转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 72 / 149 下载 TSV

上一页 72 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001983 Chr02 NC_080388.1:35780184-35780194promoter 内 2772-2782 bp + 1219 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 35777989-35778965(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr04G000651 Chr04 NC_080390.1:7359151-7359161promoter 内 2769-2779 bp + 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 7360383-7361896(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr06G003131 Chr06 NC_080392.1:44195518-44195528promoter 内 2742-2752 bp - 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 44194167-44194269(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr05G001008 Chr05 NC_080391.1:8285010-8285020promoter 内 2677-2687 bp - 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 8280302-8283696(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr05G002617 Chr05 NC_080391.1:29430364-29430374promoter 内 2654-2664 bp - 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 29431711-29434335(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr06G000368 Chr06 NC_080392.1:2850587-2850597promoter 内 2654-2664 bp - 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 2846631-2849250(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr02G001269 Chr02 NC_080388.1:23248757-23248767promoter 内 2613-2623 bp + 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 23246512-23247379(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr02G002074 Chr02 NC_080388.1:37328107-37328117promoter 内 2610-2620 bp - 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 37329498-37330279(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr03G003027 Chr03 NC_080389.1:47194766-47194776promoter 内 2503-2513 bp + 1488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 47196264-47197202(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCT
SmilChr03G002528 Chr03 NC_080389.1:40316584-40316594promoter 内 2468-2478 bp - 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 40314598-40315061(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr07G002691 Chr07 NC_080393.1:26256035-26256045promoter 内 2459-2469 bp - 1532 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 26257577-26259206(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTC
SmilChr06G001180 Chr06 NC_080392.1:12000084-12000094promoter 内 2392-2402 bp + 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 12001693-12005542(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTGGGCTGTCA
SmilChr06G000563 Chr06 NC_080392.1:4799317-4799327promoter 内 2319-2329 bp + 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 4800999-4802517(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCT
SmilChr06G000564 Chr06 NC_080392.1:4799317-4799327promoter 内 2307-2317 bp + 1684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 4801011-4801113(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCT
SmilChr02G005573 Chr02 NC_080388.1:75609584-75609594promoter 内 2286-2296 bp + 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 75605921-75607879(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr05G000439 Chr05 NC_080391.1:3318356-3318366promoter 内 2279-2289 bp + 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 3320078-3323383(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr01G003781 Chr01 NC_080387.1:56198677-56198687promoter 内 2250-2260 bp + 1741 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 56195870-56196936(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGT
SmilChr05G002717 Chr05 NC_080391.1:31286564-31286574promoter 内 2233-2243 bp + 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 31288332-31295348(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr05G003878 Chr05 NC_080391.1:52365023-52365033promoter 内 2209-2219 bp + 1782 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 52366815-52368698(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr02G000486 Chr02 NC_080388.1:6628157-6628167promoter 内 2190-2200 bp - 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 6629968-6632943(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr01G003876 Chr01 NC_080387.1:57027149-57027159promoter 内 2136-2146 bp - 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 57029014-57033755(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr02G000764 Chr02 NC_080388.1:12448108-12448118promoter 内 2052-2062 bp - 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 12444913-12446169(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr03G003888 Chr03 NC_080389.1:57957737-57957747promoter 内 2029-2039 bp - 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 57959709-57961036(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
SmilChr07G002071 Chr07 NC_080393.1:18852443-18852453promoter 内 2002-2012 bp - 1989 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 18843047-18850454(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr02G001964 Chr02 NC_080388.1:35451684-35451694promoter 内 1991-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 35453694-35454591(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCT
SmilChr05G004202 Chr05 NC_080391.1:55896905-55896915promoter 内 1969-1979 bp - 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 55898937-55902971(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
SmilChr05G004335 Chr05 NC_080391.1:57032573-57032583promoter 内 1967-1977 bp + 2024 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 57028778-57030549(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
SmilChr02G001063 Chr02 NC_080388.1:18934576-18934586promoter 内 1963-1973 bp - 2028 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 18936614-18940083(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr02G005393 Chr02 NC_080388.1:74533317-74533327promoter 内 1931-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 74535387-74537827(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCT
SmilChr07G001607 Chr07 NC_080393.1:13421935-13421945promoter 内 1905-1915 bp + 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 13424031-13426510(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr07G002687 Chr07 NC_080393.1:26256035-26256045promoter 内 1900-1910 bp - 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 26252601-26253944(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCG
SmilChr02G000628 Chr02 NC_080388.1:9453260-9453270promoter 内 1868-1878 bp + 2123 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 9455393-9456815(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCG
SmilChr04G002901 Chr04 NC_080390.1:45273782-45273792promoter 内 1865-1875 bp + 2126 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 45275918-45278874(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr07G001799 Chr07 NC_080393.1:15366790-15366800promoter 内 1839-1849 bp + 2152 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 15362443-15364638(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr01G000073 Chr01 NC_080387.1:1267190-1267200promoter 内 1804-1814 bp - 2187 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1269387-1271849(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTG
SmilChr05G000437 Chr05 NC_080391.1:3318356-3318366promoter 内 1707-1717 bp + 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 3311009-3316072(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr02G004855 Chr02 NC_080388.1:70708558-70708568promoter 内 1675-1685 bp - 2316 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 70702516-70706242(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr03G000441 Chr03 NC_080389.1:4746078-4746088promoter 内 1574-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 4741905-4743661(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr03G002364 Chr03 NC_080389.1:37278174-37278184promoter 内 1571-1581 bp - 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 37274302-37275754(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr02G005370 Chr02 NC_080388.1:74400635-74400645promoter 内 1562-1572 bp - 2429 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 74374767-74398206(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr05G001105 Chr05 NC_080391.1:9180833-9180843promoter 内 1518-1528 bp + 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 9177029-9178360(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
SmilChr03G001925 Chr03 NC_080389.1:27016065-27016075promoter 内 1494-1504 bp - 2497 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 27006361-27013568(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr03G003957 Chr03 NC_080389.1:58604338-58604348promoter 内 1489-1499 bp - 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 58606850-58609894(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr03G000264 Chr03 NC_080389.1:3054401-3054411promoter 内 1486-1496 bp - 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 3056916-3064283(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr03G003039 Chr03 NC_080389.1:47282480-47282490promoter 内 1449-1459 bp + 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 47285032-47289471(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr02G002921 Chr02 NC_080388.1:49583765-49583775promoter 内 1427-1437 bp - 2564 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 49586339-49591276(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr04G002542 Chr04 NC_080390.1:40720533-40720543promoter 内 1413-1423 bp + 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 40717831-40717955(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr04G003207 Chr04 NC_080390.1:48933326-48933336promoter 内 1369-1379 bp + 2622 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 48927984-48930704(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr02G004056 Chr02 NC_080388.1:62875234-62875244promoter 内 1355-1365 bp - 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 62877880-62878834(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr03G002892 Chr03 NC_080389.1:45613458-45613468promoter 内 1334-1344 bp - 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 45607948-45610801(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA