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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002277; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003292-RA_Salv SmilChr05G002277 ERF XP_057809665.1 MP00452 TCTTTGCCGACATCA

可能结合的靶基因

7783 个结合位点 6671 个候选靶基因 第 76 / 134 下载 TSV

上一页 76 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003602 Chr01 NC_080387.1:54568726-54568740promoter 内 1047-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54571680-54573014(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCCGCGCCGACACTC
SmilChr07G003333 Chr07 NC_080393.1:35673653-35673667promoter 内 992-1006 bp - 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 35668856-35670658(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GATGGGCCGACACCG
SmilChr03G003600 Chr03 NC_080389.1:54623982-54623996promoter 内 974-988 bp - 3013 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54627009-54632648(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGTGTCGGCGTTCA
SmilChr02G000535 Chr02 NC_080388.1:7371108-7371122promoter 内 951-965 bp - 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7374158-7375596(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACATGTCGGCATATT
SmilChr02G003613 Chr02 NC_080388.1:57373522-57373536promoter 内 943-957 bp + 3044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57367863-57370478(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACATGTCGGCATTAA
SmilChr07G000276 Chr07 NC_080393.1:1787075-1787089promoter 内 894-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1790182-1791948(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCGTGTCGGCATAGA
SmilChr05G002623 Chr05 NC_080391.1:29563024-29563038promoter 内 854-868 bp + 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 29557008-29559891(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCGTGTCGGCAAATT
SmilChr02G000136 Chr02 NC_080388.1:1856017-1856031promoter 内 841-855 bp - 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1851809-1852871(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACGGGGCCGACAAAG
SmilChr06G002394 Chr06 NC_080392.1:34733244-34733258promoter 内 818-832 bp + 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34736427-34737182(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCCGCGCCGACACTC
SmilChr08G000772 Chr08 NC_080394.1:5691205-5691219promoter 内 782-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5686469-5688000(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTCCAGCCGACATTT
SmilChr06G003044 Chr06 NC_080392.1:43305031-43305045promoter 内 774-788 bp + 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 43299131-43301818(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTGTGTCGGCAAAAA
SmilChr02G004206 Chr02 NC_080388.1:64317305-64317319promoter 内 765-779 bp - 3222 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 64320541-64323975(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATATGTCGGTCAGTT
SmilChr02G001795 Chr02 NC_080388.1:32718719-32718733promoter 内 728-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 32721992-32722846(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGGGGCCGACACCA
SmilChr01G000567 Chr01 NC_080387.1:11745747-11745761promoter 内 696-710 bp - 3291 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 11739553-11742456(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTGTTGCCGACGCCG
SmilChr05G002176 Chr05 NC_080391.1:23193233-23193247promoter 内 694-708 bp + 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 23188455-23189940(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTTTGTCGGCCCCGT
SmilChr08G000042 Chr08 NC_080394.1:282319-282333promoter 内 683-697 bp + 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 275874-279015(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GAGTGTCGGCGCGGA
SmilChr03G002076 Chr03 NC_080389.1:31749578-31749592promoter 内 667-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 31733993-31746258(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACTTGTCGGCGCGGC
SmilChr06G001048 Chr06 NC_080392.1:10345504-10345518promoter 内 651-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10348854-10350723(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTTTGGCCGACAACA
SmilChr02G003938 Chr02 NC_080388.1:61482815-61482829promoter 内 650-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 61486166-61488919(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACCGAACCGACATAG
SmilChr02G002618 Chr02 NC_080388.1:45496679-45496693promoter 内 558-572 bp - 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 45491760-45493250(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTATTGCCGACATTT
SmilChr02G005511 Chr02 NC_080388.1:75231505-75231519promoter 内 502-516 bp - 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 75235004-75238347(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AATTGTCGGCGGAGA
SmilChr02G004173 Chr02 NC_080388.1:64015399-64015413promoter 内 473-487 bp + 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 64018927-64028159(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTAATACCGACATAG
SmilChr02G003750 Chr02 NC_080388.1:59160779-59160793promoter 内 447-461 bp - 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59156578-59157239(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTCCTGCCGACGCAG
SmilChr02G002821 Chr02 NC_080388.1:48306390-48306404promoter 内 435-449 bp - 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 48309956-48312817(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AAATGTCGGCACTGC
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SmilChr07G003185 Chr07 NC_080393.1:33943052-33943066promoter 内 357-371 bp + 3630 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 33938403-33939422(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GAGTGTCGGCGCGGA
SmilChr07G001281 Chr07 NC_080393.1:9854797-9854811promoter 内 353-367 bp + 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 9847514-9851163(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATATGTCGGCTGGAA
SmilChr01G004473 Chr01 NC_080387.1:62823197-62823211promoter 内 330-344 bp - 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62826868-62826970(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCGTGTCGGCCAAAT
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SmilChr06G002651 Chr06 NC_080392.1:38327083-38327097promoter 内 276-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 38330808-38332529(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACGGGGCCGACAAAG
SmilChr02G003731 Chr02 NC_080388.1:58951905-58951919promoter 内 237-251 bp - 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 58942849-58948155(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AACCCGCCGACAATG
SmilChr08G000832 Chr08 NC_080394.1:6162200-6162214promoter 内 214-228 bp + 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6158321-6158427(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTTTGTCGGCCCCGT
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SmilChr07G001283 Chr07 NC_080393.1:9854797-9854811promoter 内 213-227 bp + 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 9858585-9859214(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTCCAGCCGACATAT
SmilChr03G000268 Chr03 NC_080389.1:3101519-3101533promoter 内 199-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3094510-3097731(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTTTGTCGGCCCCGT
SmilChr01G005864 Chr01 NC_080387.1:74583374-74583388promoter 内 192-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74579473-74579579(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTTTGTCGGCCCCGT
SmilChr01G005863 Chr01 NC_080387.1:74577519-74577533promoter 内 191-205 bp + 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74573617-74573723(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTTTGTCGGCCCCGT
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SmilChr05G000308 Chr05 NC_080391.1:2332281-2332295promoter 内 101-115 bp - 3886 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 2336181-2338814(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGAGGTCGGCAAGTA
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SmilChr03G002909 Chr03 NC_080389.1:45856009-45856023promoter 内 3956-3970 bp - 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 45856054-45858775(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGTTGTCGGCCCCAT
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SmilChr04G002088 Chr04 NC_080390.1:33648993-33649007promoter 内 2759-2773 bp + 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 33650235-33654137(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTGCTGCCGACGAGG
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SmilChr05G000353 Chr05 NC_080391.1:2635107-2635121promoter 内 1654-1668 bp + 2333 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 2637454-2639308(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTCAGGCCGACAAGG
SmilChr05G000351 Chr05 NC_080391.1:2635107-2635121promoter 内 1220-1234 bp + 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 2630799-2632340(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTTGTCGGCCTGAG