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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 57 / 148 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001985 Chr04 NC_080390.1:32145575-32145588promoter 内 3796-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 32143712-32145383(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATAAGACACGTGG
SmilChr04G003021 Chr04 NC_080390.1:46615863-46615876promoter 内 3791-3804 bp + 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 46611719-46615666(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCGCTG
SmilChr03G001806 Chr03 NC_080389.1:24675391-24675404promoter 内 3643-3656 bp + 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 24675749-24675822(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGCTTTCACGTGG
SmilChr06G002324 Chr06 NC_080392.1:33566638-33566651promoter 内 3628-3641 bp - 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 33564743-33566278(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGAGATCACGTGC
SmilChr06G002094 Chr06 NC_080392.1:27864829-27864842promoter 内 3491-3504 bp - 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 27862462-27864332(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAATGTCACGTGC
SmilChr02G000013 Chr02 NC_080388.1:102250-102263promoter 内 3475-3488 bp + 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 101051-101737(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCCACT
SmilChr01G005092 Chr01 NC_080387.1:68782013-68782026promoter 内 3435-3448 bp - 553 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 68782579-68784843(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTAGTC
SmilChr02G005528 Chr02 NC_080388.1:75346448-75346461promoter 内 3433-3446 bp - 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 75347016-75350583(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACATTTT
SmilChr02G000859 Chr02 NC_080388.1:14757146-14757159promoter 内 3158-3171 bp - 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14755255-14756316(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGAGATCACGTGC
SmilChr05G000887 Chr05 NC_080391.1:7013652-7013665promoter 内 3119-3132 bp - 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7014534-7015857(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTGCG
SmilChr03G003657 Chr03 NC_080389.1:55405689-55405702promoter 内 3022-3035 bp + 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 55402730-55404723(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAAGAT
SmilChr06G002618 Chr06 NC_080392.1:37650934-37650947promoter 内 3014-3027 bp - 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 37649103-37649960(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGAGATCACGTGC
SmilChr07G000888 Chr07 NC_080393.1:6365318-6365331promoter 内 2862-2875 bp - 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 6360987-6364192(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTATGTCACGTGT
SmilChr05G002393 Chr05 NC_080391.1:26424222-26424235promoter 内 2852-2865 bp + 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 26425371-26428150(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGCCGTCACGTGC
SmilChr05G000949 Chr05 NC_080391.1:7662901-7662914promoter 内 2798-2811 bp - 1190 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7664104-7664721(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTGCG
SmilChr03G004081 Chr03 NC_080389.1:59738823-59738836promoter 内 2718-2731 bp - 1270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59740106-59746274(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCCTT
SmilChr07G001199 Chr07 NC_080393.1:9109473-9109486promoter 内 2687-2700 bp - 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 9107627-9108172(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAATGGCACGTGG
SmilChr05G002351 Chr05 NC_080391.1:25489028-25489041promoter 内 2638-2651 bp - 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25490391-25491773(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTCAC
SmilChr05G001286 Chr05 NC_080391.1:11002008-11002021promoter 内 2637-2650 bp + 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 11003372-11005941(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAGCACCACGTGG
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SmilChr01G003615 Chr01 NC_080387.1:54686458-54686471promoter 内 2606-2619 bp + 1382 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54682165-54685076(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACCACCG
SmilChr05G001058 Chr05 NC_080391.1:8752247-8752260promoter 内 2569-2582 bp + 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8750757-8750828(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTTACT
SmilChr03G002362 Chr03 NC_080389.1:37248433-37248446promoter 内 2502-2515 bp - 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 37249932-37253935(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACACG
SmilChr07G003744 Chr07 NC_080393.1:45643344-45643357promoter 内 2493-2506 bp + 1495 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 45644852-45644958(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTCCACACGTGG
SmilChr05G002589 Chr05 NC_080391.1:29103541-29103554promoter 内 2440-2453 bp - 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 29101887-29101993(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTCCACACGTGG
SmilChr03G003660 Chr03 NC_080389.1:55424777-55424790promoter 内 2422-2435 bp - 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 55426356-55427793(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAAGAT
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SmilChr05G001057 Chr05 NC_080391.1:8752247-8752260promoter 内 2268-2281 bp + 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8749200-8750527(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTTACT
SmilChr05G000570 Chr05 NC_080391.1:4277064-4277077promoter 内 2161-2174 bp - 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4278904-4284600(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACCACCG
SmilChr07G001581 Chr07 NC_080393.1:13017030-13017043promoter 内 2150-2163 bp - 1838 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 13014313-13015192(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGTAGCCACGTGG
SmilChr01G003289 Chr01 NC_080387.1:51590772-51590785promoter 内 2072-2085 bp + 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 51592701-51596225(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGGTATCACGTGG
SmilChr05G001613 Chr05 NC_080391.1:14857668-14857681promoter 内 2038-2051 bp + 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14852260-14855718(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTCAC
SmilChr02G005143 Chr02 NC_080388.1:72840326-72840339promoter 内 1978-1991 bp + 2010 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 72835906-72838316(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCTTAT
SmilChr04G003909 Chr04 NC_080390.1:54830853-54830866promoter 内 1969-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54832885-54835347(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCTTGACACGTGG
SmilChr05G002329 Chr05 NC_080391.1:25151632-25151645promoter 内 1957-1970 bp + 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25142865-25149601(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGGAGCA
SmilChr05G004349 Chr05 NC_080391.1:57109508-57109521promoter 内 1949-1962 bp - 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 57103791-57107469(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAATGGACACGTGG
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SmilChr05G002524 Chr05 NC_080391.1:28083268-28083281promoter 内 1734-1747 bp + 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 28085535-28090191(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGGTATCACGTGG
SmilChr03G002724 Chr03 NC_080389.1:43257652-43257665promoter 内 1516-1529 bp + 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 43260137-43262411(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACGCAACACGTGG
SmilChr07G002440 Chr07 NC_080393.1:22830284-22830297promoter 内 1232-1245 bp + 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 22827457-22827528(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCTCCT
SmilChr05G001547 Chr05 NC_080391.1:14167209-14167222promoter 内 1060-1073 bp - 2928 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14161465-14164281(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGAGATCACGTGC
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SmilChr07G004664 Chr07 NC_080393.1:59532207-59532220promoter 内 864-877 bp + 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59535344-59545921(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGCTGTCACGTGA
SmilChr01G006099 Chr01 NC_080387.1:76480807-76480820promoter 内 654-667 bp - 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 76484154-76486020(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTGAC
SmilChr05G001557 Chr05 NC_080391.1:14291668-14291681promoter 内 631-644 bp + 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14286013-14288311(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCATTTA
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SmilChr02G002187 Chr02 NC_080388.1:39079971-39079984promoter 内 538-551 bp - 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 39074556-39076521(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTCAGGCACGTGG