转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 73 / 151 下载 TSV

上一页 73 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003582 Chr03 NC_080389.1:54455823-54455835promoter 内 2482-2494 bp + 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 54450189-54454316(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTAAT
SmilChr02G004307 Chr02 NC_080388.1:65451526-65451538promoter 内 2425-2437 bp + 1564 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 65445620-65449962(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATGTAGGTAGA
SmilChr01G006005 Chr01 NC_080387.1:75618689-75618701promoter 内 2355-2367 bp - 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 75620335-75623815(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATGTAGGTAAA
SmilChr04G002899 Chr04 NC_080390.1:45268425-45268437promoter 内 2297-2309 bp + 1692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 45270129-45271193(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAACCTACCCAA
SmilChr04G000929 Chr04 NC_080390.1:12095984-12095996promoter 内 2154-2166 bp + 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 12097831-12098751(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATAGA
SmilChr01G005754 Chr01 NC_080387.1:73641366-73641378promoter 内 2027-2039 bp - 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 73631093-73639404(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACATCA
SmilChr01G004458 Chr01 NC_080387.1:62695097-62695109promoter 内 2009-2021 bp - 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 62697089-62699251(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTATA
SmilChr01G005455 Chr01 NC_080387.1:71592113-71592125promoter 内 1597-1609 bp + 2392 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 71588161-71589721(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGCAGTAGGTAAT
SmilChr02G000476 Chr02 NC_080388.1:6551689-6551701promoter 内 1439-1451 bp - 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 6554251-6560125(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAAT
SmilChr02G004308 Chr02 NC_080388.1:65451526-65451538promoter 内 1041-1053 bp + 2948 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 65454486-65460577(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACATTA
SmilChr05G001667 Chr05 NC_080391.1:15795632-15795644promoter 内 932-944 bp - 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 15798701-15800819(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAGGTAGGCAAG
SmilChr04G003566 Chr04 NC_080390.1:52032032-52032044promoter 内 871-883 bp + 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 52024493-52028914(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGATGTAGGTAAA
SmilChr01G002539 Chr01 NC_080387.1:43440874-43440886promoter 内 613-625 bp + 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 43444262-43446750(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATA
SmilChr02G004767 Chr02 NC_080388.1:69844358-69844370promoter 内 580-592 bp - 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 69847779-69848270(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAAT
SmilChr01G005061 Chr01 NC_080387.1:68523386-68523398promoter 内 386-398 bp - 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 68527001-68528110(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCGGTAGGTATG
SmilChr04G003307 Chr04 NC_080390.1:49811837-49811849promoter 内 296-308 bp + 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 49803582-49808144(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATGTAGGTAAA
SmilChr04G002697 Chr04 NC_080390.1:42470108-42470120promoter 内 94-106 bp - 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 42474015-42475474(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATTGTAGGTAAA
SmilChr03G003961 Chr03 NC_080389.1:58659944-58659956promoter 内 62-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 58652800-58656017(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATTTTAGGTAAG
SmilChr04G000871 Chr04 NC_080390.1:11023958-11023970promoter 内 3964-3976 bp - 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11022968-11023933(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACATA
SmilChr02G003028 Chr02 NC_080388.1:50995252-50995264promoter 内 3960-3972 bp + 29 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 50995293-50996129(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTACA
SmilChr02G003030 Chr02 NC_080388.1:51006014-51006026promoter 内 3909-3921 bp + 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51006106-51006841(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTACA
SmilChr03G003209 Chr03 NC_080389.1:49686044-49686056promoter 内 3758-3770 bp + 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49681917-49685813(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATTGTAGGTAAA
SmilChr03G002619 Chr03 NC_080389.1:41580544-41580556promoter 内 3605-3617 bp - 384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41580940-41582544(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAAT
SmilChr01G002858 Chr01 NC_080387.1:47160560-47160572promoter 内 3603-3615 bp - 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47160958-47163601(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGTTAGGTAAT
SmilChr01G004619 Chr01 NC_080387.1:64205059-64205071promoter 内 3576-3588 bp - 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 64205484-64206311(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAAT
SmilChr02G001709 Chr02 NC_080388.1:31488035-31488047promoter 内 3532-3544 bp - 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 31488504-31493193(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTTAGGTAAT
SmilChr01G003142 Chr01 NC_080387.1:50252247-50252259promoter 内 3448-3460 bp - 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 50252800-50259192(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATGTAGGTAAA
SmilChr03G001837 Chr03 NC_080389.1:25203877-25203889promoter 内 3431-3443 bp - 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25204447-25208084(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAG
SmilChr02G003218 Chr02 NC_080388.1:53362692-53362704promoter 内 3428-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53358199-53362131(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATAGA
SmilChr01G004618 Chr01 NC_080387.1:64205059-64205071promoter 内 3407-3419 bp - 582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 64202602-64204477(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTACA
SmilChr03G000417 Chr03 NC_080389.1:4499377-4499389promoter 内 3392-3404 bp - 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4499986-4500669(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGTTAGGTAAT
SmilChr04G004164 Chr04 NC_080390.1:56305832-56305844promoter 内 3304-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56304289-56305147(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTATTAGGTAAA
SmilChr05G001459 Chr05 NC_080391.1:13331213-13331225promoter 内 3298-3310 bp + 691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13326718-13330522(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATGTAGGTAAA
SmilChr01G000325 Chr01 NC_080387.1:6538831-6538843promoter 内 3176-3188 bp - 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6539656-6559465(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCGGTAGGTGGT
SmilChr01G000389 Chr01 NC_080387.1:8011797-8011809promoter 内 3163-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8008665-8010971(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATTTTAGGTAAG
SmilChr03G003926 Chr03 NC_080389.1:58346917-58346929promoter 内 3118-3130 bp - 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 58347800-58350150(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTAGTAGGTACG
SmilChr05G001637 Chr05 NC_080391.1:15336211-15336223promoter 内 3109-3121 bp - 880 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15324751-15335331(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACATA
SmilChr05G000991 Chr05 NC_080391.1:8046123-8046135promoter 内 3103-3115 bp - 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8047021-8048763(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACATTAGGTAAC
SmilChr02G002629 Chr02 NC_080388.1:45643349-45643361promoter 内 3006-3018 bp - 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45640897-45642366(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCACCTACCTTT
SmilChr01G001430 Chr01 NC_080387.1:27949300-27949312promoter 内 2949-2961 bp - 1040 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27946848-27948260(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCACCTACCTTT
SmilChr02G003625 Chr02 NC_080388.1:57572950-57572962promoter 内 2942-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 57570021-57571903(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTATA
SmilChr02G001362 Chr02 NC_080388.1:25533926-25533938promoter 内 2885-2897 bp - 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25531465-25532822(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCACCTACCTTT
SmilChr03G002138 Chr03 NC_080389.1:33318536-33318548promoter 内 2830-2842 bp - 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 33314936-33317377(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATA
SmilChr03G001190 Chr03 NC_080389.1:13703123-13703135promoter 内 2828-2840 bp - 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13699601-13701962(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATA
SmilChr03G004117 Chr03 NC_080389.1:60058958-60058970promoter 内 2827-2839 bp - 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60060132-60062697(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAGGTAGGCAGG
SmilChr02G000462 Chr02 NC_080388.1:6206590-6206602promoter 内 2792-2804 bp + 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6207799-6210362(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATA
SmilChr03G002618 Chr03 NC_080389.1:41580544-41580556promoter 内 2776-2788 bp - 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41573527-41579331(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTACA
SmilChr03G001189 Chr03 NC_080389.1:13692337-13692349promoter 内 2767-2779 bp - 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13688763-13691115(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATA
SmilChr02G000412 Chr02 NC_080388.1:5243248-5243260promoter 内 2763-2775 bp - 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 5239474-5242022(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATA
SmilChr03G001476 Chr03 NC_080389.1:17758410-17758422promoter 内 2735-2747 bp + 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17759676-17762201(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATA