Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005433; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00021978-RA_Salv SmilChr02G005433 WRKY XP_057792682.1 MP00209 CGTTGACTTTTTTTAACAT

可能结合的靶基因

9910 个结合位点 8083 个候选靶基因 第 78 / 162 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr06G002847 Chr06 NC_080392.1:41234651-41234669promoter 内 1277-1295 bp + 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41237375-41240138(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTGACGGAGTTAG
SmilChr01G006148 Chr01 NC_080387.1:76949815-76949833promoter 内 1234-1252 bp + 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 76952582-76955077(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTGTCCGACGGC
SmilChr05G000995 Chr05 NC_080391.1:8080543-8080561promoter 内 1212-1230 bp - 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8066534-8077772(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTGGTGTCAATTC
SmilChr07G004053 Chr07 NC_080393.1:51847745-51847763promoter 内 1198-1216 bp - 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51850548-51853059(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CAGCCTAAGATAGTCAACT
SmilChr01G001417 Chr01 NC_080387.1:27758831-27758849promoter 内 1195-1213 bp - 2788 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 27755515-27756043(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTCAACCCAAAAT
SmilChr02G000536 Chr02 NC_080388.1:7389410-7389428promoter 内 1174-1192 bp - 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 7392237-7393374(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGAATAGAAAGAGTCAACA
SmilChr04G001837 Chr04 NC_080390.1:29928387-29928405promoter 内 1100-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 29922245-29925504(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTGGTGTGAGTG
SmilChr07G001722 Chr07 NC_080393.1:14657844-14657862promoter 内 1099-1117 bp - 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14652580-14654960(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTTGCTGTTCAT
SmilChr04G000419 Chr04 NC_080390.1:4418339-4418357promoter 内 1078-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 4421262-4424889(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTGTGTTTTCGA
SmilChr04G002239 Chr04 NC_080390.1:36153634-36153652promoter 内 979-997 bp - 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 36156656-36164001(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTGAAGTTGGTGGTCAACG
SmilChr03G003385 Chr03 NC_080389.1:52218062-52218080promoter 内 974-992 bp + 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52205301-52215053(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ACCAAGGTGGTGGTCAACG
SmilChr04G001618 Chr04 NC_080390.1:26968845-26968863promoter 内 961-979 bp - 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26954229-26965823(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTACAAAGCAAT
SmilChr07G002427 Chr07 NC_080393.1:22591679-22591697promoter 内 939-957 bp - 3044 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 22594741-22599568(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AACTCGATAATAGTCAACC
SmilChr02G004953 Chr02 NC_080388.1:71493842-71493860promoter 内 903-921 bp - 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 71488154-71490762(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTTGAATTAAAC
SmilChr05G003220 Chr05 NC_080391.1:41314579-41314597promoter 内 870-888 bp - 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41317710-41319903(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TAGTTATTGGTGGTCAACG
SmilChr07G001821 Chr07 NC_080393.1:15708243-15708261promoter 内 858-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 15711386-15713948(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTTAGGCTTAGG
SmilChr04G001688 Chr04 NC_080390.1:27928021-27928039promoter 内 818-836 bp + 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 27931204-27932173(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTTAGTCTACTT
SmilChr08G002206 Chr08 NC_080394.1:19983787-19983805promoter 内 760-778 bp - 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 19970369-19980564(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTGTTTATCGTC
SmilChr06G002846 Chr06 NC_080392.1:41234651-41234669promoter 内 701-719 bp + 3282 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41228988-41231369(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTAACTCCGTCAGTCAACG
SmilChr06G002513 Chr06 NC_080392.1:36026182-36026200promoter 内 631-649 bp + 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 36018022-36022830(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTGTATACTTAAGTCAACA
SmilChr01G002474 Chr01 NC_080387.1:42481031-42481049promoter 内 586-604 bp - 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 42484446-42486418(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTCTGGCCCGTGGTCAACG
SmilChr01G003898 Chr01 NC_080387.1:57263840-57263858promoter 内 514-532 bp - 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 57254068-57260371(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTAGAGCCGTCAA
SmilChr07G000078 Chr07 NC_080393.1:424923-424941promoter 内 497-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 364181-421437(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTTGACCAAATA
SmilChr02G004539 Chr02 NC_080388.1:67960985-67961003promoter 内 481-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 67964505-67965669(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGCATTTCACAAGTCAACC
