转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 66 / 151 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000074 Chr04 NC_080390.1:688024-688036promoter 内 153-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 691872-693812(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGATGTAGGTAAA
SmilChr05G000275 Chr05 NC_080391.1:2124079-2124091promoter 内 141-153 bp - 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 2127939-2131408(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGTTAGGTAAT
SmilChr03G002147 Chr03 NC_080389.1:33410828-33410840promoter 内 99-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 33406591-33406938(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACTCT
SmilChr04G001633 Chr04 NC_080390.1:27097187-27097199promoter 内 87-99 bp - 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27088397-27093285(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTTTT
SmilChr02G003700 Chr02 NC_080388.1:58460678-58460690promoter 内 79-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 58464600-58468207(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTCCC
SmilChr01G001117 Chr01 NC_080387.1:22810604-22810616promoter 内 45-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 22804136-22806660(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCGGTAGGTGCA
SmilChr02G004612 Chr02 NC_080388.1:68655234-68655246promoter 内 24-36 bp - 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 68633935-68651269(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACATTT
SmilChr04G001567 Chr04 NC_080390.1:25985423-25985435promoter 内 3117-3129 bp + 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 25983405-25984551(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTATTAGGTAAG
SmilChr04G001568 Chr04 NC_080390.1:25985423-25985435promoter 内 361-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 25989063-25993539(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATAGA
SmilChr05G000684 Chr05 NC_080391.1:5193074-5193086promoter 内 3959-3971 bp + 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 5193116-5194090(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATAGA
SmilChr03G002535 Chr03 NC_080389.1:40424922-40424934promoter 内 3883-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 40425040-40425946(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGGTAGGTTAG
SmilChr01G001886 Chr01 NC_080387.1:33963603-33963615promoter 内 3646-3658 bp - 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 33959204-33963260(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATAGA
SmilChr02G004933 Chr02 NC_080388.1:71313635-71313647promoter 内 3592-3604 bp - 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 71314044-71314942(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCATTAGGTAAA
SmilChr03G004118 Chr03 NC_080389.1:60062929-60062941promoter 内 3538-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 60061823-60062478(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACATTA
SmilChr02G004278 Chr02 NC_080388.1:64975264-64975276promoter 内 3002-3014 bp + 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 64976263-64976652(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACTGCT
SmilChr03G002704 Chr03 NC_080389.1:42984731-42984743promoter 内 2914-2926 bp + 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 42985818-42986925(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTATT
SmilChr01G006015 Chr01 NC_080387.1:75740447-75740459promoter 内 2035-2047 bp - 1954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 75742413-75743410(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATGTAGGTAAG
SmilChr01G000208 Chr01 NC_080387.1:3625359-3625371promoter 内 1700-1712 bp + 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 3616537-3623070(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTATA
SmilChr05G001304 Chr05 NC_080391.1:11253792-11253804promoter 内 1667-1679 bp + 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 11256126-11257890(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATGCT
SmilChr03G002536 Chr03 NC_080389.1:40424922-40424934promoter 内 1182-1194 bp - 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 40427741-40428405(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGGTAGGTTAG
SmilChr01G004340 Chr01 NC_080387.1:61574612-61574624promoter 内 656-668 bp + 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 61577957-61579945(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCAAA
SmilChr03G002823 Chr03 NC_080389.1:44717903-44717915promoter 内 640-652 bp - 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 44713523-44714554(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTAAC
SmilChr02G004931 Chr02 NC_080388.1:71313635-71313647promoter 内 9-21 bp - 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 71307922-71309655(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATGAT
SmilChr04G002310 Chr04 NC_080390.1:37405698-37405710promoter 内 3908-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 37405791-37411721(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCACA
SmilChr02G002384 Chr02 NC_080388.1:41787374-41787386promoter 内 3900-3912 bp + 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 41787475-41788302(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAACT
SmilChr01G002855 Chr01 NC_080387.1:47132843-47132855promoter 内 3880-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 47129976-47132734(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATGTT
SmilChr03G003324 Chr03 NC_080389.1:51494980-51494992promoter 内 3818-3830 bp + 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 51492990-51494809(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCGGGTAGGTGCA
SmilChr03G003883 Chr03 NC_080389.1:57912780-57912792promoter 内 3777-3789 bp + 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57913004-57916679(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACAACT
SmilChr02G004001 Chr02 NC_080388.1:62347582-62347594promoter 内 3753-3765 bp + 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 62347830-62348439(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCAAA
SmilChr03G002942 Chr03 NC_080389.1:46132024-46132036promoter 内 3658-3670 bp - 331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 46132367-46137049(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTTAA
SmilChr01G004000 Chr01 NC_080387.1:58406598-58406610promoter 内 3394-3406 bp - 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 58404496-58406003(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACAACT
SmilChr05G000688 Chr05 NC_080391.1:5209476-5209488promoter 内 3376-3388 bp + 613 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5210101-5220252(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTACT
SmilChr04G003636 Chr04 NC_080390.1:52870719-52870731promoter 内 3243-3255 bp - 746 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52867739-52869973(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACATCA
SmilChr04G003637 Chr04 NC_080390.1:52870719-52870731promoter 内 3232-3244 bp - 757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52869877-52869962(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACATCA
SmilChr05G000810 Chr05 NC_080391.1:6322159-6322171promoter 内 3117-3129 bp - 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 6317022-6321287(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCACA
SmilChr02G005101 Chr02 NC_080388.1:72550918-72550930promoter 内 2853-2865 bp - 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 72552066-72559973(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTATG
SmilChr04G000781 Chr04 NC_080390.1:9581032-9581044promoter 内 2787-2799 bp + 1202 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 9582246-9584636(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAACT
SmilChr02G002333 Chr02 NC_080388.1:41027320-41027332promoter 内 2731-2743 bp - 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 41028590-41030905(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTAGA
SmilChr03G004274 Chr03 NC_080389.1:61194494-61194506promoter 内 2654-2666 bp - 1335 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 61195841-61198054(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTATA
SmilChr01G005546 Chr01 NC_080387.1:72270483-72270495promoter 内 2563-2575 bp - 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 72265015-72269057(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACAGTC
SmilChr04G002684 Chr04 NC_080390.1:42289715-42289727promoter 内 2436-2448 bp + 1553 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 42285729-42288162(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACTGTAGGTAAG
SmilChr02G005224 Chr02 NC_080388.1:73452387-73452399promoter 内 2358-2370 bp + 1631 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73454030-73459418(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACAGCC
SmilChr04G003723 Chr04 NC_080390.1:53569808-53569820promoter 内 2259-2271 bp - 1730 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53571550-53574743(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAGGTAGGTGCC
SmilChr05G001987 Chr05 NC_080391.1:20565862-20565874promoter 内 2065-2077 bp + 1924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 20560208-20563938(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACATTAGGTAAC
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SmilChr03G004736 Chr03 NC_080389.1:64496996-64497008promoter 内 1812-1824 bp + 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 64490771-64494819(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACGGGTAGGTACA
SmilChr01G002856 Chr01 NC_080387.1:47132843-47132855promoter 内 1787-1799 bp - 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 47135057-47139130(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACATTAGGTAAC
SmilChr02G001779 Chr02 NC_080388.1:32573081-32573093promoter 内 1754-1766 bp - 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 32575328-32579569(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTAAT