转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G001978; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00026506-RA_Salv SmilChr07G001978 SBP XP_057776996.1 MP00555 ATTGTACGGAT

可能结合的靶基因

9805 个结合位点 7648 个候选靶基因 第 81 / 153 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003788 Chr04 NC_080390.1:54047434-54047444promoter 内 376-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54031212-54043819(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CGCCGTACATG
SmilChr05G001700 Chr05 NC_080391.1:16204487-16204497promoter 内 359-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 16208129-16212518(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATACGTACAAT
SmilChr04G002305 Chr04 NC_080390.1:37322674-37322684promoter 内 90-100 bp + 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 37326585-37327405(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTGTACGTAT
SmilChr03G000189 Chr03 NC_080389.1:2102336-2102346promoter 内 88-98 bp - 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 2106249-2109378(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATACGTACAAT
SmilChr04G003613 Chr04 NC_080390.1:52611615-52611625promoter 内 79-89 bp - 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 52615537-52623935(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATACGTACAAT
SmilChr02G001585 Chr02 NC_080388.1:29599754-29599764promoter 内 59-69 bp - 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 29603696-29605036(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CTCAGTACAAT
SmilChr03G004266 Chr03 NC_080389.1:61143163-61143173promoter 内 3744-3754 bp - 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 61138318-61142916(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 AAAGTACGGAT
SmilChr02G003463 Chr02 NC_080388.1:55920652-55920662promoter 内 2055-2065 bp - 1936 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 55922598-55931701(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTACGTACAAT
SmilChr01G005181 Chr01 NC_080387.1:69531431-69531441promoter 内 1961-1971 bp + 2030 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 69533471-69535820(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTGTACGTAA
SmilChr03G000598 Chr03 NC_080389.1:6629426-6629436promoter 内 1258-1268 bp + 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 6623155-6626693(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACTTT
SmilChr03G003271 Chr03 NC_080389.1:50677563-50677573promoter 内 1157-1167 bp + 2834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 50671183-50674729(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACTTT
SmilChr05G000417 Chr05 NC_080391.1:3152629-3152639promoter 内 3956-3966 bp - 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 3152674-3154758(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CTCCGTACTAC
SmilChr04G002006 Chr04 NC_080390.1:32489027-32489037promoter 内 3539-3549 bp - 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 32489489-32491723(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTCCGTACTAG
SmilChr02G005108 Chr02 NC_080388.1:72595498-72595508promoter 内 3457-3467 bp - 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 72591050-72594964(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTGTACGGGC
SmilChr05G002236 Chr05 NC_080391.1:23971926-23971936promoter 内 3427-3437 bp + 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 23972500-23975801(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTTGTACGAAT
SmilChr01G001022 Chr01 NC_080387.1:21389279-21389289promoter 内 3328-3338 bp + 663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 21389952-21391214(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTTGTACGAAT
SmilChr05G000416 Chr05 NC_080391.1:3145539-3145549promoter 内 3291-3301 bp + 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 3143893-3144839(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTCGTACAAC
SmilChr05G003470 Chr05 NC_080391.1:46095948-46095958promoter 内 2973-2983 bp + 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 46094185-46094930(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTCGTACAAC
SmilChr03G004515 Chr03 NC_080389.1:63200250-63200260promoter 内 2811-2821 bp + 1180 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 63201440-63202039(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 AAAGTACGGAT
SmilChr01G003142 Chr01 NC_080387.1:50251594-50251604promoter 内 2795-2805 bp + 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 50252800-50259192(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTGTACGTAA
SmilChr03G001593 Chr03 NC_080389.1:20189608-20189618promoter 内 2484-2494 bp + 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 20191125-20194405(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 AAAGTACGGAA
SmilChr03G000712 Chr03 NC_080389.1:7912936-7912946promoter 内 2301-2311 bp - 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 7914636-7917421(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTCGTACAAC
SmilChr01G005059 Chr01 NC_080387.1:68498567-68498577promoter 内 1955-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 68500613-68523773(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTCCGTACTAG
SmilChr02G002432 Chr02 NC_080388.1:42332623-42332633promoter 内 1600-1610 bp - 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 42335024-42336319(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTCCGTACTTT
SmilChr01G006009 Chr01 NC_080387.1:75652628-75652638promoter 内 1542-1552 bp - 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 75647259-75650179(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTTGTACGAAT
SmilChr01G003094 Chr01 NC_080387.1:49761100-49761110promoter 内 1336-1346 bp - 2655 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 49750153-49758445(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTGTACGTAA
SmilChr04G000544 Chr04 NC_080390.1:6061626-6061636promoter 内 1297-1307 bp + 2694 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 6057076-6058932(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTCGTACAAC
SmilChr03G004513 Chr03 NC_080389.1:63200250-63200260promoter 内 1151-1161 bp + 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 63193169-63197410(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACTTT
SmilChr01G005706 Chr01 NC_080387.1:73289444-73289454promoter 内 1088-1098 bp - 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 73292357-73299300(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTCGTACAAC
SmilChr05G003858 Chr05 NC_080391.1:52125643-52125653promoter 内 995-1005 bp - 2996 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 52115112-52122647(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTTGTACGAAT
SmilChr02G001339 Chr02 NC_080388.1:24907998-24908008promoter 内 924-934 bp - 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 24903546-24904931(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTTGTACGAAT
SmilChr02G004643 Chr02 NC_080388.1:68874414-68874424promoter 内 786-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 68869654-68871209(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTGTACGTAA
SmilChr04G003066 Chr04 NC_080390.1:47205667-47205677promoter 内 652-662 bp - 3339 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 47202256-47202328(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTTGTACGAAA
SmilChr05G000687 Chr05 NC_080391.1:5199732-5199742promoter 内 591-601 bp + 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 5203142-5209542(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTGTACGGGC
SmilChr03G003898 Chr03 NC_080389.1:58075493-58075503promoter 内 394-404 bp - 3597 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 58059440-58071896(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTGTACGTAA
SmilChr04G003515 Chr04 NC_080390.1:51530174-51530184promoter 内 219-229 bp + 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 51514880-51526402(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACTTT
SmilChr05G000573 Chr05 NC_080391.1:4318435-4318445promoter 内 193-203 bp - 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 4310740-4314637(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 AAAGTACGGAT
SmilChr04G003147 Chr04 NC_080390.1:48104640-48104650promoter 内 142-152 bp + 3849 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 48108499-48108571(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTTGTACGAAA
SmilChr01G004431 Chr01 NC_080387.1:62417304-62417314promoter 内 3986-3996 bp + 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 62415542-62417299(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTCGTACAAC
SmilChr05G003281 Chr05 NC_080391.1:42739959-42739969promoter 内 3922-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 42738934-42739890(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTACGTACAAT
SmilChr02G001493 Chr02 NC_080388.1:27883117-27883127promoter 内 3895-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27883223-27885551(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACTTT
SmilChr03G004527 Chr03 NC_080389.1:63314699-63314709promoter 内 3881-3891 bp + 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63314819-63318265(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTGTACGGGC
SmilChr01G005515 Chr01 NC_080387.1:71980803-71980813promoter 内 3770-3780 bp - 221 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71975466-71980582(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 AAAGTACGGAA
SmilChr02G003178 Chr02 NC_080388.1:52936965-52936975promoter 内 3723-3733 bp + 268 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52937243-52940759(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 AGAGTACGGAG
SmilChr04G002088 Chr04 NC_080390.1:33649924-33649934promoter 内 3690-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 33650235-33654137(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTGTACGTAA
SmilChr05G002524 Chr05 NC_080391.1:28085185-28085195promoter 内 3651-3661 bp + 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28085535-28090191(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATTGTACGTAA
SmilChr02G002808 Chr02 NC_080388.1:48139149-48139159promoter 内 3640-3650 bp + 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 48139510-48141224(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTTGTACGAAA
SmilChr02G001309 Chr02 NC_080388.1:24335978-24335988promoter 内 3604-3614 bp + 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 24321846-24335591(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GCCCGTACAAA
SmilChr03G002177 Chr03 NC_080389.1:33828761-33828771promoter 内 3602-3612 bp + 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 33826747-33828372(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACTGG
SmilChr03G003262 Chr03 NC_080389.1:50541339-50541349promoter 内 3590-3600 bp - 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 50541750-50544835(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTTCGTACAAC