转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 85 / 149 下载 TSV

上一页 85 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001421 Chr03 NC_080389.1:16828634-16828644promoter 内 45-55 bp - 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 16832590-16834140(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr03G003231 Chr03 NC_080389.1:50066415-50066425promoter 内 40-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 50070376-50072904(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr05G002233 Chr05 NC_080391.1:23900869-23900879promoter 内 38-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 23904832-23905404(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGA
SmilChr05G001794 Chr05 NC_080391.1:17661673-17661683promoter 内 18-28 bp + 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 17665656-17715627(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAG
SmilChr03G004200 Chr03 NC_080389.1:60632672-60632682promoter 内 3960-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 60630235-60632641(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAC
SmilChr06G002782 Chr06 NC_080392.1:40501011-40501021promoter 内 3919-3929 bp + 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 40501093-40503339(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr06G001096 Chr06 NC_080392.1:10969161-10969171promoter 内 3915-3925 bp - 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 10964983-10969085(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCC
SmilChr07G001118 Chr07 NC_080393.1:8288409-8288419promoter 内 3901-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 8288509-8288580(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAA
SmilChr01G001128 Chr01 NC_080387.1:22887982-22887992promoter 内 3895-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 22887781-22887886(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G002543 Chr01 NC_080387.1:43505053-43505063promoter 内 3895-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 43504852-43504957(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr03G002052 Chr03 NC_080389.1:31099264-31099274promoter 内 3895-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31099063-31099168(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr03G002507 Chr03 NC_080389.1:39915928-39915938promoter 内 3895-3905 bp + 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 39916034-39916139(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr05G003684 Chr05 NC_080391.1:49972464-49972474promoter 内 3895-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 49972262-49972368(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCC
SmilChr06G002128 Chr06 NC_080392.1:28623718-28623728promoter 内 3895-3905 bp + 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 28623824-28623930(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCC
SmilChr04G001014 Chr04 NC_080390.1:14126778-14126788promoter 内 3868-3878 bp - 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14126911-14128089(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr02G001246 Chr02 NC_080388.1:22900545-22900555promoter 内 3855-3865 bp + 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 22897350-22900409(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr01G000768 Chr01 NC_080387.1:16812727-16812737promoter 内 3843-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 16812885-16820170(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr01G000981 Chr01 NC_080387.1:20789555-20789565promoter 内 3843-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 20789713-20791896(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr01G001335 Chr01 NC_080387.1:26537670-26537680promoter 内 3843-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 26537828-26539671(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr02G001121 Chr02 NC_080388.1:20209048-20209058promoter 内 3843-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 20206755-20208900(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G002020 Chr03 NC_080389.1:30226451-30226461promoter 内 3843-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 30224158-30226303(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr04G002944 Chr04 NC_080390.1:45754575-45754585promoter 内 3843-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45752997-45754427(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G000665 Chr03 NC_080389.1:7445428-7445438promoter 内 3814-3824 bp - 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7444379-7445251(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr02G001078 Chr02 NC_080388.1:19323826-19323836promoter 内 3791-3801 bp - 200 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 19324036-19325001(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGG
SmilChr05G000851 Chr05 NC_080391.1:6711657-6711667promoter 内 3769-3779 bp - 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 6711889-6720735(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr01G003939 Chr01 NC_080387.1:57724284-57724294promoter 内 3699-3709 bp - 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 57724586-57724936(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAC
SmilChr04G000278 Chr04 NC_080390.1:2547743-2547753promoter 内 3683-3693 bp - 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 2548061-2548459(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr05G003416 Chr05 NC_080391.1:45387143-45387153promoter 内 3683-3693 bp + 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45380944-45386835(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr06G002421 Chr06 NC_080392.1:34966257-34966267promoter 内 3649-3659 bp + 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 34965148-34965915(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr01G000361 Chr01 NC_080387.1:7425878-7425888promoter 内 3633-3643 bp - 358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7426246-7428349(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G002756 Chr03 NC_080389.1:43812778-43812788promoter 内 3626-3636 bp - 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 43808536-43812413(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCA
SmilChr01G003234 Chr01 NC_080387.1:51100027-51100037promoter 内 3625-3635 bp + 366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 51098630-51099661(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr03G002742 Chr03 NC_080389.1:43586073-43586083promoter 内 3621-3631 bp - 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 43580843-43585703(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCA
SmilChr04G004013 Chr04 NC_080390.1:55424739-55424749promoter 内 3591-3601 bp + 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 55425149-55427025(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr05G000175 Chr05 NC_080391.1:1380300-1380310promoter 内 3556-3566 bp - 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1376826-1379865(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCC
SmilChr06G002798 Chr06 NC_080392.1:40680942-40680952promoter 内 3479-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 40679069-40680430(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr02G005408 Chr02 NC_080388.1:74591671-74591681promoter 内 3477-3487 bp - 514 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 74592195-74595504(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr01G002120 Chr01 NC_080387.1:37220164-37220174promoter 内 3448-3458 bp - 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37220717-37221475(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAC
SmilChr06G002781 Chr06 NC_080392.1:40501011-40501021promoter 内 3414-3424 bp + 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 40499076-40500434(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr02G003097 Chr02 NC_080388.1:51842295-51842305promoter 内 3407-3417 bp + 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 51832350-51841711(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAA
SmilChr06G001527 Chr06 NC_080392.1:16490068-16490078promoter 内 3402-3412 bp - 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 16490667-16491985(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr01G002734 Chr01 NC_080387.1:45692212-45692222promoter 内 3383-3393 bp - 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45692830-45692988(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr04G001176 Chr04 NC_080390.1:17736574-17736584promoter 内 3341-3351 bp + 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 17733441-17735924(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGG
SmilChr02G003096 Chr02 NC_080388.1:51832899-51832909promoter 内 3317-3327 bp - 674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 51829447-51832225(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr01G000840 Chr01 NC_080387.1:18158296-18158306promoter 内 3267-3277 bp + 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 18156130-18157572(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr02G000410 Chr02 NC_080388.1:5155097-5155107promoter 内 3267-3277 bp - 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 5155831-5158826(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr05G002985 Chr05 NC_080391.1:36399754-36399764promoter 内 3255-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 36400500-36402530(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr04G001016 Chr04 NC_080390.1:14144003-14144013promoter 内 3252-3262 bp - 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14144752-14146774(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr05G001621 Chr05 NC_080391.1:14997812-14997822promoter 内 3252-3262 bp - 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14998561-15002980(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr02G002944 Chr02 NC_080388.1:49957057-49957067promoter 内 3249-3259 bp + 742 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 49949392-49956315(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT