr02G004096 Chr02 NC_080388.1:63271694-63271702promoter 内 3579-3587 bp + 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 63272116-63275906(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACGTACGGA
SmilChr07G000115 Chr07 NC_080393.1:645388-645396promoter 内 3575-3583 bp - 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 644810-644970(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr07G000131 Chr07 NC_080393.1:781135-781143promoter 内 3573-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 781563-784232(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr08G001254 Chr08 NC_080394.1:9952326-9952334promoter 内 3569-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 9942601-9951902(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr06G001254 Chr06 NC_080392.1:13049559-13049567promoter 内 3557-3565 bp - 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 13045157-13049123(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
SmilChr04G000904 Chr04 NC_080390.1:11785545-11785553promoter 内 3547-3555 bp + 446 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 11781730-11785099(-) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 ACCGTACAC
SmilChr05G001896 Chr05 NC_080391.1:19260249-19260257promoter 内 3546-3554 bp + 447 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 19260704-19267673(+) SMil_00021663-RA_Salv MP00633 GTGTACGGT
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