SmilChr01G000425 Chr01 NC_080387.1:8525878-8525896promoter 内 415-433 bp - 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8514196-8522310(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTGTATTTGGGAG
SmilChr03G000780 Chr03 NC_080389.1:8882442-8882460promoter 内 411-429 bp - 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8886032-8889879(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTCATAATAAAAGTCAAAG
SmilChr06G001755 Chr06 NC_080392.1:20478336-20478354promoter 内 410-428 bp + 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 20481927-20483160(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCACCAATAACTA
SmilChr07G002957 Chr07 NC_080393.1:30047708-30047726promoter 内 408-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 30042192-30044133(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTGGGATCAGAT
SmilChr04G000913 Chr04 NC_080390.1:11889885-11889903promoter 内 403-421 bp + 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 11893483-11894214(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCAGTATGGGCA
SmilChr03G001457 Chr03 NC_080389.1:17405637-17405655promoter 内 367-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 17398274-17402021(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCGACCATCAAAGTCAAAG
SmilChr04G000721 Chr04 NC_080390.1:8471404-8471422promoter 内 356-374 bp - 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8461382-8467777(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTTGCTCCAGTC
SmilChr01G001039 Chr01 NC_080387.1:21640869-21640887promoter 内 349-367 bp - 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 21635892-21637235(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTATGTTTTAGTG
SmilChr04G002994 Chr04 NC_080390.1:46360698-46360716promoter 内 324-342 bp + 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 46356033-46357039(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTCTTCGGAAAAGTCAACC
SmilChr04G003260 Chr04 NC_080390.1:49315372-49315390promoter 内 305-323 bp + 3678 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 49309153-49311694(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GACTGGAGCAAAGTCAACA
SmilChr03G001238 Chr03 NC_080389.1:14279768-14279786promoter 内 290-308 bp - 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14283479-14283974(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GACTGGAGCAAAGTCAACA
SmilChr04G001620 Chr04 NC_080390.1:26968845-26968863promoter 内 283-301 bp - 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26960806-26965145(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTACAAAGCAAT
SmilChr08G001002 Chr08 NC_080394.1:7535518-7535536promoter 内 258-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 7539261-7543538(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTCATAAAAGTA
SmilChr06G000263 Chr06 NC_080392.1:1763990-1764008promoter 内 257-275 bp + 3726 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 1758554-1760264(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTGTATACTTAAGTCAACA
SmilChr05G002416 Chr05 NC_080391.1:26695670-26695688promoter 内 252-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26689756-26691939(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTGTATACTTAAGTCAACA
SmilChr01G000878 Chr01 NC_080387.1:18664625-18664643promoter 内 205-223 bp - 3778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 18659187-18660847(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTTGTCAAGAAT
SmilChr06G002091 Chr06 NC_080392.1:27695166-27695184promoter 内 194-212 bp - 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 27686960-27691377(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCAATCTGCCTC
SmilChr02G000328 Chr02 NC_080388.1:4176151-4176169promoter 内 187-205 bp + 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 4179965-4180783(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTTGATGGTCGG
SmilChr07G002505 Chr07 NC_080393.1:23764457-23764475promoter 内 145-163 bp + 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 23768313-23772345(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCTTGGAGGCTC
SmilChr02G001117 Chr02 NC_080388.1:20138895-20138913promoter 内 140-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 20132853-20135052(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGCCTCCAAGAGTCAACA
SmilChr04G001041 Chr04 NC_080390.1:14828312-14828330promoter 内 116-134 bp - 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14821370-14824445(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTCTTCTTTCCC
SmilChr02G003732 Chr02 NC_080388.1:58966866-58966884promoter 内 108-126 bp + 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 58960737-58962991(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGATTATTTTTGGTCAACG
SmilChr06G001529 Chr06 NC_080392.1:16537574-16537592promoter 内 21-39 bp + 3962 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 16532992-16533612(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATCATTTACAAAGTCAACT
SmilChr04G001144 Chr04 NC_080390.1:16860470-16860488promoter 内 3506-3524 bp - 477 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 16860965-16865244(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AAATCTGATAAAGTCAACT
SmilChr05G002262 Chr05 NC_080391.1:24336030-24336048promoter 内 3093-3111 bp - 890 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 24331720-24335140(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTAGTCGAATAC
SmilChr05G002170 Chr05 NC_080391.1:23048118-23048136promoter 内 1090-1108 bp - 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 23051029-23054239(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CAGGCATTCCAAGTCAACT