转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 57 / 143 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005027 Chr01 NC_080387.1:68224706-68224717promoter 内 897-908 bp + 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 68227810-68231451(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr04G001196 Chr04 NC_080390.1:18311114-18311125promoter 内 872-883 bp - 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 18314243-18314755(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr05G004343 Chr05 NC_080391.1:57065883-57065894promoter 内 865-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 57069019-57072858(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTG
SmilChr08G003732 Chr08 NC_080394.1:42147145-42147156promoter 内 822-833 bp - 3168 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 42150324-42154725(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr02G002413 Chr02 NC_080388.1:42098096-42098107promoter 内 804-815 bp - 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 42101293-42101960(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr04G001290 Chr04 NC_080390.1:20564429-20564440promoter 内 773-784 bp - 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 20567657-20568346(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGT
SmilChr07G003171 Chr07 NC_080393.1:33756575-33756586promoter 内 706-717 bp - 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 33759870-33762067(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G000347 Chr01 NC_080387.1:7118141-7118152promoter 内 654-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 7114407-7114805(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr05G002916 Chr05 NC_080391.1:35127577-35127588promoter 内 582-593 bp + 3408 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 35121746-35124169(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTC
SmilChr03G003587 Chr03 NC_080389.1:54497594-54497605promoter 内 532-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 54501063-54503556(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCAG
SmilChr08G000493 Chr08 NC_080394.1:3564024-3564035promoter 内 528-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3556320-3560562(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAGA
SmilChr06G003138 Chr06 NC_080392.1:44333225-44333236promoter 内 526-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 44328304-44329761(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr02G000329 Chr02 NC_080388.1:4206153-4206164promoter 内 507-518 bp - 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 4201138-4202670(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTG
SmilChr02G000332 Chr02 NC_080388.1:4214141-4214152promoter 内 507-518 bp - 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 4209441-4210658(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTG
SmilChr03G002087 Chr03 NC_080389.1:32163056-32163067promoter 内 424-435 bp + 3566 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32156574-32159490(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr03G002744 Chr03 NC_080389.1:43601629-43601640promoter 内 395-406 bp - 3595 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 43605235-43608348(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G000804 Chr01 NC_080387.1:17346881-17346892promoter 内 348-359 bp + 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 17339192-17343239(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G000833 Chr01 NC_080387.1:17957613-17957624promoter 内 308-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 17961306-17965999(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G005325 Chr01 NC_080387.1:70482676-70482687promoter 内 303-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70466763-70478989(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr03G002057 Chr03 NC_080389.1:31328968-31328979promoter 内 273-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 31332696-31333860(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr01G001379 Chr01 NC_080387.1:27191921-27191932promoter 内 129-140 bp + 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 27187377-27188060(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G000405 Chr01 NC_080387.1:8244008-8244019promoter 内 102-113 bp + 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8237862-8240120(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGT
SmilChr08G001686 Chr08 NC_080394.1:14085303-14085314promoter 内 81-92 bp + 3909 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 14089223-14091422(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCAC
SmilChr01G001437 Chr01 NC_080387.1:28035917-28035928promoter 内 38-49 bp - 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 28031849-28031965(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAGA
SmilChr05G000026 Chr05 NC_080391.1:132946-132957promoter 内 3653-3664 bp - 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 133294-136686(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGT
SmilChr05G000345 Chr05 NC_080391.1:2579419-2579430promoter 内 2886-2897 bp - 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 2558691-2578315(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGAT
SmilChr05G000281 Chr05 NC_080391.1:2179020-2179031promoter 内 2974-2985 bp - 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2180047-2180617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGT
SmilChr01G004792 Chr01 NC_080387.1:66157343-66157354promoter 内 2879-2890 bp + 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 66158465-66160292(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCGC
SmilChr02G004970 Chr02 NC_080388.1:71598443-71598454promoter 内 2481-2492 bp - 1509 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 71595479-71596934(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAC
SmilChr02G000587 Chr02 NC_080388.1:8442524-8442535promoter 内 2394-2405 bp - 1596 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 8444131-8445285(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGC
SmilChr07G001092 Chr07 NC_080393.1:8029109-8029120promoter 内 2203-2214 bp + 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 8030907-8036273(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTT
SmilChr07G001090 Chr07 NC_080393.1:8029109-8029120promoter 内 1213-1224 bp + 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 8023285-8026332(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGT
SmilChr02G000588 Chr02 NC_080388.1:8442524-8442535promoter 内 1197-1208 bp - 2793 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 8445328-8446504(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGC
SmilChr05G000614 Chr05 NC_080391.1:4610805-4610816promoter 内 1120-1131 bp - 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 4613686-4616997(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGC
SmilChr08G003456 Chr08 NC_080394.1:37044338-37044349promoter 内 430-441 bp + 3560 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 37047909-37054293(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGTA
SmilChr03G001734 Chr03 NC_080389.1:23305672-23305683promoter 内 421-432 bp + 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 23309252-23310665(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCGC
SmilChr01G001415 Chr01 NC_080387.1:27748927-27748938promoter 内 166-177 bp - 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 27744491-27745103(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTT
SmilChr08G003432 Chr08 NC_080394.1:36590235-36590246promoter 内 100-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 36594136-36598914(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGC
SmilChr01G001791 Chr01 NC_080387.1:32770587-32770598promoter 内 3413-3424 bp + 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 32771175-32776784(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATA
SmilChr05G002667 Chr05 NC_080391.1:30167048-30167059promoter 内 3348-3359 bp + 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 30165094-30166406(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCCC
SmilChr06G001545 Chr06 NC_080392.1:16760626-16760637promoter 内 3155-3166 bp - 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 16755418-16759791(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAC
SmilChr04G002706 Chr04 NC_080390.1:42665039-42665050promoter 内 3116-3127 bp + 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 42665924-42668713(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAC
SmilChr06G002929 Chr06 NC_080392.1:42156458-42156469promoter 内 2968-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 42153638-42155436(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAG
SmilChr01G003879 Chr01 NC_080387.1:57118574-57118585promoter 内 2906-2917 bp + 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 57111588-57117490(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCCA
SmilChr02G005042 Chr02 NC_080388.1:72146766-72146777promoter 内 2605-2616 bp - 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 72142577-72145381(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGAG
SmilChr06G002144 Chr06 NC_080392.1:29121484-29121495promoter 内 2463-2474 bp + 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 29123022-29125299(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATA
SmilChr08G002374 Chr08 NC_080394.1:22534885-22534896promoter 内 2435-2446 bp + 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 22536451-22537099(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGAG
SmilChr02G000381 Chr02 NC_080388.1:4775476-4775487promoter 内 2368-2379 bp - 1622 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4772304-4773854(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTT
SmilChr08G002372 Chr08 NC_080394.1:22534885-22534896promoter 内 2287-2298 bp + 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 22531972-22533182(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCCT
SmilChr02G000793 Chr02 NC_080388.1:13082610-13082621promoter 内 2068-2079 bp + 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 13079223-13080688(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCTA