转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G003267; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018221-RA_Salv SmilChr08G003267 MYB XP_057779249.1 MP00406 AAAAAATTAGGTAAA

可能结合的靶基因

9917 个结合位点 7839 个候选靶基因 第 52 / 157 下载 TSV

上一页 52 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001864 Chr02 NC_080388.1:33885966-33885980promoter 内 1410-1424 bp - 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 33882997-33883389(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAAATATTAGGTGAT
SmilChr04G003611 Chr04 NC_080390.1:52596411-52596425promoter 内 994-1008 bp + 2993 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 52599418-52601315(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TAAATATTAGGTGTG
SmilChr01G003715 Chr01 NC_080387.1:55493670-55493684promoter 内 868-882 bp - 3119 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 55486465-55490551(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATTTATTAGGTAAT
SmilChr05G001049 Chr05 NC_080391.1:8696071-8696085promoter 内 800-814 bp + 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 8691529-8692884(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCCACCTAATATCTC
SmilChr03G004736 Chr03 NC_080389.1:64498019-64498033promoter 内 787-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 64490771-64494819(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CACACCTAATATTCT
SmilChr01G004331 Chr01 NC_080387.1:61459491-61459505promoter 内 782-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 61454574-61456286(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATAAATTTAGGTAAA
SmilChr05G001482 Chr05 NC_080391.1:13588923-13588937promoter 内 275-289 bp - 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 13592649-13593918(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTTACCTAAATTATT
SmilChr03G004453 Chr03 NC_080389.1:62645280-62645294promoter 内 45-59 bp - 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 62649236-62651273(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAATAATAT
SmilChr04G001927 Chr04 NC_080390.1:31378871-31378885promoter 内 3980-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 31378892-31380915(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AACACCTAATTTTAT
SmilChr02G005354 Chr02 NC_080388.1:74295768-74295782promoter 内 3950-3964 bp - 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74295644-74295731(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCAAAATTAGGTCTT
SmilChr02G003511 Chr02 NC_080388.1:56313054-56313068promoter 内 3942-3956 bp - 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 56313113-56314634(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TACACCTAATTAATT
SmilChr05G004358 Chr05 NC_080391.1:57161121-57161135promoter 内 3938-3952 bp + 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57161184-57165169(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATTAATTAGGTGTA
SmilChr01G003965 Chr01 NC_080387.1:58095716-58095730promoter 内 3891-3905 bp + 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 58095826-58097367(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAATAATTAGGTGGT
SmilChr01G002645 Chr01 NC_080387.1:44757607-44757621promoter 内 3865-3879 bp - 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 44757743-44763466(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATATCTG
SmilChr04G000854 Chr04 NC_080390.1:10806507-10806521promoter 内 3850-3864 bp + 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 10801464-10806370(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATGACCTAATTAATT
SmilChr02G005353 Chr02 NC_080388.1:74295768-74295782promoter 内 3812-3826 bp - 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74295498-74295593(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCAAAATTAGGTCTT
SmilChr04G001921 Chr04 NC_080390.1:31299963-31299977promoter 内 3802-3816 bp + 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 31294926-31299778(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTGCT
SmilChr03G000285 Chr03 NC_080389.1:3250484-3250498promoter 内 3744-3758 bp + 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 3248378-3250241(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAAATTCTC
SmilChr02G002822 Chr02 NC_080388.1:48336226-48336240promoter 内 3702-3716 bp + 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 48336525-48342033(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAAAATTTAGGTATG
SmilChr02G005352 Chr02 NC_080388.1:74295768-74295782promoter 内 3673-3687 bp - 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74295357-74295454(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCAAAATTAGGTCTT
SmilChr05G000237 Chr05 NC_080391.1:1828014-1828028promoter 内 3635-3649 bp - 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1826640-1827662(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAATAATTAGGTGAT
SmilChr05G002153 Chr05 NC_080391.1:22745995-22746009promoter 内 3593-3607 bp - 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 22744894-22745601(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGCAAATTAGGTGAA
SmilChr02G002330 Chr02 NC_080388.1:41001755-41001769promoter 内 3577-3591 bp - 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 41002179-41007005(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTGCT
SmilChr01G002285 Chr01 NC_080387.1:39656655-39656669promoter 内 3560-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 39657096-39661995(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTGCT
SmilChr02G003649 Chr02 NC_080388.1:57878680-57878694promoter 内 3547-3561 bp + 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57877483-57878240(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TACACCTAATTAATT
SmilChr03G000859 Chr03 NC_080389.1:9819922-9819936promoter 内 3502-3516 bp + 485 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9813814-9819437(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAACCTTTG
SmilChr02G005351 Chr02 NC_080388.1:74295768-74295782promoter 内 3496-3510 bp - 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74295157-74295277(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCAAAATTAGGTCTT
SmilChr01G005737 Chr01 NC_080387.1:73495772-73495786promoter 内 3337-3351 bp - 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 73496436-73501008(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTAACCTAATATTTT
SmilChr02G002956 Chr02 NC_080388.1:50095558-50095572promoter 内 3336-3350 bp - 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 50093535-50094907(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGCAAATTAGGTGAA
SmilChr05G004125 Chr05 NC_080391.1:55160807-55160821promoter 内 3330-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55155072-55160150(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATACCTAATATTAA
SmilChr05G002138 Chr05 NC_080391.1:22512900-22512914promoter 内 3234-3248 bp - 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 22513667-22517670(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTGCT
SmilChr01G004158 Chr01 NC_080387.1:60079084-60079098promoter 内 3193-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 60076355-60078290(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGAAAATTAGGTTAA
SmilChr03G000860 Chr03 NC_080389.1:9819922-9819936promoter 内 3184-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9820739-9825687(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAAAGGTTAGGTAAA
SmilChr02G003615 Chr02 NC_080388.1:57408544-57408558promoter 内 3166-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57409379-57422409(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATTAATTAGGTGTA
SmilChr05G000238 Chr05 NC_080391.1:1828014-1828028promoter 内 3165-3179 bp - 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1828850-1829623(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATCACCTAATTATTG
SmilChr02G003420 Chr02 NC_080388.1:55421009-55421023promoter 内 3161-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55421849-55423989(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATATAATTAGGTGTA
SmilChr02G003969 Chr02 NC_080388.1:61871354-61871368promoter 内 3161-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 61872194-61874227(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CATTAATTAGGTCCA
SmilChr01G001265 Chr01 NC_080387.1:25346559-25346573promoter 内 3134-3148 bp - 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 25343733-25345706(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ACCATATTAGGTAGG
SmilChr02G005350 Chr02 NC_080388.1:74295768-74295782promoter 内 3134-3148 bp - 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74294780-74294915(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCAAAATTAGGTCTT
SmilChr01G001416 Chr01 NC_080387.1:27750452-27750466promoter 内 3099-3113 bp + 888 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 27748842-27749564(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAAACCTAATTTTTT
SmilChr04G002017 Chr04 NC_080390.1:32722643-32722657promoter 内 3078-3092 bp - 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 32717587-32721734(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAAGTGTTAGGTAAG
SmilChr03G003503 Chr03 NC_080389.1:53644670-53644684promoter 内 3067-3081 bp - 920 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 53645604-53647041(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCTGCCTAATTTATT
SmilChr02G000147 Chr02 NC_080388.1:1967300-1967314promoter 内 3056-3070 bp + 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1963212-1966369(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CATACCTAATTAGCC
SmilChr01G006095 Chr01 NC_080387.1:76423369-76423383promoter 内 3045-3059 bp + 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 76419834-76422427(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGGACCTAATTTAGA
SmilChr05G001131 Chr05 NC_080391.1:9453873-9453887promoter 内 3008-3022 bp - 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9454866-9460930(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATGCCTAATTTTTA
SmilChr01G001266 Chr01 NC_080387.1:25346559-25346573promoter 内 2870-2884 bp - 1117 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 25347690-25350063(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCTACCTAATATGGT
SmilChr03G001680 Chr03 NC_080389.1:22083482-22083496promoter 内 2866-2880 bp + 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 22076687-22082361(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAAATTTAT
SmilChr04G000743 Chr04 NC_080390.1:9118013-9118027promoter 内 2863-2877 bp - 1124 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9119151-9123253(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTAACCTAATTATTC
SmilChr05G001704 Chr05 NC_080391.1:16269645-16269659promoter 内 2728-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16270918-16272794(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATTTATTAGGTAAT
SmilChr02G001945 Chr02 NC_080388.1:35072573-35072587promoter 内 2672-2686 bp + 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35073902-35076549(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGCAAATTAGGTGAA