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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005851; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011948-RA_Salv SmilChr01G005851 MYB XP_057789306.1 MP00055 CAGATAAGGT

可能结合的靶基因

9685 个结合位点 6638 个候选靶基因 第 59 / 133 下载 TSV

上一页 59 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000708 Chr02 NC_080388.1:11399410-11399419promoter 内 620-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 11393227-11396038(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCCTTATCTC
SmilChr02G002678 Chr02 NC_080388.1:46346186-46346195promoter 内 598-607 bp + 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 46349589-46352170(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGGA
SmilChr03G000198 Chr03 NC_080389.1:2256599-2256608promoter 内 576-585 bp - 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 2260024-2265235(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACCTTATCGA
SmilChr01G002592 Chr01 NC_080387.1:44040842-44040851promoter 内 567-576 bp - 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 44036941-44037417(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGGG
SmilChr01G004469 Chr01 NC_080387.1:62791121-62791130promoter 内 501-510 bp - 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 62786523-62787630(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGGG
SmilChr02G004554 Chr02 NC_080388.1:68062223-68062232promoter 内 498-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 68055111-68058729(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGGG
SmilChr02G001156 Chr02 NC_080388.1:21113025-21113034promoter 内 461-470 bp - 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 21105216-21109494(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGGG
SmilChr03G000865 Chr03 NC_080389.1:9846021-9846030promoter 内 410-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9849612-9855030(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCCTTATCTT
SmilChr01G001972 Chr01 NC_080387.1:35101878-35101887promoter 内 400-409 bp + 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 35105479-35107663(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCGATAAGGT
SmilChr01G002439 Chr01 NC_080387.1:41977625-41977634promoter 内 394-403 bp - 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 41968455-41974027(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGGG
SmilChr02G001829 Chr02 NC_080388.1:33300810-33300819promoter 内 370-379 bp - 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33304441-33304544(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCCTTATCTC
SmilChr01G000562 Chr01 NC_080387.1:11670745-11670754promoter 内 349-358 bp + 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 11666755-11667102(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACCTTATCGA
SmilChr01G003130 Chr01 NC_080387.1:50135207-50135216promoter 内 344-353 bp - 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 50127737-50131559(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGGG
SmilChr02G002040 Chr02 NC_080388.1:36713360-36713369promoter 内 327-336 bp - 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 36717034-36718891(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACCTTATCGA
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SmilChr01G005829 Chr01 NC_080387.1:74301852-74301861promoter 内 243-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74294086-74298103(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGGA
SmilChr01G005994 Chr01 NC_080387.1:75533882-75533891promoter 内 241-250 bp + 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75537642-75537748(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGGA
SmilChr02G000717 Chr02 NC_080388.1:11535093-11535102promoter 内 208-217 bp - 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 11527730-11531309(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGGA
SmilChr01G004038 Chr01 NC_080387.1:58799336-58799345promoter 内 181-190 bp - 3811 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 58803156-58804120(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCCTTATCTC
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SmilChr02G002921 Chr02 NC_080388.1:49582437-49582446promoter 内 99-108 bp + 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 49586339-49591276(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGGG
SmilChr02G003255 Chr02 NC_080388.1:53845388-53845397promoter 内 88-97 bp + 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 53836245-53841484(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCCTTATCTC
SmilChr01G004841 Chr01 NC_080387.1:66546133-66546142promoter 内 76-85 bp - 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 66534842-66542217(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGGA
SmilChr01G000184 Chr01 NC_080387.1:3162817-3162826promoter 内 64-73 bp + 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3166754-3167811(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGGA
SmilChr01G001301 Chr01 NC_080387.1:25920756-25920765promoter 内 37-46 bp - 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 25924720-25928691(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCCTTATCTT
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SmilChr02G002652 Chr02 NC_080388.1:45977681-45977690promoter 内 1928-1937 bp + 2064 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 45972579-45975617(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GCGTTATCTG
SmilChr03G000677 Chr03 NC_080389.1:7554605-7554614promoter 内 1419-1428 bp - 2573 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 7557187-7558956(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GGCTTATCTG
SmilChr03G000676 Chr03 NC_080389.1:7549600-7549609promoter 内 3526-3535 bp + 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 7550075-7552020(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCGATAAGGA
SmilChr03G000675 Chr03 NC_080389.1:7549600-7549609promoter 内 3176-3185 bp + 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 7546223-7548784(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCCTTATCGG
SmilChr01G002165 Chr01 NC_080387.1:37736054-37736063promoter 内 2356-2365 bp - 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 37730155-37734418(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCGATAAGGG
SmilChr01G002611 Chr01 NC_080387.1:44356534-44356543promoter 内 2293-2302 bp + 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 44341189-44354835(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GCGTTATCTG
SmilChr01G005015 Chr01 NC_080387.1:68161817-68161826promoter 内 1919-1928 bp + 2073 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 68156428-68159744(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCCTTATCGA
SmilChr01G005203 Chr01 NC_080387.1:69708798-69708807promoter 内 1893-1902 bp + 2099 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 69710906-69711393(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCGATAAGGG
SmilChr01G006025 Chr01 NC_080387.1:75822898-75822907promoter 内 1705-1714 bp - 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 75825194-75830311(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCCTTATCGA
SmilChr02G002750 Chr02 NC_080388.1:47531656-47531665promoter 内 1647-1656 bp + 2345 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 47534010-47538392(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAACGC
SmilChr01G006199 Chr01 NC_080387.1:77682633-77682642promoter 内 1481-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 77685153-77690418(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCGATAAGGG
SmilChr01G005214 Chr01 NC_080387.1:69751199-69751208promoter 内 1273-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 69747923-69748480(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCCTTATCGA
SmilChr01G000031 Chr01 NC_080387.1:552158-552167promoter 内 968-977 bp + 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 547791-549134(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCCTTATCGG
SmilChr01G000049 Chr01 NC_080387.1:766474-766483promoter 内 726-735 bp - 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 769749-772394(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GGCTTATCTG
SmilChr01G000043 Chr01 NC_080387.1:703953-703962promoter 内 180-189 bp - 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 707774-710491(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GGCTTATCTG
SmilChr01G003512 Chr01 NC_080387.1:53737276-53737285promoter 内 3846-3855 bp - 146 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 53734992-53737130(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCGATAAGGG
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SmilChr03G000531 Chr03 NC_080389.1:5690961-5690970promoter 内 3692-3701 bp + 300 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 5691270-5693390(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCGATAAGGG
SmilChr02G004203 Chr02 NC_080388.1:64311545-64311554promoter 内 3689-3698 bp + 303 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 64311152-64311242(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GGCTTATCTG
SmilChr02G004202 Chr02 NC_080388.1:64311545-64311554promoter 内 3568-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 64311031-64311121(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GGCTTATCTG
SmilChr02G004201 Chr02 NC_080388.1:64311545-64311554promoter 内 3411-3420 bp + 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 64310854-64310964(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GGCTTATCTG
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SmilChr01G004502 Chr01 NC_080387.1:63129305-63129314promoter 内 3266-3275 bp + 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 63125172-63128579(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GGCTTATCTG