转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 84 / 151 下载 TSV

上一页 84 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000307 Chr05 NC_080391.1:2327707-2327719promoter 内 2545-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 2325271-2326263(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr04G000576 Chr04 NC_080390.1:6419624-6419636promoter 内 2365-2377 bp + 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 6421260-6422212(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr04G001519 Chr04 NC_080390.1:25088810-25088822promoter 内 2362-2374 bp + 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 25090449-25092971(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCAAT
SmilChr02G003178 Chr02 NC_080388.1:52935493-52935505promoter 内 2251-2263 bp - 1738 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 52937243-52940759(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACATGTAGGTAAG
SmilChr01G003076 Chr01 NC_080387.1:49597495-49597507promoter 内 2017-2029 bp + 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 49599479-49603293(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACCTG
SmilChr01G004651 Chr01 NC_080387.1:64633994-64634006promoter 内 1698-1710 bp + 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 64629285-64631703(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAGGTAGGTTGG
SmilChr04G000292 Chr04 NC_080390.1:2717409-2717421promoter 内 1651-1663 bp + 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 2719759-2720911(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGCCTACCTTC
SmilChr04G000007 Chr04 NC_080390.1:109505-109517promoter 内 1508-1520 bp + 2481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 111998-116009(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTCCCTCC
SmilChr04G001131 Chr04 NC_080390.1:16578449-16578461promoter 内 1390-1402 bp + 2599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 16560355-16575850(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCGAGTAGGTACA
SmilChr03G003630 Chr03 NC_080389.1:54970137-54970149promoter 内 1300-1312 bp - 2689 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 54972838-54974617(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr05G001237 Chr05 NC_080391.1:10476966-10476978promoter 内 1075-1087 bp - 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 10479892-10482261(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGAGTAGGTAGT
SmilChr04G003024 Chr04 NC_080390.1:46657577-46657589promoter 内 802-814 bp + 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 46660776-46661287(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr02G005057 Chr02 NC_080388.1:72274511-72274523promoter 内 700-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 72277812-72279187(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCAGTAGGTACA
SmilChr01G004652 Chr01 NC_080387.1:64633994-64634006promoter 内 453-465 bp + 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 64637542-64637843(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCTGA
SmilChr05G001749 Chr05 NC_080391.1:17030402-17030414promoter 内 382-394 bp - 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 17034021-17036216(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACAGTAGGTACA
SmilChr04G002641 Chr04 NC_080390.1:41807547-41807559promoter 内 280-292 bp + 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 41802279-41803838(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGAGTAGGTAAT
SmilChr01G003217 Chr01 NC_080387.1:50954615-50954627promoter 内 163-175 bp + 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 50948363-50950789(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr01G006078 Chr01 NC_080387.1:76230841-76230853promoter 内 116-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 76221765-76226968(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr01G003378 Chr01 NC_080387.1:52466348-52466360promoter 内 92-104 bp + 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 52457879-52462451(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr05G001844 Chr05 NC_080391.1:18482480-18482492promoter 内 3980-3992 bp + 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 18480474-18482471(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr03G000848 Chr03 NC_080389.1:9756408-9756420promoter 内 3979-3991 bp - 10 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9663105-9756398(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCCAA
SmilChr03G000781 Chr03 NC_080389.1:8899608-8899620promoter 内 3970-3982 bp - 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8891005-8899589(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCCAA
SmilChr01G004478 Chr01 NC_080387.1:62884156-62884168promoter 内 3919-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 62878340-62884086(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTTAA
SmilChr02G004353 Chr02 NC_080388.1:65800971-65800983promoter 内 3902-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 65796321-65800884(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTTAA
SmilChr04G002818 Chr04 NC_080390.1:44230840-44230852promoter 内 3795-3807 bp - 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 44231046-44233744(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr05G001454 Chr05 NC_080391.1:13286716-13286728promoter 内 3743-3755 bp + 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13284606-13286470(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTGAGTAGGTACG
SmilChr04G001694 Chr04 NC_080390.1:27992727-27992739promoter 内 3665-3677 bp + 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 27991460-27992403(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr02G002743 Chr02 NC_080388.1:47416381-47416393promoter 内 3647-3659 bp - 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 47416735-47417279(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGCAAA
SmilChr01G001849 Chr01 NC_080387.1:33423710-33423722promoter 内 3633-3645 bp - 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 33424078-33425991(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAAGTAGGTATA
SmilChr05G001809 Chr05 NC_080391.1:17872052-17872064promoter 内 3624-3636 bp + 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 17872429-17874691(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAACCTACCTGA
SmilChr04G002632 Chr04 NC_080390.1:41728419-41728431promoter 内 3622-3634 bp - 367 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41728798-41730700(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAAGTAGGTATA
SmilChr02G002730 Chr02 NC_080388.1:47215167-47215179promoter 内 3595-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 47212111-47214773(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr03G003147 Chr03 NC_080389.1:48777203-48777215promoter 内 3455-3467 bp - 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 48777749-48779189(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAAGTAGGTATA
SmilChr04G001120 Chr04 NC_080390.1:16254742-16254754promoter 内 3216-3228 bp + 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16252777-16253969(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTATG
SmilChr01G000082 Chr01 NC_080387.1:1519259-1519271promoter 内 3193-3205 bp - 796 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1520067-1520775(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr04G001021 Chr04 NC_080390.1:14304419-14304431promoter 内 3118-3130 bp - 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14305302-14306364(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTATG
SmilChr05G001455 Chr05 NC_080391.1:13286716-13286728promoter 内 3098-3110 bp + 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13287619-13292532(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACTCAG
SmilChr05G000937 Chr05 NC_080391.1:7551137-7551149promoter 内 3090-3102 bp + 899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 7548860-7550238(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr03G000857 Chr03 NC_080389.1:9797526-9797538promoter 内 3068-3080 bp - 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9789202-9796605(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCCAA
SmilChr03G000064 Chr03 NC_080389.1:727975-727987promoter 内 3036-3048 bp - 953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 725468-727022(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr03G000059 Chr03 NC_080389.1:627576-627588promoter 内 3030-3042 bp - 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 624084-626617(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr03G003045 Chr03 NC_080389.1:47343079-47343091promoter 内 2999-3011 bp - 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 47344081-47345076(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTAGTAGGTACA
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SmilChr01G000975 Chr01 NC_080387.1:20605144-20605156promoter 内 2807-2819 bp + 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20601292-20603962(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAGGTAGGTTAA
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SmilChr04G001011 Chr04 NC_080390.1:14102344-14102356promoter 内 2645-2657 bp + 1344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14099664-14101000(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTTAA
SmilChr04G000996 Chr04 NC_080390.1:13790006-13790018promoter 内 2629-2641 bp + 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13787298-13788646(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTTAA
SmilChr04G002817 Chr04 NC_080390.1:44230840-44230852promoter 内 2446-2458 bp - 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 44228394-44229297(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr03G000065 Chr03 NC_080389.1:727975-727987promoter 内 2445-2457 bp - 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 729531-824790(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr03G002856 Chr03 NC_080389.1:45142755-45142767promoter 内 2426-2438 bp + 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45135911-45141192(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGGAGGTAAA