转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 57 / 136 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G003169 Chr06 NC_080392.1:44642127-44642137promoter 内 3690-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 44640269-44641826(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCT
SmilChr04G002168 Chr04 NC_080390.1:35028279-35028289promoter 内 3654-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 35026911-35027942(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr03G001962 Chr03 NC_080389.1:28111183-28111193promoter 内 3564-3574 bp + 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 28111620-28116633(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACG
SmilChr05G004133 Chr05 NC_080391.1:55324766-55324776promoter 内 3449-3459 bp - 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55309027-55324224(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTG
SmilChr05G000967 Chr05 NC_080391.1:7812901-7812911promoter 内 3373-3383 bp - 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7809252-7812283(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGG
SmilChr07G004240 Chr07 NC_080393.1:54809264-54809274promoter 内 3365-3375 bp + 626 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54809900-54815770(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTG
SmilChr05G004031 Chr05 NC_080391.1:54307149-54307159promoter 内 3352-3362 bp + 639 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54307798-54307992(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr01G003523 Chr01 NC_080387.1:53856436-53856446promoter 内 3344-3354 bp + 647 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 53857093-53857698(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCC
SmilChr06G001340 Chr06 NC_080392.1:13940161-13940171promoter 内 3319-3329 bp + 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 13936641-13939489(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAC
SmilChr01G005252 Chr01 NC_080387.1:70033451-70033461promoter 内 3316-3326 bp - 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70034136-70036176(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCT
SmilChr08G002086 Chr08 NC_080394.1:18745574-18745584promoter 内 3316-3326 bp + 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 18742299-18744899(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr07G000203 Chr07 NC_080393.1:1288775-1288785promoter 内 3278-3288 bp + 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1284978-1288062(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr01G000783 Chr01 NC_080387.1:17047861-17047871promoter 内 3248-3258 bp - 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 17046258-17047118(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCC
SmilChr07G000196 Chr07 NC_080393.1:1233820-1233830promoter 内 3238-3248 bp + 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1230491-1233067(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr04G003574 Chr04 NC_080390.1:52160869-52160879promoter 内 3220-3230 bp + 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 52157094-52160098(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr08G004523 Chr08 NC_080394.1:54797328-54797338promoter 内 3201-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54798128-54800689(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr02G002104 Chr02 NC_080388.1:37724167-37724177promoter 内 3199-3209 bp + 792 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 37724969-37727465(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr05G000904 Chr05 NC_080391.1:7168317-7168327promoter 内 3180-3190 bp - 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7164771-7167506(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGG
SmilChr05G000090 Chr05 NC_080391.1:502531-502541promoter 内 3049-3059 bp - 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 499024-501589(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr02G000327 Chr02 NC_080388.1:4132670-4132680promoter 内 3033-3043 bp + 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 4130655-4131712(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr02G000626 Chr02 NC_080388.1:9354644-9354654promoter 内 3000-3010 bp - 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9350353-9353653(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACG
SmilChr04G003804 Chr04 NC_080390.1:54211350-54211360promoter 内 2978-2988 bp + 1013 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54207914-54210337(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCT
SmilChr02G000501 Chr02 NC_080388.1:6886221-6886231promoter 内 2977-2987 bp + 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 6883782-6885207(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCC
SmilChr08G004644 Chr08 NC_080394.1:55952337-55952347promoter 内 2977-2987 bp - 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55945247-55951323(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr06G003069 Chr06 NC_080392.1:43576366-43576376promoter 内 2967-2977 bp + 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 43577400-43578756(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr02G002807 Chr02 NC_080388.1:48136977-48136987promoter 内 2955-2965 bp - 1036 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48132758-48135941(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr08G001900 Chr08 NC_080394.1:16507501-16507511promoter 内 2925-2935 bp - 1066 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 16508577-16508650(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr01G003128 Chr01 NC_080387.1:50115298-50115308promoter 内 2917-2927 bp + 1074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 50116382-50117713(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr07G000719 Chr07 NC_080393.1:5006121-5006131promoter 内 2917-2927 bp - 1074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 5004945-5005047(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGG
SmilChr05G003071 Chr05 NC_080391.1:38642076-38642086promoter 内 2881-2891 bp - 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 38643196-38646042(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr08G003182 Chr08 NC_080394.1:32551514-32551524promoter 内 2859-2869 bp + 1132 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 32552656-32561997(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr07G000209 Chr07 NC_080393.1:1334075-1334085promoter 内 2847-2857 bp + 1144 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1329631-1332931(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr02G003258 Chr02 NC_080388.1:53882910-53882920promoter 内 2783-2793 bp + 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 53884128-53887403(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr08G002210 Chr08 NC_080394.1:20074927-20074937promoter 内 2772-2782 bp + 1219 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20076156-20079410(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr05G000938 Chr05 NC_080391.1:7551830-7551840promoter 内 2762-2772 bp + 1229 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7553069-7555748(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr08G002129 Chr08 NC_080394.1:19168987-19168997promoter 内 2758-2768 bp + 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19170230-19175271(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr06G001902 Chr06 NC_080392.1:22824588-22824598promoter 内 2753-2763 bp + 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 22825836-22828673(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr06G001009 Chr06 NC_080392.1:9985843-9985853promoter 内 2707-2717 bp + 1284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9980226-9984559(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr06G000697 Chr06 NC_080392.1:6204345-6204355promoter 内 2651-2661 bp + 1340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 6205695-6209469(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr05G002659 Chr05 NC_080391.1:30082738-30082748promoter 内 2618-2628 bp + 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 30084121-30089034(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr01G005564 Chr01 NC_080387.1:72443517-72443527promoter 内 2596-2606 bp - 1395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 72440327-72442122(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr04G001624 Chr04 NC_080390.1:27003474-27003484promoter 内 2571-2581 bp + 1420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 27004904-27011019(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCC
SmilChr08G002702 Chr08 NC_080394.1:26590393-26590403promoter 内 2562-2572 bp - 1429 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 26585988-26588964(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACG
SmilChr01G005726 Chr01 NC_080387.1:73407677-73407687promoter 内 2555-2565 bp + 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 73409123-73409703(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTG
SmilChr05G004032 Chr05 NC_080391.1:54307149-54307159promoter 内 2500-2510 bp + 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54308650-54308810(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr02G002910 Chr02 NC_080388.1:49406124-49406134promoter 内 2437-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49407688-49432281(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr03G003141 Chr03 NC_080389.1:48629601-48629611promoter 内 2431-2441 bp - 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48627339-48628041(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCC
SmilChr01G000800 Chr01 NC_080387.1:17279802-17279812promoter 内 2428-2438 bp - 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 17281375-17287044(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCT
SmilChr01G000754 Chr01 NC_080387.1:16624749-16624759promoter 内 2422-2432 bp + 1569 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 16616861-16623180(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCT
SmilChr02G003694 Chr02 NC_080388.1:58396436-58396446promoter 内 2412-2422 bp + 1579 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 58398025-58399976(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC