转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 78 / 149 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003047 Chr07 NC_080393.1:31665989-31665999promoter 内 243-253 bp + 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 31661681-31662241(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr05G003090 Chr05 NC_080391.1:39113922-39113932promoter 内 241-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 39109825-39110172(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAA
SmilChr01G000282 Chr01 NC_080387.1:5537024-5537034promoter 内 235-245 bp + 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 5531763-5533268(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAA
SmilChr02G005580 Chr02 NC_080388.1:75628905-75628915promoter 内 215-225 bp - 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 75632691-75636781(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr07G002937 Chr07 NC_080393.1:29744586-29744596promoter 内 186-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 29748401-29752422(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTG
SmilChr03G001796 Chr03 NC_080389.1:24568995-24569005promoter 内 141-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24572855-24575792(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAA
SmilChr03G002843 Chr03 NC_080389.1:44977582-44977592promoter 内 114-124 bp - 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 44971882-44973705(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAGGGCTGTCA
SmilChr01G000235 Chr01 NC_080387.1:4399496-4399506promoter 内 111-121 bp + 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 4403386-4405265(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCA
SmilChr03G001862 Chr03 NC_080389.1:25707884-25707894promoter 内 102-112 bp - 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 25711783-25712259(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAA
SmilChr06G000182 Chr06 NC_080392.1:1263163-1263173promoter 内 96-106 bp - 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 1267068-1270344(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTG
SmilChr04G000207 Chr04 NC_080390.1:1831533-1831543promoter 内 94-104 bp - 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 1835440-1839166(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTG
SmilChr03G002297 Chr03 NC_080389.1:36193959-36193969promoter 内 84-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 36185510-36190052(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCC
SmilChr05G002696 Chr05 NC_080391.1:30825769-30825779promoter 内 77-87 bp + 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 30829693-30831826(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCA
SmilChr02G001356 Chr02 NC_080388.1:25344124-25344134promoter 内 73-83 bp + 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 25338398-25340206(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr02G000883 Chr02 NC_080388.1:15229113-15229123promoter 内 72-82 bp - 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 15222287-15225194(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCA
SmilChr07G002421 Chr07 NC_080393.1:22546396-22546406promoter 内 51-61 bp - 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 22550346-22551014(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTG
SmilChr05G002748 Chr05 NC_080391.1:31689655-31689665promoter 内 46-56 bp - 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 31693610-31695595(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAA
SmilChr01G000547 Chr01 NC_080387.1:11303195-11303205promoter 内 20-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 11307176-11308469(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAA
SmilChr03G003681 Chr03 NC_080389.1:55650663-55650673promoter 内 11-21 bp - 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 55654653-55655777(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr01G002927 Chr01 NC_080387.1:48048866-48048876promoter 内 6-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 48052861-48056753(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTG
SmilChr02G002811 Chr02 NC_080388.1:48156106-48156116promoter 内 6-16 bp + 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 48150724-48152121(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr05G002395 Chr05 NC_080391.1:26445120-26445130promoter 内 303-313 bp + 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 26440606-26441432(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr05G002396 Chr05 NC_080391.1:26445120-26445130promoter 内 3752-3762 bp + 239 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 26443203-26444881(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr01G002321 Chr01 NC_080387.1:40283199-40283209promoter 内 3558-3568 bp - 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 40281402-40282766(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCC
SmilChr01G002232 Chr01 NC_080387.1:38798023-38798033promoter 内 3019-3029 bp - 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 38799005-38801879(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr01G002216 Chr01 NC_080387.1:38488568-38488578promoter 内 2863-2873 bp - 1128 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 38489706-38492423(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr02G003498 Chr02 NC_080388.1:56204129-56204139promoter 内 2718-2728 bp - 1273 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 56202295-56202856(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr05G002849 Chr05 NC_080391.1:33977744-33977754promoter 内 2628-2638 bp + 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 33979117-33981217(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAG
SmilChr02G003109 Chr02 NC_080388.1:52071694-52071704promoter 内 1976-1986 bp + 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 52073719-52074792(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr07G000754 Chr07 NC_080393.1:5308847-5308857promoter 内 1781-1791 bp + 2210 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 5311067-5314307(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCC
SmilChr02G001095 Chr02 NC_080388.1:19745319-19745329promoter 内 1467-1477 bp - 2524 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 19747853-19752356(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGC
SmilChr01G000319 Chr01 NC_080387.1:6220426-6220436promoter 内 1439-1449 bp + 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 6216030-6217874(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGC
SmilChr01G001807 Chr01 NC_080387.1:33006086-33006096promoter 内 1115-1125 bp - 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 32999788-33003210(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr04G001030 Chr04 NC_080390.1:14569165-14569175promoter 内 1017-1027 bp + 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 14572149-14573445(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAG
SmilChr02G000548 Chr02 NC_080388.1:7600911-7600921promoter 内 598-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 7596257-7597518(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr05G002728 Chr05 NC_080391.1:31406663-31406673promoter 内 589-599 bp - 3402 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 31400301-31403261(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAG
SmilChr07G002815 Chr07 NC_080393.1:28175031-28175041promoter 内 164-174 bp + 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 28178868-28181702(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr01G002213 Chr01 NC_080387.1:38488568-38488578promoter 内 42-52 bp - 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 38481612-38484619(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr01G002230 Chr01 NC_080387.1:38798023-38798033promoter 内 42-52 bp - 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 38791046-38794074(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr04G000822 Chr04 NC_080390.1:10318001-10318011promoter 内 3936-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 10318066-10323022(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr03G000144 Chr03 NC_080389.1:1576267-1576277promoter 内 3933-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 1576335-1579231(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr03G000145 Chr03 NC_080389.1:1586977-1586987promoter 内 3933-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 1587045-1589941(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr06G000945 Chr06 NC_080392.1:9058422-9058432promoter 内 3929-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 9058494-9063333(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGC
SmilChr05G000750 Chr05 NC_080391.1:5809968-5809978promoter 内 3658-3668 bp - 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5806255-5809635(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCG
SmilChr03G003480 Chr03 NC_080389.1:53348348-53348358promoter 内 3540-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53348809-53359732(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr03G001492 Chr03 NC_080389.1:18073469-18073479promoter 内 3448-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 18074022-18075038(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAG
SmilChr05G004171 Chr05 NC_080391.1:55646565-55646575promoter 内 3320-3330 bp - 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 55647246-55650657(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr01G001121 Chr01 NC_080387.1:22833162-22833172promoter 内 3153-3163 bp - 838 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 22831740-22832324(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCG
SmilChr07G001358 Chr07 NC_080393.1:10526381-10526391promoter 内 3146-3156 bp - 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 10527236-10531327(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr04G002097 Chr04 NC_080390.1:33806812-33806822promoter 内 2977-2987 bp - 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 33807836-33814671(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC