Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005433; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021978-RA_Salv SmilChr02G005433 WRKY XP_057792682.1 MP00209 CGTTGACTTTTTTTAACAT

可能结合的靶基因

9910 个结合位点 8083 个候选靶基因 第 65 / 162 下载 TSV

上一页 65 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002406 Chr01 NC_080387.1:41416939-41416957promoter 内 3736-3754 bp + 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 41413989-41416692(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GCTCAAACATAAGTCAACT
SmilChr02G000422 Chr02 NC_080388.1:5412292-5412310promoter 内 3699-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 5410858-5412008(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTGGTGGGTGGGTCAACG
SmilChr08G002065 Chr08 NC_080394.1:18532446-18532464promoter 内 3699-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 18532748-18537167(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTTATCTATCCT
SmilChr02G005439 Chr02 NC_080388.1:74785817-74785835promoter 内 3645-3663 bp - 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 74786173-74789076(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ACCCGTGCCACAGTCAACC
SmilChr04G003647 Chr04 NC_080390.1:52977760-52977778promoter 内 3631-3649 bp + 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52975421-52977408(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTAAGGTGATGGTCAACG
SmilChr07G002160 Chr07 NC_080393.1:19749858-19749876promoter 内 3620-3638 bp - 363 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 19750239-19760642(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATCAAGGTAGTGGTCAACG
SmilChr04G000100 Chr04 NC_080390.1:905332-905350promoter 内 3615-3633 bp - 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 905718-910298(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGGAAAAAAGCAGTCAACT
SmilChr04G003295 Chr04 NC_080390.1:49665340-49665358promoter 内 3603-3621 bp - 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 49665738-49666697(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTAAGGTGATGGTCAACG
SmilChr01G002878 Chr01 NC_080387.1:47380699-47380717promoter 内 3594-3612 bp + 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 47381106-47389482(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTGTAATGCCTC
SmilChr01G005998 Chr01 NC_080387.1:75566286-75566304promoter 内 3587-3605 bp + 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 75564120-75565890(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTACAAAAAAGTCAAAG
SmilChr01G005664 Chr01 NC_080387.1:72962290-72962308promoter 内 3564-3582 bp - 419 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 72962727-72962800(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATCACAAAAAAAGTCAAAG
SmilChr01G002605 Chr01 NC_080387.1:44245945-44245963promoter 内 3508-3526 bp - 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 44246438-44247302(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGATGTCGAAAGTCAACA
SmilChr06G001226 Chr06 NC_080392.1:12662617-12662635promoter 内 3484-3502 bp - 499 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 12663134-12665459(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATCAAGGTGGTAGTCAACG
SmilChr08G003513 Chr08 NC_080394.1:37680888-37680906promoter 内 3483-3501 bp + 500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 37681406-37686427(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTCGACCGACAC
SmilChr03G002530 Chr03 NC_080389.1:40368070-40368088promoter 内 3452-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40367090-40367539(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTAAAGTGCATGGTCAACG
SmilChr07G002718 Chr07 NC_080393.1:26640219-26640237promoter 内 3428-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 26640792-26648171(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTTTGAAAACAA
SmilChr08G000473 Chr08 NC_080394.1:3372973-3372991promoter 内 3238-3256 bp + 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3373736-3376232(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTCTCTCTACCTT
SmilChr02G004852 Chr02 NC_080388.1:70680464-70680482promoter 内 3233-3251 bp + 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70678035-70679714(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATCAAGGTGGTAGTCAACG
SmilChr07G004520 Chr07 NC_080393.1:57879177-57879195promoter 内 3224-3242 bp + 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 57878280-57878418(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGAAAGATCAAAGTCAACC
SmilChr08G002240 Chr08 NC_080394.1:20549277-20549295promoter 内 3208-3226 bp - 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 20550070-20551079(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTACTGAACACAGTCAACA
SmilChr05G004124 Chr05 NC_080391.1:55144440-55144458promoter 内 3186-3204 bp - 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55145255-55146455(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TCGTTTGACCTAGTCAACC
SmilChr01G003337 Chr01 NC_080387.1:52113461-52113479promoter 内 3175-3193 bp - 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52114287-52114425(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGAAAGATCAAAGTCAACC
SmilChr04G000681 Chr04 NC_080390.1:7904331-7904349promoter 内 3150-3168 bp + 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 7905182-7906160(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTATTTCTCCAC
SmilChr05G002699 Chr05 NC_080391.1:30967896-30967914promoter 内 3121-3139 bp + 862 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 30968776-30970811(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCACGTTTCTAAT
SmilChr01G001745 Chr01 NC_080387.1:32126956-32126974promoter 内 3113-3131 bp + 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 32127844-32128893(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTGAGTCTACAC
SmilChr02G002563 Chr02 NC_080388.1:44570413-44570431promoter 内 3080-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 44569404-44569510(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGAATATTCACAGTCAACT
SmilChr02G002565 Chr02 NC_080388.1:44625612-44625630promoter 内 3080-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 44624603-44624709(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGAATATTCACAGTCAACT
SmilChr01G005511 Chr01 NC_080387.1:71955486-71955504promoter 内 3071-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 71956416-71960046(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TATTTTGCCCAAGTCAACT
SmilChr02G005438 Chr02 NC_080388.1:74785817-74785835promoter 内 2976-2994 bp - 1007 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 74783142-74784810(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTGTGGCACGGGT
SmilChr02G002328 Chr02 NC_080388.1:40966235-40966253promoter 内 2975-2993 bp + 1008 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40967261-40967923(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTGCGGCGAACGA
SmilChr07G003090 Chr07 NC_080393.1:32635364-32635382promoter 内 2959-2977 bp - 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 32632226-32634340(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTTCTACCAAGT
SmilChr01G005665 Chr01 NC_080387.1:72962290-72962308promoter 内 2941-2959 bp - 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 72963350-72964618(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATCACAAAAAAAGTCAAAG
SmilChr02G004853 Chr02 NC_080388.1:70680464-70680482promoter 内 2939-2957 bp + 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70681526-70683890(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTACCACCTTGAT
SmilChr03G003231 Chr03 NC_080389.1:50069269-50069287promoter 内 2894-2912 bp + 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50070376-50072904(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTTTGCTTTTTG
SmilChr06G002573 Chr06 NC_080392.1:36938922-36938940promoter 内 2854-2872 bp - 1129 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 36935321-36937793(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTGTGGCATTGAT
SmilChr03G000461 Chr03 NC_080389.1:4921021-4921039promoter 内 2786-2804 bp + 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 4911930-4919824(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATGAAAATAAAAGTCAACT
SmilChr05G001344 Chr05 NC_080391.1:11872468-11872486promoter 内 2745-2763 bp + 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 11873724-11877614(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCATCACCTTAAG
SmilChr02G004043 Chr02 NC_080388.1:62739758-62739776promoter 内 2721-2739 bp + 1262 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 62741038-62747673(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCATAACTTTAAG
SmilChr04G002936 Chr04 NC_080390.1:45600173-45600191promoter 内 2653-2671 bp + 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 45597702-45598843(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CATAAGTCATAAGTCAACG
SmilChr07G004608 Chr07 NC_080393.1:58864187-58864205promoter 内 2641-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 58865547-58883498(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTTCACTAGCAT
SmilChr04G000624 Chr04 NC_080390.1:7088064-7088082promoter 内 2578-2596 bp + 1405 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 7089487-7092633(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTGTGTGTTACC
SmilChr05G002802 Chr05 NC_080391.1:32780350-32780368promoter 内 2549-2567 bp - 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 32781802-32785703(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TAACTCTTAAGAGTCAACG
SmilChr08G001539 Chr08 NC_080394.1:12547399-12547417promoter 内 2461-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 12544220-12545877(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTAAAGTTATGGTCAACG
SmilChr02G000633 Chr02 NC_080388.1:9534752-9534770promoter 内 2431-2449 bp + 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 9536322-9536798(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTGATGGTGACCA
SmilChr07G002037 Chr07 NC_080393.1:18475867-18475885promoter 内 2389-2407 bp - 1594 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 18473101-18474273(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCATCACCTTAAG
SmilChr02G001952 Chr02 NC_080388.1:35212731-35212749promoter 内 2316-2334 bp + 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 35214416-35229933(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTGTGATGACCAT
SmilChr01G005374 Chr01 NC_080387.1:70966339-70966357promoter 内 2312-2330 bp - 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70968028-70970769(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TATCTGGCCATAGTCAACT
SmilChr07G004009 Chr07 NC_080393.1:51126916-51126934promoter 内 2193-2211 bp - 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 51128724-51131222(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CACCTCTAGCCGGTCAACG
SmilChr02G000597 Chr02 NC_080388.1:8606414-8606432promoter 内 2186-2204 bp + 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 8608229-8609444(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTGAGGCCGATGG
SmilChr03G003178 Chr03 NC_080389.1:49238180-49238198promoter 内 2172-2190 bp - 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 49240009-49241631(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCTGATGTCTCAGTCAACG