转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 75 / 143 下载 TSV

上一页 75 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000961 Chr05 NC_080391.1:7756020-7756031promoter 内 3935-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7752882-7755965(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAACTGTCAA
SmilChr05G000896 Chr05 NC_080391.1:7090756-7090767promoter 内 3926-3937 bp + 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7087559-7090692(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAACTGTCAA
SmilChr08G001161 Chr08 NC_080394.1:9265334-9265345promoter 内 3823-3834 bp + 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9261107-9265167(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGA
SmilChr06G002278 Chr06 NC_080392.1:32671444-32671455promoter 内 3791-3802 bp + 199 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32671654-32673118(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCGT
SmilChr05G001505 Chr05 NC_080391.1:13797642-13797653promoter 内 3670-3681 bp + 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13797973-13803947(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAAC
SmilChr06G002506 Chr06 NC_080392.1:35937637-35937648promoter 内 3616-3627 bp - 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 35936050-35937263(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA
SmilChr02G001412 Chr02 NC_080388.1:26757502-26757513promoter 内 3609-3620 bp - 381 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 26752421-26757121(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTAGA
SmilChr05G002114 Chr05 NC_080391.1:22168690-22168701promoter 内 3588-3599 bp - 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 22169103-22175351(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAACTGTCAA
SmilChr04G001385 Chr04 NC_080390.1:22521004-22521015promoter 内 3561-3572 bp - 429 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 22521444-22523065(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTG
SmilChr04G001959 Chr04 NC_080390.1:31792125-31792136promoter 内 3548-3559 bp + 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 31792578-31795541(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCTC
SmilChr06G000719 Chr06 NC_080392.1:6554130-6554141promoter 内 3545-3556 bp + 445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6554586-6571493(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTCCAGCTGTG
SmilChr01G000058 Chr01 NC_080387.1:904559-904570promoter 内 3486-3497 bp + 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 905074-909862(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA
SmilChr03G002789 Chr03 NC_080389.1:44398356-44398367promoter 内 3367-3378 bp + 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 44398990-44400916(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA
SmilChr05G001507 Chr05 NC_080391.1:13825510-13825521promoter 内 3360-3371 bp + 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13826151-13826253(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCGT
SmilChr04G001958 Chr04 NC_080390.1:31792125-31792136promoter 内 3238-3249 bp + 752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 31790335-31791373(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTG
SmilChr07G002967 Chr07 NC_080393.1:30166722-30166733promoter 内 3144-3155 bp + 846 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30167579-30170008(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTT
SmilChr07G002948 Chr07 NC_080393.1:29875720-29875731promoter 内 3132-3143 bp + 858 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 29876589-29879014(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTT
SmilChr05G000273 Chr05 NC_080391.1:2117033-2117044promoter 内 3108-3119 bp + 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2117926-2122041(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCTC
SmilChr01G004662 Chr01 NC_080387.1:64725001-64725012promoter 内 3106-3117 bp - 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 64721669-64724117(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTT
SmilChr06G000350 Chr06 NC_080392.1:2643498-2643509promoter 内 3103-3114 bp + 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2644396-2651485(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCTC
SmilChr08G001451 Chr08 NC_080394.1:11687158-11687169promoter 内 3072-3083 bp - 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11688087-11688159(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr07G001892 Chr07 NC_080393.1:16341848-16341859promoter 内 2714-2725 bp + 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16343135-16345754(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTAGA
SmilChr05G001525 Chr05 NC_080391.1:13967208-13967219promoter 内 2675-2686 bp + 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13962947-13965893(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCCT
SmilChr06G001446 Chr06 NC_080392.1:15269844-15269855promoter 内 2555-2566 bp - 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15271290-15274894(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGA
SmilChr07G001556 Chr07 NC_080393.1:12684546-12684557promoter 内 2477-2488 bp + 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 12681256-12683033(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr03G000832 Chr03 NC_080389.1:9557126-9557137promoter 内 2460-2471 bp + 1530 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9548359-9555596(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCTT
SmilChr08G000029 Chr08 NC_080394.1:188286-188297promoter 内 2387-2398 bp + 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 189900-192536(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA
SmilChr06G002055 Chr06 NC_080392.1:27077799-27077810promoter 内 2349-2360 bp - 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27079451-27082371(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr03G001016 Chr03 NC_080389.1:11675161-11675172promoter 内 2279-2290 bp - 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11676883-11677709(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr02G000423 Chr02 NC_080388.1:5412868-5412879promoter 内 2275-2286 bp + 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 5414594-5417561(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTG
SmilChr04G000901 Chr04 NC_080390.1:11733711-11733722promoter 内 2244-2255 bp + 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11735468-11741559(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCTG
SmilChr05G000236 Chr05 NC_080391.1:1818188-1818199promoter 内 2232-2243 bp - 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1819957-1825488(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGA
SmilChr08G001452 Chr08 NC_080394.1:11687158-11687169promoter 内 2213-2224 bp - 1777 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11688946-11692857(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr06G000134 Chr06 NC_080392.1:946931-946942promoter 内 2120-2131 bp + 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 936349-945061(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr05G002305 Chr05 NC_080391.1:24906451-24906462promoter 内 2117-2128 bp + 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24908335-24909760(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA
SmilChr02G004431 Chr02 NC_080388.1:66667744-66667755promoter 内 2025-2036 bp + 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66663173-66665779(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr04G001168 Chr04 NC_080390.1:17400422-17400433promoter 内 1944-1955 bp - 2046 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17402479-17402584(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr03G001662 Chr03 NC_080389.1:21554318-21554329promoter 内 1915-1926 bp + 2075 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 21549798-21552243(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTG
SmilChr08G002710 Chr08 NC_080394.1:26657847-26657858promoter 内 1902-1913 bp + 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 26652772-26655759(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGA
SmilChr08G003527 Chr08 NC_080394.1:37878738-37878749promoter 内 1845-1856 bp + 2145 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 37875183-37876593(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGA
SmilChr02G003188 Chr02 NC_080388.1:53041765-53041776promoter 内 1839-1850 bp - 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53043927-53044668(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGA
SmilChr07G004666 Chr07 NC_080393.1:59573927-59573938promoter 内 1830-1841 bp - 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 59576098-59578503(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr01G003724 Chr01 NC_080387.1:55560670-55560681promoter 内 1714-1725 bp - 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55553418-55558394(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATC
SmilChr06G000249 Chr06 NC_080392.1:1652151-1652162promoter 内 1675-1686 bp + 2315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1654477-1655494(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAGC
SmilChr02G001853 Chr02 NC_080388.1:33748343-33748354promoter 内 1649-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 33750695-33751658(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAGC
SmilChr07G002216 Chr07 NC_080393.1:20413070-20413081promoter 内 1639-1650 bp - 2351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 20408587-20410719(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA
SmilChr07G002275 Chr07 NC_080393.1:20981156-20981167promoter 内 1554-1565 bp - 2436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 20978079-20978720(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTG
SmilChr04G000880 Chr04 NC_080390.1:11197034-11197045promoter 内 1492-1503 bp - 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11199543-11203389(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCGG
SmilChr01G000350 Chr01 NC_080387.1:7297521-7297532promoter 内 1491-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7300031-7302750(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGA
SmilChr01G000057 Chr01 NC_080387.1:904559-904570promoter 内 1457-1468 bp + 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 901436-902026(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAACTGTCAA