转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 73 / 136 下载 TSV

上一页 73 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002989 Chr05 NC_080391.1:36612862-36612872promoter 内 1821-1831 bp + 2170 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 36610134-36610692(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCA
SmilChr01G003145 Chr01 NC_080387.1:50275074-50275084promoter 内 1589-1599 bp - 2402 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 50277486-50280176(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr08G000253 Chr08 NC_080394.1:1767217-1767227promoter 内 1129-1139 bp + 2862 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 1760672-1764355(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCA
SmilChr03G003454 Chr03 NC_080389.1:52902239-52902249promoter 内 1112-1122 bp - 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 52905128-52906180(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAACA
SmilChr05G004280 Chr05 NC_080391.1:56598015-56598025promoter 内 1104-1114 bp - 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 56600912-56605655(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr08G000255 Chr08 NC_080394.1:1767217-1767227promoter 内 1021-1031 bp + 2970 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 1770197-1770816(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTT
SmilChr06G001144 Chr06 NC_080392.1:11533118-11533128promoter 内 865-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 11536254-11547518(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCC
SmilChr06G000788 Chr06 NC_080392.1:7406946-7406956promoter 内 664-674 bp - 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 7395084-7403619(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr05G001993 Chr05 NC_080391.1:20642047-20642057promoter 内 454-464 bp - 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 20645594-20645700(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr04G003621 Chr04 NC_080390.1:52695216-52695226promoter 内 263-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 52698954-52699788(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACG
SmilChr08G002382 Chr08 NC_080394.1:22593735-22593745promoter 内 255-265 bp + 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 22597481-22597551(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr05G001019 Chr05 NC_080391.1:8362666-8362676promoter 内 124-134 bp + 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 8356817-8358799(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCA
SmilChr06G001727 Chr06 NC_080392.1:19912441-19912451promoter 内 3980-3990 bp - 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 19912462-19913166(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr04G003837 Chr04 NC_080390.1:54405842-54405852promoter 内 3938-3948 bp + 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 54404811-54405789(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr01G001121 Chr01 NC_080387.1:22832430-22832440promoter 内 3885-3895 bp + 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22831740-22832324(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr08G001359 Chr08 NC_080394.1:10876947-10876957promoter 内 3871-3881 bp - 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10877077-10878488(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCA
SmilChr02G003158 Chr02 NC_080388.1:52617983-52617993promoter 内 3853-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 52616406-52617845(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGTCAGCGCT
SmilChr06G002648 Chr06 NC_080392.1:38264070-38264080promoter 内 3851-3861 bp - 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 38264220-38266544(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTA
SmilChr06G003084 Chr06 NC_080392.1:43711680-43711690promoter 内 3812-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43711869-43720328(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACG
SmilChr08G001429 Chr08 NC_080394.1:11449652-11449662promoter 内 3793-3803 bp - 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 11444817-11449454(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACG
SmilChr01G002940 Chr01 NC_080387.1:48181525-48181535promoter 内 3774-3784 bp - 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 48181752-48185923(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTA
SmilChr01G002521 Chr01 NC_080387.1:43184338-43184348promoter 内 3747-3757 bp - 244 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43184592-43186017(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCG
SmilChr05G002849 Chr05 NC_080391.1:33978842-33978852promoter 内 3726-3736 bp + 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 33979117-33981217(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr06G002165 Chr06 NC_080392.1:29788141-29788151promoter 内 3679-3689 bp + 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 29788463-29789267(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCACAGCGCG
SmilChr07G002992 Chr07 NC_080393.1:30543402-30543412promoter 内 3665-3675 bp + 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 30541871-30543076(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAACA
SmilChr01G000374 Chr01 NC_080387.1:7710235-7710245promoter 内 3626-3636 bp + 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 7710610-7713571(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr05G000950 Chr05 NC_080391.1:7676267-7676277promoter 内 3597-3607 bp - 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 7676671-7677216(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr03G003153 Chr03 NC_080389.1:48898327-48898337promoter 内 3581-3591 bp + 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 48898747-48899844(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCC
SmilChr01G004253 Chr01 NC_080387.1:60823322-60823332promoter 内 3554-3564 bp - 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 60823769-60824749(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCA
SmilChr06G000608 Chr06 NC_080392.1:5252395-5252405promoter 内 3528-3538 bp + 463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5246819-5251932(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCA
SmilChr03G003151 Chr03 NC_080389.1:48868362-48868372promoter 内 3429-3439 bp - 562 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 48866855-48867800(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCC
SmilChr04G003346 Chr04 NC_080390.1:50105740-50105750promoter 内 3407-3417 bp + 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 50104510-50105156(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCA
SmilChr08G001806 Chr08 NC_080394.1:15249084-15249094promoter 内 3368-3378 bp + 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 15249717-15253031(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGTCAGCGCG
SmilChr07G000009 Chr07 NC_080393.1:40015-40025promoter 内 3324-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 32209-39348(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTT
SmilChr05G001558 Chr05 NC_080391.1:14287237-14287247promoter 内 3323-3333 bp - 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14287915-14288623(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCA
SmilChr02G004062 Chr02 NC_080388.1:62915555-62915565promoter 内 3308-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 62911482-62914872(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr05G000768 Chr05 NC_080391.1:5985375-5985385promoter 内 3222-3232 bp - 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5978121-5984606(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr01G005347 Chr01 NC_080387.1:70720797-70720807promoter 内 3095-3105 bp + 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 70715872-70719901(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCA
SmilChr07G001688 Chr07 NC_080393.1:14297030-14297040promoter 内 3079-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14297952-14298932(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCG
SmilChr02G002030 Chr02 NC_080388.1:36531087-36531097promoter 内 3033-3043 bp + 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 36528752-36530129(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCA
SmilChr08G004933 Chr08 NC_080394.1:58247459-58247469promoter 内 2987-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 58248473-58250161(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr05G000363 Chr05 NC_080391.1:2705733-2705743promoter 内 2951-2961 bp - 1040 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2702864-2704693(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTTCAGCGCG
SmilChr03G004542 Chr03 NC_080389.1:63428766-63428776promoter 内 2947-2957 bp - 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 63429820-63431178(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr03G002817 Chr03 NC_080389.1:44653853-44653863promoter 内 2823-2833 bp - 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 44650403-44652685(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACG
SmilChr01G000580 Chr01 NC_080387.1:12149074-12149084promoter 内 2775-2785 bp + 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 12150300-12153417(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCT
SmilChr07G000010 Chr07 NC_080393.1:40015-40025promoter 内 2769-2779 bp - 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 41247-46652(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCA
SmilChr05G004310 Chr05 NC_080391.1:56788643-56788653promoter 内 2717-2727 bp + 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 56789927-56791321(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr03G004541 Chr03 NC_080389.1:63428766-63428776promoter 内 2708-2718 bp - 1283 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 63423894-63427483(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCC
SmilChr03G000125 Chr03 NC_080389.1:1376781-1376791promoter 内 2682-2692 bp - 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 1374491-1375472(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr08G000783 Chr08 NC_080394.1:5762600-5762610promoter 内 2639-2649 bp + 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5763962-5765108(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTT