转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 8 / 149 下载 TSV

上一页 8 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000216 Chr01 NC_080387.1:3782556-3782566promoter 内 2478-2488 bp + 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 3784079-3786946(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGGCT
SmilChr06G000057 Chr06 NC_080392.1:453705-453715promoter 内 2434-2444 bp + 1557 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 455272-459376(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr02G000382 Chr02 NC_080388.1:4785536-4785546promoter 内 2411-2421 bp - 1580 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 4780702-4783956(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr01G000273 Chr01 NC_080387.1:5441463-5441473promoter 内 2406-2416 bp - 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 5443058-5444817(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr02G004654 Chr02 NC_080388.1:68962410-68962420promoter 内 2178-2188 bp - 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 68964233-68967733(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr05G002970 Chr05 NC_080391.1:36089178-36089188promoter 内 2057-2067 bp - 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 36091122-36092295(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr05G003030 Chr05 NC_080391.1:37914039-37914049promoter 内 2014-2024 bp - 1977 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 37916026-37918649(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGCCAGCTGGT
SmilChr05G003940 Chr05 NC_080391.1:53169661-53169671promoter 内 2000-2010 bp - 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 53171662-53178336(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr04G000862 Chr04 NC_080390.1:10921363-10921373promoter 内 1978-1988 bp - 2013 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 10923386-10925692(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr05G000399 Chr05 NC_080391.1:2997216-2997226promoter 内 1937-1947 bp - 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 2999280-3007173(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr01G001199 Chr01 NC_080387.1:24127868-24127878promoter 内 1934-1944 bp - 2057 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 24129935-24142594(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr05G003774 Chr05 NC_080391.1:51100420-51100430promoter 内 1802-1812 bp + 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 51102619-51112990(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr05G001041 Chr05 NC_080391.1:8527045-8527055promoter 内 1797-1807 bp - 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 8529249-8532604(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr06G002301 Chr06 NC_080392.1:33246430-33246440promoter 内 1727-1737 bp + 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 33241591-33244166(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr03G004068 Chr03 NC_080389.1:59664382-59664392promoter 内 1657-1667 bp - 2334 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 59658877-59662048(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr02G002219 Chr02 NC_080388.1:39457444-39457454promoter 内 1552-1562 bp - 2439 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 39459893-39466174(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr03G003636 Chr03 NC_080389.1:55046804-55046814promoter 内 1400-1410 bp + 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 55049405-55050626(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr07G002744 Chr07 NC_080393.1:26972759-26972769promoter 内 1329-1339 bp - 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 26965476-26970097(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr07G001259 Chr07 NC_080393.1:9692391-9692401promoter 内 1303-1313 bp + 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 9695089-9699558(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr02G000067 Chr02 NC_080388.1:872767-872777promoter 内 1000-1010 bp - 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 866558-869776(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr02G000155 Chr02 NC_080388.1:2015889-2015899promoter 内 988-998 bp + 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 2018902-2021942(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr05G000765 Chr05 NC_080391.1:5935773-5935783promoter 内 988-998 bp - 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 5938786-5940012(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr03G002078 Chr03 NC_080389.1:31894479-31894489promoter 内 986-996 bp - 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 31897494-31903418(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr01G001541 Chr01 NC_080387.1:29430409-29430419promoter 内 955-965 bp - 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 29433455-29433526(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr05G003395 Chr05 NC_080391.1:44986121-44986131promoter 内 664-674 bp - 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 44981094-44982794(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr02G000738 Chr02 NC_080388.1:11959175-11959185promoter 内 515-525 bp - 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 11952330-11955699(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGGCT
SmilChr01G001448 Chr01 NC_080387.1:28185057-28185067promoter 内 344-354 bp - 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 28179537-28181410(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr06G002033 Chr06 NC_080392.1:26529729-26529739promoter 内 207-217 bp - 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 26514016-26525945(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr05G003775 Chr05 NC_080391.1:51110164-51110174promoter 内 201-211 bp + 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 51113964-51118697(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr07G002270 Chr07 NC_080393.1:20921760-20921770promoter 内 132-142 bp + 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 20925629-20930583(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr06G001505 Chr06 NC_080392.1:16083419-16083429promoter 内 3890-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 16082373-16083318(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr07G001936 Chr07 NC_080393.1:16766690-16766700promoter 内 3814-3824 bp - 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 16766877-16768734(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr05G002470 Chr05 NC_080391.1:27218130-27218140promoter 内 3700-3710 bp + 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 27218431-27222151(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr05G003691 Chr05 NC_080391.1:50041541-50041551promoter 内 3556-3566 bp + 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 50033387-50041106(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr01G003788 Chr01 NC_080387.1:56267101-56267111promoter 内 3525-3535 bp + 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 56263367-56266635(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr01G000315 Chr01 NC_080387.1:6072045-6072055promoter 内 3435-3445 bp - 556 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 6069699-6071489(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr07G002964 Chr07 NC_080393.1:30121895-30121905promoter 内 3382-3392 bp + 609 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 30122514-30124392(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCC
SmilChr01G001720 Chr01 NC_080387.1:31678878-31678888promoter 内 3315-3325 bp + 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 31669833-31678202(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr06G000820 Chr06 NC_080392.1:7725940-7725950promoter 内 3171-3181 bp - 820 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 7722643-7725120(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCC
SmilChr02G000781 Chr02 NC_080388.1:12837955-12837965promoter 内 2965-2975 bp - 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 12835022-12836929(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr04G000498 Chr04 NC_080390.1:5453446-5453456promoter 内 2903-2913 bp + 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 5436779-5452358(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr02G002018 Chr02 NC_080388.1:36382462-36382472promoter 内 2680-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 36383783-36388678(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr01G004563 Chr01 NC_080387.1:63711125-63711135promoter 内 2534-2544 bp + 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 63708057-63709668(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGCCAGCTGGT
SmilChr02G000383 Chr02 NC_080388.1:4785536-4785546promoter 内 2515-2525 bp - 1476 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 4787022-4791337(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr05G002673 Chr05 NC_080391.1:30208516-30208526promoter 内 2472-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 30206002-30206997(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGCCAGCTGGT
SmilChr01G006097 Chr01 NC_080387.1:76439551-76439561promoter 内 2426-2436 bp - 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 76441126-76445290(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr02G005584 Chr02 NC_080388.1:75661289-75661299promoter 内 2316-2326 bp + 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 75651935-75659614(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr06G002891 Chr06 NC_080392.1:41765424-41765434promoter 内 2291-2301 bp + 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 41761342-41763724(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr02G000403 Chr02 NC_080388.1:4996915-4996925promoter 内 2245-2255 bp + 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 4998671-5001508(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr01G003798 Chr01 NC_080387.1:56365471-56365481promoter 内 2233-2243 bp - 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 56359032-56363713(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCC