转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 67 / 151 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004319 Chr02 NC_080388.1:65505599-65505611promoter 内 1596-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 65508004-65510566(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACTGCT
SmilChr04G003783 Chr04 NC_080390.1:53995999-53996011promoter 内 1575-1587 bp + 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53998425-53999929(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTAAC
SmilChr04G003639 Chr04 NC_080390.1:52870719-52870731promoter 内 1525-1537 bp - 2464 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52873195-52875363(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGATGTAGGTAGG
SmilChr03G003384 Chr03 NC_080389.1:52200838-52200850promoter 内 1422-1434 bp - 2567 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52203417-52204811(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCGTTAGGTAAA
SmilChr02G004216 Chr02 NC_080388.1:64398242-64398254promoter 内 1324-1336 bp - 2665 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 64391702-64395577(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATGTG
SmilChr02G004316 Chr02 NC_080388.1:65496784-65496796promoter 内 1155-1167 bp + 2834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 65484708-65493950(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTAGT
SmilChr04G004048 Chr04 NC_080390.1:55691717-55691729promoter 内 1082-1094 bp + 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 55685043-55688810(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTTAA
SmilChr03G004738 Chr03 NC_080389.1:64496996-64497008promoter 内 1015-1027 bp + 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 64499982-64503334(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACCCGT
SmilChr02G005099 Chr02 NC_080388.1:72550918-72550930promoter 内 990-1002 bp - 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 72543497-72547919(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCAAC
SmilChr01G001211 Chr01 NC_080387.1:24340287-24340299promoter 内 973-985 bp - 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 24343315-24345554(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTTGA
SmilChr03G003860 Chr03 NC_080389.1:57690377-57690389promoter 内 884-896 bp + 3105 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57682363-57687272(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTAAT
SmilChr02G004317 Chr02 NC_080388.1:65496784-65496796promoter 内 856-868 bp + 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 65499929-65502746(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCAAA
SmilChr02G005294 Chr02 NC_080388.1:73927321-73927333promoter 内 837-849 bp - 3152 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73922742-73924169(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACATTA
SmilChr03G003383 Chr03 NC_080389.1:52200838-52200850promoter 内 766-778 bp - 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52191407-52197615(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACGGA
SmilChr01G001839 Chr01 NC_080387.1:33320189-33320201promoter 内 718-730 bp + 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 33323472-33324897(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCACA
SmilChr04G003635 Chr04 NC_080390.1:52870719-52870731promoter 内 528-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52865203-52867258(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACATCA
SmilChr04G000544 Chr04 NC_080390.1:6062528-6062540promoter 内 393-405 bp + 3596 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 6057076-6058932(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAGGTAGGTGCA
SmilChr01G004001 Chr01 NC_080387.1:58406598-58406610promoter 内 325-337 bp - 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 58410274-58410891(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTTGTAGGTAGA
SmilChr01G004539 Chr01 NC_080387.1:63534272-63534284promoter 内 272-284 bp - 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63538001-63539758(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCAGTAGGTAGC
SmilChr05G001383 Chr05 NC_080391.1:12360626-12360638promoter 内 217-229 bp - 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 12364410-12366462(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATAGTAGGTAGT
SmilChr01G001989 Chr01 NC_080387.1:35320143-35320155promoter 内 2134-2146 bp - 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 35312795-35318288(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCGCA
SmilChr01G001991 Chr01 NC_080387.1:35320143-35320155promoter 内 3985-3997 bp - 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 35320159-35325141(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTAAT
SmilChr01G006052 Chr01 NC_080387.1:76014144-76014156promoter 内 3795-3807 bp + 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 76012807-76013950(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAGGTAGGTTAA
SmilChr05G001074 Chr05 NC_080391.1:8916041-8916053promoter 内 3767-3779 bp + 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 8910495-8915819(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGTA
SmilChr02G003883 Chr02 NC_080388.1:60891979-60891991promoter 内 3143-3155 bp + 846 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 60886579-60891133(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGATTAGGTAAC
SmilChr05G000473 Chr05 NC_080391.1:3595379-3595391promoter 内 2999-3011 bp - 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 3596381-3596928(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAAGTAGGTAGC
SmilChr04G002659 Chr04 NC_080390.1:41981788-41981800promoter 内 2894-2906 bp + 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 41982895-41984061(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTATA
SmilChr01G003589 Chr01 NC_080387.1:54433153-54433165promoter 内 2811-2823 bp + 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 54434343-54437470(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTTCA
SmilChr01G006023 Chr01 NC_080387.1:75813213-75813225promoter 内 2615-2627 bp - 1374 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 75809484-75811839(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCTGT
SmilChr01G002117 Chr01 NC_080387.1:37194803-37194815promoter 内 2449-2461 bp - 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 37189801-37193263(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCTAT
SmilChr01G003922 Chr01 NC_080387.1:57477189-57477201promoter 内 2350-2362 bp + 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 57478840-57479592(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCACT
SmilChr03G000141 Chr03 NC_080389.1:1548095-1548107promoter 内 1802-1814 bp - 2187 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 1537730-1545908(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCATT
SmilChr02G000282 Chr02 NC_080388.1:3620805-3620817promoter 内 411-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 3615066-3617227(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATTGTAGGTAGG
SmilChr02G002311 Chr02 NC_080388.1:40733981-40733993promoter 内 3950-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40731374-40733942(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACCCAG
SmilChr02G002652 Chr02 NC_080388.1:45976225-45976237promoter 内 3381-3393 bp - 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 45972579-45975617(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAACA
SmilChr04G002658 Chr04 NC_080390.1:41981788-41981800promoter 内 3338-3350 bp + 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 41974289-41981137(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTACA
SmilChr01G003943 Chr01 NC_080387.1:57765307-57765319promoter 内 3189-3201 bp + 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57763782-57764507(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCGGTTAGGTAAC
SmilChr02G003904 Chr02 NC_080388.1:61121711-61121723promoter 内 2817-2829 bp + 1172 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 61115982-61120539(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTACA
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SmilChr03G001034 Chr03 NC_080389.1:12046983-12046995promoter 内 2647-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 12040241-12045641(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCATTAGGTAAG
SmilChr05G000536 Chr05 NC_080391.1:4113672-4113684promoter 内 2590-2602 bp - 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4109259-4112273(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCTGT
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SmilChr02G005139 Chr02 NC_080388.1:72823741-72823753promoter 内 1804-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 72817174-72821556(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCATA
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SmilChr04G002617 Chr04 NC_080390.1:41581074-41581086promoter 内 1685-1697 bp + 2304 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 41583390-41583962(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTATA
SmilChr02G003906 Chr02 NC_080388.1:61121711-61121723promoter 内 1410-1422 bp + 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 61124302-61124374(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTTTA
SmilChr02G005073 Chr02 NC_080388.1:72386590-72386602promoter 内 1402-1414 bp - 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 72382260-72384003(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTATA
SmilChr02G003579 Chr02 NC_080388.1:56959597-56959609promoter 内 1385-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 56962213-56966574(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTTGC