转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 78 / 136 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002053 Chr02 NC_080388.1:36935556-36935566promoter 内 2294-2304 bp - 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 36937263-36939768(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr03G001487 Chr03 NC_080389.1:17943720-17943730promoter 内 2283-2293 bp + 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 17945438-17947540(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTC
SmilChr01G005124 Chr01 NC_080387.1:69052109-69052119promoter 内 2265-2275 bp + 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 69053845-69055068(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGG
SmilChr08G001849 Chr08 NC_080394.1:15844828-15844838promoter 内 2230-2240 bp + 1761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 15846599-15855716(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr03G001252 Chr03 NC_080389.1:14442741-14442751promoter 内 2152-2162 bp + 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 14444590-14449243(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr02G002949 Chr02 NC_080388.1:50032290-50032300promoter 内 2143-2153 bp - 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 50029921-50030442(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGTCAGCGCG
SmilChr02G000906 Chr02 NC_080388.1:15635511-15635521promoter 内 2136-2146 bp + 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 15637376-15638997(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr03G002538 Chr03 NC_080389.1:40531566-40531576promoter 内 2112-2122 bp - 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 40533455-40533874(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT
SmilChr02G003556 Chr02 NC_080388.1:56733275-56733285promoter 内 2109-2119 bp + 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56735167-56739212(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGG
SmilChr02G001606 Chr02 NC_080388.1:29906710-29906720promoter 内 2093-2103 bp - 1898 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 29904162-29904812(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr06G000906 Chr06 NC_080392.1:8540254-8540264promoter 内 2088-2098 bp + 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8537858-8538351(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGT
SmilChr01G004708 Chr01 NC_080387.1:65187299-65187309promoter 内 2075-2085 bp - 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 65183708-65185383(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr01G000295 Chr01 NC_080387.1:5827842-5827852promoter 内 2061-2071 bp - 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 5823879-5825912(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTG
SmilChr06G000024 Chr06 NC_080392.1:266154-266164promoter 内 2045-2055 bp + 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 268110-270508(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGG
SmilChr05G003293 Chr05 NC_080391.1:43072749-43072759promoter 内 2041-2051 bp + 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 43067830-43070799(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT
SmilChr08G004360 Chr08 NC_080394.1:53336949-53336959promoter 内 2032-2042 bp - 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53327651-53334990(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGTCAGCGCC
SmilChr04G003909 Chr04 NC_080390.1:54830915-54830925promoter 内 2031-2041 bp - 1960 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54832885-54835347(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr05G001457 Chr05 NC_080391.1:13296791-13296801promoter 内 2002-2012 bp + 1989 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 13298790-13303856(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr03G001553 Chr03 NC_080389.1:19577073-19577083promoter 内 1938-1948 bp - 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 19579136-19579945(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr01G004401 Chr01 NC_080387.1:62131560-62131570promoter 内 1937-1947 bp + 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 62133624-62135549(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr04G003589 Chr04 NC_080390.1:52324508-52324518promoter 内 1934-1944 bp + 2057 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 52321623-52322451(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGT
SmilChr01G002888 Chr01 NC_080387.1:47545379-47545389promoter 内 1923-1933 bp - 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 47538029-47543311(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGC
SmilChr05G002939 Chr05 NC_080391.1:35446335-35446345promoter 内 1904-1914 bp + 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 35448432-35451182(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr08G001952 Chr08 NC_080394.1:17180678-17180688promoter 内 1890-1900 bp + 2101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 17182789-17184070(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCC
SmilChr02G003921 Chr02 NC_080388.1:61283573-61283583promoter 内 1870-1880 bp + 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 61285704-61287386(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGTCAGCGCG
SmilChr01G005233 Chr01 NC_080387.1:69910157-69910167promoter 内 1858-1868 bp + 2133 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 69912300-69919203(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTG
SmilChr01G000377 Chr01 NC_080387.1:7786142-7786152promoter 内 1831-1841 bp + 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 7779879-7783982(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr06G001741 Chr06 NC_080392.1:20091096-20091106promoter 内 1820-1830 bp - 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 20086357-20088925(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr03G004717 Chr03 NC_080389.1:64414138-64414148promoter 内 1790-1800 bp - 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 64408633-64411937(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr07G003183 Chr07 NC_080393.1:33907986-33907996promoter 内 1770-1780 bp - 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 33903474-33905765(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCC
SmilChr01G003088 Chr01 NC_080387.1:49702097-49702107promoter 内 1745-1755 bp - 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 49704353-49705442(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAACT
SmilChr07G002817 Chr07 NC_080393.1:28211137-28211147promoter 内 1733-1743 bp + 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28213405-28215417(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr03G002644 Chr03 NC_080389.1:42065459-42065469promoter 内 1676-1686 bp + 2315 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 42061571-42063144(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAACT
SmilChr01G005667 Chr01 NC_080387.1:72967601-72967611promoter 内 1647-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 72969955-72972116(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGT
SmilChr04G000414 Chr04 NC_080390.1:4342458-4342468promoter 内 1637-1647 bp - 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 4339745-4340104(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGG
SmilChr02G003808 Chr02 NC_080388.1:59716113-59716123promoter 内 1601-1611 bp + 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 59712965-59713723(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr03G002194 Chr03 NC_080389.1:34547062-34547072promoter 内 1583-1593 bp - 2408 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 34541585-34544654(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGC
SmilChr07G002608 Chr07 NC_080393.1:25085442-25085452promoter 内 1570-1580 bp - 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 25077373-25083021(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr02G004451 Chr02 NC_080388.1:66869570-66869580promoter 内 1549-1559 bp - 2442 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 66864139-66867128(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr02G002106 Chr02 NC_080388.1:37757515-37757525promoter 内 1533-1543 bp - 2458 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 37759983-37770656(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT
SmilChr05G003940 Chr05 NC_080391.1:53169189-53169199promoter 内 1528-1538 bp + 2463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53171662-53178336(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr08G004604 Chr08 NC_080394.1:55624164-55624174promoter 内 1519-1529 bp + 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 55620311-55621692(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr03G003342 Chr03 NC_080389.1:51751789-51751799promoter 内 1511-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 51754279-51757289(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCG
SmilChr02G000444 Chr02 NC_080388.1:5819660-5819670promoter 内 1450-1460 bp - 2541 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 5816373-5817119(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr08G000105 Chr08 NC_080394.1:641912-641922promoter 内 1428-1438 bp - 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 644485-647024(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr07G004366 Chr07 NC_080393.1:56196939-56196949promoter 内 1399-1409 bp - 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56199541-56202902(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACGA
SmilChr06G000845 Chr06 NC_080392.1:7991783-7991793promoter 内 1396-1406 bp + 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 7985661-7989188(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCG
SmilChr08G004808 Chr08 NC_080394.1:57396509-57396519promoter 内 1389-1399 bp + 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 57399121-57401574(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr01G005504 Chr01 NC_080387.1:71907710-71907720promoter 内 1374-1384 bp - 2617 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 71903118-71905093(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr01G004400 Chr01 NC_080387.1:62131560-62131570promoter 内 1341-1351 bp + 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 62127717-62128910(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT