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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 70 / 136 下载 TSV

上一页 70 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000781 Chr02 NC_080388.1:12837497-12837507promoter 内 3423-3433 bp + 568 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 12835022-12836929(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCC
SmilChr04G000696 Chr04 NC_080390.1:8128943-8128953promoter 内 3356-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 8129588-8135392(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCA
SmilChr02G005597 Chr02 NC_080388.1:75705843-75705853promoter 内 3355-3365 bp + 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 75706489-75708908(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCC
SmilChr04G002753 Chr04 NC_080390.1:43240079-43240089promoter 内 3319-3329 bp + 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 43228900-43239407(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCTGAGCC
SmilChr01G001514 Chr01 NC_080387.1:28982064-28982074promoter 内 3308-3318 bp + 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 28982757-28985710(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGG
SmilChr02G003413 Chr02 NC_080388.1:55305619-55305629promoter 内 3279-3289 bp + 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 55292135-55304907(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCTGAGCC
SmilChr05G002784 Chr05 NC_080391.1:32545978-32545988promoter 内 3279-3289 bp - 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 32546700-32546806(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCA
SmilChr08G001561 Chr08 NC_080394.1:12859475-12859485promoter 内 3266-3276 bp - 725 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 12858678-12858750(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCC
SmilChr08G003910 Chr08 NC_080394.1:46505238-46505248promoter 内 3253-3263 bp + 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 46505986-46507179(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr01G004761 Chr01 NC_080387.1:65792820-65792830promoter 内 3248-3258 bp - 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 65793573-65796299(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCC
SmilChr04G002463 Chr04 NC_080390.1:39456273-39456283promoter 内 3239-3249 bp + 752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 39447909-39455521(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCCCTGAGCC
SmilChr05G001417 Chr05 NC_080391.1:12804685-12804695promoter 内 3200-3210 bp + 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 12801274-12803894(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCA
SmilChr07G001319 Chr07 NC_080393.1:10134461-10134471promoter 内 3177-3187 bp - 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 10132188-10133647(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCC
SmilChr02G000999 Chr02 NC_080388.1:17624460-17624470promoter 内 3173-3183 bp - 818 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 17625288-17627802(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGC
SmilChr03G004199 Chr03 NC_080389.1:60631560-60631570promoter 内 3169-3179 bp + 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60627061-60630738(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCA
SmilChr01G000929 Chr01 NC_080387.1:19674564-19674574promoter 内 3165-3175 bp - 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19672530-19673738(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr01G000266 Chr01 NC_080387.1:5131496-5131506promoter 内 3094-3104 bp - 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5132403-5133228(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGC
SmilChr01G000267 Chr01 NC_080387.1:5142082-5142092promoter 内 3094-3104 bp - 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5142989-5143845(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGC
SmilChr08G003348 Chr08 NC_080394.1:34867629-34867639promoter 内 3075-3085 bp + 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 34868555-34869785(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGA
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SmilChr07G004210 Chr07 NC_080393.1:54308616-54308626promoter 内 3058-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 54301159-54307683(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr01G001744 Chr01 NC_080387.1:32128698-32128708promoter 内 3053-3063 bp + 938 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 32127392-32127760(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCC
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SmilChr03G001849 Chr03 NC_080389.1:25414813-25414823promoter 内 3016-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 25415798-25416769(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr08G002109 Chr08 NC_080394.1:18948112-18948122promoter 内 3007-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 18942112-18947128(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGG
SmilChr05G001720 Chr05 NC_080391.1:16473835-16473845promoter 内 2981-2991 bp - 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 16474855-16475799(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCTGAGCC
SmilChr08G001623 Chr08 NC_080394.1:13433284-13433294promoter 内 2965-2975 bp + 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 13434320-13437455(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGG
SmilChr04G002501 Chr04 NC_080390.1:39961798-39961808promoter 内 2886-2896 bp - 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 39962913-39966362(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCTGAGCC
SmilChr05G003305 Chr05 NC_080391.1:43322658-43322668promoter 内 2867-2877 bp + 1124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 43319960-43321534(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCC
SmilChr07G003689 Chr07 NC_080393.1:44423024-44423034promoter 内 2854-2864 bp - 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 44420679-44421887(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr01G005328 Chr01 NC_080387.1:70490166-70490176promoter 内 2846-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 70487781-70489021(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCC
SmilChr02G002909 Chr02 NC_080388.1:49397757-49397767promoter 内 2836-2846 bp - 1155 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 49394295-49396602(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr01G001181 Chr01 NC_080387.1:23861548-23861558promoter 内 2802-2812 bp - 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 23859430-23860359(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr06G002039 Chr06 NC_080392.1:26634795-26634805promoter 内 2799-2809 bp + 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 26635997-26637100(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGC
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SmilChr01G005008 Chr01 NC_080387.1:68118459-68118469promoter 内 2787-2797 bp - 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 68114845-68117255(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCC
SmilChr01G001609 Chr01 NC_080387.1:30254340-30254350promoter 内 2771-2781 bp - 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30250820-30253120(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGA
SmilChr04G003433 Chr04 NC_080390.1:50902292-50902302promoter 内 2770-2780 bp - 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50897636-50901071(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
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SmilChr01G003218 Chr01 NC_080387.1:50953430-50953440promoter 内 2623-2633 bp + 1368 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50954808-50957390(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGA
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SmilChr07G000688 Chr07 NC_080393.1:4703813-4703823promoter 内 2401-2411 bp + 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4705413-4708745(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCC
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SmilChr07G001963 Chr07 NC_080393.1:17153582-17153592promoter 内 2250-2260 bp - 1741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 17155333-17158036(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCTGAGCC
SmilChr01G004922 Chr01 NC_080387.1:67302150-67302160promoter 内 2249-2259 bp + 1742 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 67303902-67303973(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGG
SmilChr01G002728 Chr01 NC_080387.1:45630952-45630962promoter 内 2232-2242 bp + 1759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 45632721-45634169(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr02G001269 Chr02 NC_080388.1:23249200-23249210promoter 内 2170-2180 bp - 1821 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 23246512-23247379(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGC