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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 68 / 141 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002683 Chr02 NC_080388.1:46482213-46482227promoter 内 1095-1109 bp + 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 46474207-46479321(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCCACCGCCGCCG
SmilChr01G004591 Chr01 NC_080387.1:63921057-63921071promoter 内 1038-1052 bp - 2949 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 63914506-63918108(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTGTCGGTGATAT
SmilChr02G005058 Chr02 NC_080388.1:72283142-72283156promoter 内 985-999 bp - 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 72286158-72286228(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGACACCGACAGAG
SmilChr02G004806 Chr02 NC_080388.1:70233736-70233750promoter 内 944-958 bp + 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 70225492-70230693(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGCCAACA
SmilChr04G002392 Chr04 NC_080390.1:38433670-38433684promoter 内 929-943 bp + 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 38427790-38430612(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TAACCACCGACATGT
SmilChr08G002258 Chr08 NC_080394.1:20834212-20834226promoter 内 882-896 bp + 3105 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 20837331-20842176(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAAG
SmilChr02G004777 Chr02 NC_080388.1:69948953-69948967promoter 内 823-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 69943037-69945789(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTGTCGGTGCTTC
SmilChr01G001427 Chr01 NC_080387.1:27915269-27915283promoter 内 814-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 27918456-27919332(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AACCCACCGACTCCG
SmilChr03G004487 Chr03 NC_080389.1:62986767-62986781promoter 内 790-804 bp - 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 62980534-62983570(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGTGTCGGTAGAAC
SmilChr02G001375 Chr02 NC_080388.1:25993255-25993269promoter 内 789-803 bp - 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 25996467-25999489(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCAGCACCGACGTTG
SmilChr03G003414 Chr03 NC_080389.1:52473226-52473240promoter 内 771-785 bp + 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 52476456-52478143(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGAGTCGGTGGGCG
SmilChr02G000060 Chr02 NC_080388.1:776862-776876promoter 内 769-783 bp - 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 772169-773644(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATTCGTCGGTGCGGA
SmilChr08G000772 Chr08 NC_080394.1:5691275-5691289promoter 内 712-726 bp + 3275 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5686469-5688000(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCAACCGACACCT
SmilChr03G004288 Chr03 NC_080389.1:61288222-61288236promoter 内 651-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 61282888-61284886(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCACTACCGACAATT
SmilChr08G002968 Chr08 NC_080394.1:29714561-29714575promoter 内 624-638 bp - 3363 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 29708349-29711198(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAAG
SmilChr07G002329 Chr07 NC_080393.1:21593621-21593635promoter 内 593-607 bp + 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 21597029-21597228(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTGTCGGTGAGAA
SmilChr04G000416 Chr04 NC_080390.1:4368904-4368918promoter 内 570-584 bp + 3417 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4364108-4365487(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCCTCACCGACATTC
SmilChr01G000086 Chr01 NC_080387.1:1597306-1597320promoter 内 480-494 bp + 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 1600827-1602069(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGTCGGTACAGG
SmilChr07G001013 Chr07 NC_080393.1:7370753-7370767promoter 内 477-491 bp - 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 7366029-7367243(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATTTGTCGGTGCTAT
SmilChr04G004108 Chr04 NC_080390.1:56035197-56035211promoter 内 461-475 bp - 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 56029042-56031671(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGTCGGTCGAGA
SmilChr05G000072 Chr05 NC_080391.1:367064-367078promoter 内 437-451 bp + 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 362702-363514(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCTCACCGACGCGC
SmilChr07G003096 Chr07 NC_080393.1:32741634-32741648promoter 内 404-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 32734275-32738051(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCACCACCGACTACT
SmilChr05G003725 Chr05 NC_080391.1:50344343-50344357promoter 内 369-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 50347975-50352669(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCATCACCGACTCCA
SmilChr07G004651 Chr07 NC_080393.1:59339829-59339843promoter 内 337-351 bp - 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 59326854-59336179(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATTGTCGGTAGTGA
SmilChr07G000441 Chr07 NC_080393.1:3089888-3089902promoter 内 335-349 bp + 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3083628-3086236(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTGCCACCGACTACC
SmilChr01G001426 Chr01 NC_080387.1:27905796-27905810promoter 内 334-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 27899043-27902143(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGAGTCGGTGGGTT
SmilChr08G004373 Chr08 NC_080394.1:53511826-53511840promoter 内 326-340 bp + 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 53504049-53508165(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGATCACCGACGACG
SmilChr01G005627 Chr01 NC_080387.1:72730253-72730267promoter 内 277-291 bp - 3710 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 72733977-72737706(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCAGTACCGACAATG
SmilChr01G002761 Chr01 NC_080387.1:46016726-46016740promoter 内 249-263 bp + 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 46007200-46012988(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGATCACCGACGCCA
SmilChr02G005059 Chr02 NC_080388.1:72283142-72283156promoter 内 240-254 bp - 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 72286903-72289223(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGACACCGACAGAG
SmilChr05G003953 Chr05 NC_080391.1:53246686-53246700promoter 内 226-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 53250461-53251153(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGTCGGTGTGTG
SmilChr07G001016 Chr07 NC_080393.1:7370753-7370767promoter 内 178-192 bp - 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 7374576-7376996(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATAGCACCGACAAAT
SmilChr01G004930 Chr01 NC_080387.1:67370419-67370433promoter 内 162-176 bp + 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 67365644-67366594(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CACACACCGACACAA
SmilChr03G000111 Chr03 NC_080389.1:1225120-1225134promoter 内 101-115 bp + 3886 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 1229020-1261784(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGCAGTCGGTGAAGG
SmilChr02G001717 Chr02 NC_080388.1:31630847-31630861promoter 内 46-60 bp - 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 31626175-31626906(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCTTGTCGGTAGTGG
SmilChr01G001281 Chr01 NC_080387.1:25592805-25592819promoter 内 25-39 bp + 3962 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 25596781-25598648(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAATGTCGGTCGTGG
SmilChr07G001327 Chr07 NC_080393.1:10208584-10208598promoter 内 3637-3651 bp + 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 10206510-10208234(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCCACCGCCATCG
SmilChr05G003461 Chr05 NC_080391.1:46023345-46023359promoter 内 1027-1041 bp - 2960 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 46019082-46020385(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGGTGACGGTGGAGA
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SmilChr07G004312 Chr07 NC_080393.1:55688293-55688307promoter 内 3600-3614 bp + 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 55686193-55687906(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCAAGT
SmilChr05G003951 Chr05 NC_080391.1:53244691-53244705promoter 内 3003-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 53245689-53247721(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCTC
SmilChr08G000660 Chr08 NC_080394.1:4901350-4901364promoter 内 2996-3010 bp + 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 4894143-4900359(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TAGTCACCGACAGGA
SmilChr01G000383 Chr01 NC_080387.1:7872841-7872855promoter 内 2908-2922 bp - 1079 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 7873934-7877658(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAACCACCGACTCCC
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